Expressão gênica diferencial em cana-de-açúcar em resposta ao ataque de cigarrinha-das-raízes
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Data
2013-02-18
Autores
Lopes, Lúcia [UNESP]
Título da Revista
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Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Resumo
Atualmente, a cana-de-açúcar (Saccharum spp.) tem sido ameaçada pela infestação por cigarrinha-das-raízes (Mahanarva fimbriolata) e a preocupação com efeitos danosos por ela ocasionados são crescentes, especialmente em função do aumento de condições ambientais favoráveis ao desenvolvimento dessa praga, devido ao sistema de colheita em expansão, em que não há a queima da palhada. A fim de identificar Fragmentos Diferencialmente Expressos (FDE) em raízes de cana-de-açúcar infestadas por ninfas de cigarrinha, foi realizada a técnica de cDNA-AFLP. Assim, foram cultivadas e posteriormente infestadas, plantas de uma variedade suscetível (SP80-1816) e de uma variedade resistente (“menos infestada”) (SP83-5073). As amostras das raízes foram coletadas e congeladas a cada 1, 2, 7 e 14 dias de infestação. A posterior análise através da técnica de cDNA-AFLP, a partir de 3 combinações de oligonucleotídeos, permitiu observar 21 FDE, os quais foram sequenciados e revelaram similaridades com proteínas envolvidas em diferentes atividades, como a transposição de DNA, o transporte de aminoácidos e a transcrição gênica, além de outras proteínas sem similaridade encontrada. Os alinhamentos apresentaram similaridades para os genes expressos e é possível considerar que o caráter de resistência esteja relacionado a uma ação conjunta de diversos genes, além disso, alguns dos FDE obtidos não apresentam similaridades e podem exercer importante papel no mecanismo de resistência.
Currently, the sugarcane (Saccharum spp.) has been threatened by the infestation of froghopper (Mahanarva fimbriolata) and the concern about the harmful effects caused by it are growing, especially due to the increase of environmental conditions favorable the development of this pest, due to the expanding harvest system, in which there is no burning of stubble. In order to identify Differentiall Fragments Expression (FDE) in roots of sugarcane infested by froghopper nymphs was performed cDNA-AFLP technique. Thus, were grown and subsequently infested plants of a susceptible variety (SP80-1816) and a resistant variety (least infested) (SP83-5073). Samples of roots were collected and frozen every 1, 2, 7 and 14 days of infestation. The subsequent analysis by cDNA-AFLP technique from three combinations of primers allowed the observation FDE 21 which were sequenced and revealed similarities to proteins involved in various activities, such as transposition of DNA, amino acid transport and gene transcription, in addition to other proteins without similarity found. The alignments showed similarities to genes expressed and it is possible to consider the character of resistance is related to a joint action of several genes, in addition, some of the FDE obtained do not show similarities and may have an important role in the mechanism of resistance.
Currently, the sugarcane (Saccharum spp.) has been threatened by the infestation of froghopper (Mahanarva fimbriolata) and the concern about the harmful effects caused by it are growing, especially due to the increase of environmental conditions favorable the development of this pest, due to the expanding harvest system, in which there is no burning of stubble. In order to identify Differentiall Fragments Expression (FDE) in roots of sugarcane infested by froghopper nymphs was performed cDNA-AFLP technique. Thus, were grown and subsequently infested plants of a susceptible variety (SP80-1816) and a resistant variety (least infested) (SP83-5073). Samples of roots were collected and frozen every 1, 2, 7 and 14 days of infestation. The subsequent analysis by cDNA-AFLP technique from three combinations of primers allowed the observation FDE 21 which were sequenced and revealed similarities to proteins involved in various activities, such as transposition of DNA, amino acid transport and gene transcription, in addition to other proteins without similarity found. The alignments showed similarities to genes expressed and it is possible to consider the character of resistance is related to a joint action of several genes, in addition, some of the FDE obtained do not show similarities and may have an important role in the mechanism of resistance.
Descrição
Palavras-chave
Expressão gênica, Cana-de-açúcar, Cigarrinha (Inseto), Gene expression
Como citar
LOPES, Lúcia. Expressão gênica diferencial em cana-de-açúcar em resposta ao ataque de cigarrinha-das-raízes. 2013. iv, 48 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, 2013.