MicroRNoma do carcinoma de pâncreas
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Data
2016-01-22
Autores
Felix, Tainara Francini [UNESP]
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Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Resumo
Background: Genetic alterations were previously identified and associated with the development and progression of pancreatic carcinoma, however, identification of such alterations has not been currently used for the development of efficient treatment strategies. Therefore, the identification of other genetic and epigenetic changes, such as alterations in non-coding RNA molecules is urgently needed for the development of novel therapies. Recent studies have suggested that microRNAs (miRNAs) are frequently deregulated in several carcinomas and may contribute in the several steps of development and tumor progression. Global miRNA profiling analysis in pancreatic carcinoma and the identification of miRNA target genes may lead to new avenues for the identification of clinically applicable biomarkers. Objectives: To identify global microRNA (miRNA) expression profiles and miRNA predicted target genes in pancreatic carcinoma. Patients and Methods: 30 formalin fixed, paraffin embedded (FFPE) pancreatic carcinoma tissue samples were used, including 24 pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and 6 adenocarcinomas of Vater papilla (AMP) and their paired histologically adjacent normal tissues. Global miRNA expression profiles were determined using the TaqMan Array Human MicroRNA Cards (TLDA) (card A, v3.0) (Life Technologies) platform. Data analysis used the ExpressionSuite Software v1.0.3. Statistical analysis was performed to correlate miRNA expression with relevant clinical data, using SAS 9.3 software. Computational bioinformatic analysis was performed to identify predicted miRNA target genes, as well as protein-protein interaction networks and miRNA-mRNA molecular pathways. Results: We identified 63 significantly deregulated (significantly deregulated is herein defined as FC≥2 and p<0.05) miRNAs in PDAC (33 over-expressed and 30 under-expressed) compared to paired histologically normal pancreatic tissue. In AMP, a group of 7 miRNAs was significantly deregulated (4 over-expressed and 3 under-expressed) compared to normal. Our results showed a complexity of miRNAs changes potentially associated to PDAC tumorigenesis. Interestingly, 3/7 miRNAs were commonly deregulated in PDAC and AMP tumors. Discussion: Global miRNA expression profiles identified in PDAC and AMP showed that PDAC have a significantly higher number of altered miRNAs and consequently, a higher number of predicted miRNA target genes than AMP, which could be potentially associated to disease progression and tumor aggressiveness in PDAC compared to AMP. Commonly deregulated miRNAs in PDAC and AMP suggest that common molecular pathways may be deregulated in these two histological subtypes of pancreatic carcinoma. Among the miRNAs exclusively deregulated in PDAC, we identified several predicted miRNA target genes associated to tumor invasion and metastasis and poor prognosis of patients with cancer. Conclusion: miRNAs identified herein may be associated to the biology of PDAC and AMP. Functional validation studies are required to elucidate the role of miRNAs as modulators of oncogenesis mechanisms in PDAC and AMP.
Introdução: Alterações genéticas foram previamente identificadas e associadas ao desenvolvimento e progressão dos carcinomas pancreáticos, entretanto, o conhecimento dessas alterações não resultou, até o momento, no desenvolvimento de tratamentos eficazes para os pacientes com essas neoplasias. Sendo assim, torna-se necessária e justificada a identificação de outras alterações, tais como alterações em moléculas reguladoras da expressão gênica, as quais têm o potencial de levar ao delineamento de novas terapias. Estudos recentes têm sugerido que os microRNAs (miRNAs) estão frequentemente desregulados em diversos carcinomas, e podem contribuir em várias etapas do desenvolvimento e progressão tumoral. A análise do perfil de expressão de miRNAs em carcinomas de pâncreas e genes regulados por estes miRNAs, deve fornecer novas direções para a identificação de biomarcadores que possam ser úteis na prática clínica. Objetivos: Identificar perfis globais de expressão de microRNAs (miRNAs) e potenciais genes-alvo regulados por miRNAs em carcinomas de pâncreas. Pacientes e Métodos: Foram incluídas 30 amostras de tecido, fixadas em formalina e emblocadas em parafina (FFPE) de carcinoma de pâncreas, sendo 24 adenocarcinomas de ductos pancreáticos (PDAC) e 6 adenocarcinomas de papila de Vater (AMP) e os tecidos histologicamente normais, adjacentes ao tumor, correspondentes a cada caso. O perfil de expressão de miRNAs das amostras tumorais foi determinado utilizando o ensaio TaqMan Array Human MicroRNA Cards (TLDA) (card A, v3.0) (Life Technologies). A análise dos dados utilizou o programa ExpressionSuite Software v1.0.3. A análise estatística dos dados de expressão de miRNAs e dados clínico-anatomopatológicos utilizou o programa SAS 9.3. Análises computacionais utilizando algorítimos de bioinformática foram realizadas com o objetivo de identificar genes-alvo regulados por miRNAs, bem como redes de interação protéica e vias moleculares envolvendo genes e miRNAs. Resultados: Foram identificados 63 miRNAs desregulados em PDAC, sendo 33 com expressão aumentada e 30 com expressão diminuída, quando comparado com tecido histologicamente normal adjacente ao tumor. Nos carcinomas AMP, um grupo de 7 miRNAs estavam desregulados, sendo 4 com expressão aumentada e 3 com expressão diminuída. Nossos resultados indicam uma complexidade de alterações associadas à tumorigênese dos adenocarcinomas ductais pancreáticos, devido ao grande número de miRNAs e genes-alvo desregulados nesses tumores. Interessantemente, 3/7 miRNAs identificados como desregulados em carcinomas AMP estão comumente alterados nos PDAC. Discussão: O perfil de expressão global de miRNAs identificado em PDAC e carcinomas AMP revelou que os PDACs apresentam um número significativamente maior de miRNAs desregulados, o que pode estar diretamente associado a um maior grau de progressão e maior agressividade tumoral comparado com os carcinomas AMP. A identificação de 3 miRNAs comumente alterados em PDAC e carcinomas AMP sugere que vias moleculares comuns podem estar desreguladas nesses subtipos histológicos tumorais. Dentre os miRNAs alterados exclusivamente nos PDACs, identificamos que esses regulam vários genes associados à invasão tecidual, metástase e pior prognóstico de pacientes com câncer. Conclusão: Os miRNAs identificados estão potencialmente associados à biologia tumoral dos PDAC e carcinomas AMP. Estudos de validação funcional são necessários para elucidar o papel dos miRNAs como moduladores de mecanismos de oncogênese em PDAC e carcinomas AMP.
Introdução: Alterações genéticas foram previamente identificadas e associadas ao desenvolvimento e progressão dos carcinomas pancreáticos, entretanto, o conhecimento dessas alterações não resultou, até o momento, no desenvolvimento de tratamentos eficazes para os pacientes com essas neoplasias. Sendo assim, torna-se necessária e justificada a identificação de outras alterações, tais como alterações em moléculas reguladoras da expressão gênica, as quais têm o potencial de levar ao delineamento de novas terapias. Estudos recentes têm sugerido que os microRNAs (miRNAs) estão frequentemente desregulados em diversos carcinomas, e podem contribuir em várias etapas do desenvolvimento e progressão tumoral. A análise do perfil de expressão de miRNAs em carcinomas de pâncreas e genes regulados por estes miRNAs, deve fornecer novas direções para a identificação de biomarcadores que possam ser úteis na prática clínica. Objetivos: Identificar perfis globais de expressão de microRNAs (miRNAs) e potenciais genes-alvo regulados por miRNAs em carcinomas de pâncreas. Pacientes e Métodos: Foram incluídas 30 amostras de tecido, fixadas em formalina e emblocadas em parafina (FFPE) de carcinoma de pâncreas, sendo 24 adenocarcinomas de ductos pancreáticos (PDAC) e 6 adenocarcinomas de papila de Vater (AMP) e os tecidos histologicamente normais, adjacentes ao tumor, correspondentes a cada caso. O perfil de expressão de miRNAs das amostras tumorais foi determinado utilizando o ensaio TaqMan Array Human MicroRNA Cards (TLDA) (card A, v3.0) (Life Technologies). A análise dos dados utilizou o programa ExpressionSuite Software v1.0.3. A análise estatística dos dados de expressão de miRNAs e dados clínico-anatomopatológicos utilizou o programa SAS 9.3. Análises computacionais utilizando algorítimos de bioinformática foram realizadas com o objetivo de identificar genes-alvo regulados por miRNAs, bem como redes de interação protéica e vias moleculares envolvendo genes e miRNAs. Resultados: Foram identificados 63 miRNAs desregulados em PDAC, sendo 33 com expressão aumentada e 30 com expressão diminuída, quando comparado com tecido histologicamente normal adjacente ao tumor. Nos carcinomas AMP, um grupo de 7 miRNAs estavam desregulados, sendo 4 com expressão aumentada e 3 com expressão diminuída. Nossos resultados indicam uma complexidade de alterações associadas à tumorigênese dos adenocarcinomas ductais pancreáticos, devido ao grande número de miRNAs e genes-alvo desregulados nesses tumores. Interessantemente, 3/7 miRNAs identificados como desregulados em carcinomas AMP estão comumente alterados nos PDAC. Discussão: O perfil de expressão global de miRNAs identificado em PDAC e carcinomas AMP revelou que os PDACs apresentam um número significativamente maior de miRNAs desregulados, o que pode estar diretamente associado a um maior grau de progressão e maior agressividade tumoral comparado com os carcinomas AMP. A identificação de 3 miRNAs comumente alterados em PDAC e carcinomas AMP sugere que vias moleculares comuns podem estar desreguladas nesses subtipos histológicos tumorais. Dentre os miRNAs alterados exclusivamente nos PDACs, identificamos que esses regulam vários genes associados à invasão tecidual, metástase e pior prognóstico de pacientes com câncer. Conclusão: Os miRNAs identificados estão potencialmente associados à biologia tumoral dos PDAC e carcinomas AMP. Estudos de validação funcional são necessários para elucidar o papel dos miRNAs como moduladores de mecanismos de oncogênese em PDAC e carcinomas AMP.
Descrição
Palavras-chave
MicroRNA, Carcinoma de pancreas