Criação de um algoritmo para organização hierárquica de elementos interagentes: uma aplicação em redes proteicas, pequenas moléculas e miRNAs
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Data
2014-06-02
Autores
Molan, André Luiz [UNESP]
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Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Resumo
A decodificação do Genoma significou um grande passo para o entendimento do funcionamento celular. Inúmeros experimentos de interações proteicas passaram a ser realizados e uma quantidade enorme de dados foi e ainda é gerado. Para tanto, organizações públicas se uniram e criaram bancos de dados como o EMBL (European Molecular Biology Laboratory) e o NIH (National Institute of Health). Contudo, a forma como os dados estão organizados em tais repositórios pode, eventualmente, não favorecer a extração de informações úteis a um determinado estudo. Posto isso, faz-se necessário o desenvolvimento de ferramentas que sejam capazes de reorganizar as listagens iniciais, facilitando o trabalho do pesquisador no que se refere à identificação e compreensão de processos biológicos. Existe, atualmente, um método que agrupa genes em uma lista de maneira que a probabilidade de interação entre dois deles é inversamente proporcional à distância em que estes se encontram na lista. Com base neste conceito, desenvolvemos um algoritmo que reorganiza hierarquicamente um dado conjunto de interações, dispondo-o em uma matriz de adjacência simétrica de modo que ocorra a formação de clusters em torno da diagonal principal desta
Descrição
Palavras-chave
Banco de dados, Analise multivariada, Análise por agrupamento, Seqüenciamento de nucleotídeo, Algoritmos de computador, Computer algorithms, Nucleotide sequence
Como citar
MOLAN, André Luiz. Criação de um algoritmo para organização hierárquica de elementos interagentes: uma aplicação em redes proteicas, pequenas moléculas e miRNAs. 2014. 1 CD-ROM. Trabalho de conclusão de curso (bacharelado - Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.