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dc.contributor.advisorLinde, Sandra Aparecida Drigo [UNESP]
dc.contributor.advisorMarchi, Fábio Albuquerque [UNESP]
dc.contributor.authorMinutentag, Iael Weissberg
dc.date.accessioned2019-02-26T13:21:59Z
dc.date.available2019-02-26T13:21:59Z
dc.date.issued2019-01-29
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/180847
dc.description.abstractIntrodução: Apesar dos avanços no tratamento, cerca da metade dos pacientes com câncer de reto (CR) desenvolverá metástase à distância. No entanto, as vias biológicas envolvidas na progressão do câncer não são totalmente conhecidas. Neste estudo, investigamos os perfis moleculares e imunológicos em adenocarcinomas de reto relacionados à progressão metastática visando identificar biomarcadores moleculares e/ou alvos terapêuticos. Pacientes e Métodos: O transcritoma de 15 tecidos de CR metastático (M) e não-metastático (NM) pré-tratamento e de duas amostras de tecido de reto normais foi avaliado utilizando a plataforma Clariom D. Os genes foram considerados diferencialmente expressos quando a alteração de expressão era maior que 2 vezes e o valor de p <0,05 e detectados com o pacote limma. As funções moleculares e vias biológicas foram determinadas com a ferramenta Enricher. Os achados foram validados utilizando dados do TCGA e o perfil imunológico determinado com o algorótimo xCell. Resultados: A comparação entre os grupos M e NM revelou 52 genes diferencialmente expressos, sendo 27 regulados positivamente e 25 regulados negativamente. O gene ANLN foi detectado com o maior valor de fold change nos tumores metastáticos. Além disso, expressão aumentada de ANLN foi associada com menor sobrevida em pacientes com CR. A via do fator de crescimento endotelial vascular (VEGF) foi detectada como alterada nos tumores M. Validação dos resultados com dados do TCGA confirmou o gene ANLN como associado aos tumores do grupo M. Além disso, os genes KIF14, XRCC2 e GPX3, que possuem importantes funções na carcinogênese, também foram detectados. As populações de células imunes infiltrantes identificadas como mais significativas nos tumores M foram células dendríticas plasmocitóides (pDC), T-helper 2 (Th2) acompanhadas de diminuição das células T reguladoras (Treg), que podem desempenhar um papel na evasão imune do câncer, favorecendo a progressão da doença. Conclusões: Os perfis transcriptômico e imunológico aqui identificados revelaram potenciais marcadores moleculares e alvos para terapia que podem ser úteis para a medicina de precisão em pacientes com adenocarcinomas de retopt
dc.description.abstractIntroduction: Despite advances in treatment, about half of patients with rectal cancer (RC) will develop distant metastasis. However, the biological pathways underpinning the cancer progression are not fully understood. In this study, we sought to identify molecular and immunological profiles in rectal adenocarcinomas related to metastatic progression aiming to identify molecular biomarkers and/or therapeutic targets. Patients and Methods: Transcriptome analysis of 15 pre-treatment metastatic (M) and non-metastatic (NM) rectal cancer tissues and two normal rectal tissue samples was evaluated using Clariom D platform. Genes were considered differentially expressed when presenting 2-fold change and p<0.05 and were obtained with limma package . Molecular function and biological pathways with the Enricher package. Our findings were validated from the TCGA database and the immunological profile was determined using the xCell algorithm. Results: The comparison of M with NM groups revealed 52 differentially expressed genes, being 27 up-regulated and 25 down-regulated. ANLN gene was detected as the top gene upregulated in M tumours. Additionally, ANLN overexpression was associated with shorter survival in RC patients. Vascular endothelial growth factor (VEGF) pathway was detected as altered in M tumours. Cross-study validation with TCGA dataset confirmed ANLN gene as associated with M tumours. Furthermore, KIF14, XRCC2 and GPX3 genes, which have important carcinogenesis functions, were also detected. The most significant infiltrating immune cell populations in M tumours were plasmacytoid dendritic cells (pDCc), T-helper 2 (Th2) that together with diminishment of T regulatory (Treg) cells, can play a role in cancer immune evasion leading to disease progression. Conclusions: The transcriptomic and immunological profiles identified here revealed potential molecular markers and targets for therapy which can be useful for precision medicine in patients with rectal adenocarcinomas.en
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (UNESP)
dc.subjectMetástasept
dc.subjectMetastasispt
dc.subjectAdenocarcinoma de retopt
dc.subjectProgressão tumoralpt
dc.subjectCélulas imunespt
dc.subjectRectal adenocarcinomaen
dc.subjectTumour progressionen
dc.subjectImmune profileen
dc.titleIdentificação de alterações no transcritoma associadas à progressão metastática em adenocarcinoma de retopt
dc.title.alternativeIdentification of transcriptome alterations associated to metastatic progression in rectal adenocarcinomaen
dc.typeDissertação de mestrado
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (UNESP)
dc.rights.accessRightsAcesso restrito
unesp.graduateProgramBases Gerais da Cirurgia - FMBpt
unesp.knowledgeAreaGenéticapt
unesp.researchAreaBiomarcadores diagnósticos, prognósticos e preditivos na pesquisa translacionalpt
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Medicina, Botucatupt
unesp.embargo24 meses após a data da defesapt
dc.identifier.aleph000913254
dc.identifier.capes33004064006P8
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