Variabilidade genética de Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum acutatum em seringueira (Hevea brasiliensis) no Brasil
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Data
2014-02-07
Autores
Sierra Hayer, Juan Fernan [UNESP]
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Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Resumo
The rubber tree [Hevea brasiliensis (Wild. ex Adr. Than Juss. ) Muell - Arg] is the largest source of natural rubber, widely cultivated, and of great commercial importance due to its high production capacity. Currently the rubber trees are being attacked for various diseases, causing huge economic losses. Among them, the anthracnose, caused by Colletotrichum gloeosporioides and Colletotrichum acutatum, is in all rubber crops places of the world. These fungi causes various damage, such as injuries on leaves, branches, fruits, as well as cankers in the taping panel. Given this situation, and the high incidence of this pathogen in the rubber crop, this study aimed to identify the genetic variability of the isolates of C. gloeosporioides and C. acutatum associated to rubber crop. Phylogenetic and population tools were performed to determine the distribution and frequency of each possible haplotypes. The 79 samples collected in the field were amplified by PCR by specific primers of the ITS spacers regions and the 18S, 28S and 5.8 S genes. Subsequently, the amplified regions were sequenced by the Sanger method. Several sequences available in NCBI were added, to complement the analysis, totaling a data matrix of 263 samples. Phylogenetic analyses generated by Bayesian, Maximum Likelihood and Neighbour -Joining methods, showed the division of the C. acutatum and C. gloeosporioides groups, enabling the separation of the matrix in two specific species. The population analysis showed some very common haplotypes distributed around the world, as well as another haplotypes with very restricted distribution, such as H1 haplotype of ...
A seringueira [Hevea brasiliensis (Wild. ex Adr. de Juss.) Muell-Arg] é a maior fonte de borracha natural, amplamente cultivada, e de grande importância comercial devido a sua alta capacidade produtiva. Atualmente ela vem sendo atacada por várias doenças que causam enormes prejuízos econômicos. Dentre essas a antracnose, causada pelos fungos Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum acutatum, está presente em todos os lugares heveícolas do mundo. Estes fungos causam vários danos na planta como lesões nos folíolos, nos ponteiros, nos ramos, nos frutos e cancros no painel de sangria. Diante desta situação e da alta incidência destes patógenos na cultura da seringueira, o presente trabalho teve como objetivo identificar a variabilidade genética dos isolados de C. gloeosporioides e C. acutatum associados à seringueira. Ferramentas filogenéticas e populacionais foram utilizados para determinar a distribuição e a frequência de cada um dos possíveis haplótipos. As 79 amostras coletadas em campo foram amplificadas por PCR com primers específicos das regiões espaçadores ITS e dos genes 18S, 28S e 5,8S. Posteriormente as regiões amplificadas foram sequenciadas pelo método Sanger. Para complementar as análises foram adicionadas sequências disponíveis no NCBI, totalizando uma matriz de dados de 263 amostras. As árvores geradas, a partir de análises filogenéticas Bayesiana, Máxima Verossimilhança e Neighbour-Joining, mostraram a divisão dos grupos de C. gloeosporioides e C. acutatum, possibilitando a separação da matriz em duas espécies específicas. As análises ...
A seringueira [Hevea brasiliensis (Wild. ex Adr. de Juss.) Muell-Arg] é a maior fonte de borracha natural, amplamente cultivada, e de grande importância comercial devido a sua alta capacidade produtiva. Atualmente ela vem sendo atacada por várias doenças que causam enormes prejuízos econômicos. Dentre essas a antracnose, causada pelos fungos Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum acutatum, está presente em todos os lugares heveícolas do mundo. Estes fungos causam vários danos na planta como lesões nos folíolos, nos ponteiros, nos ramos, nos frutos e cancros no painel de sangria. Diante desta situação e da alta incidência destes patógenos na cultura da seringueira, o presente trabalho teve como objetivo identificar a variabilidade genética dos isolados de C. gloeosporioides e C. acutatum associados à seringueira. Ferramentas filogenéticas e populacionais foram utilizados para determinar a distribuição e a frequência de cada um dos possíveis haplótipos. As 79 amostras coletadas em campo foram amplificadas por PCR com primers específicos das regiões espaçadores ITS e dos genes 18S, 28S e 5,8S. Posteriormente as regiões amplificadas foram sequenciadas pelo método Sanger. Para complementar as análises foram adicionadas sequências disponíveis no NCBI, totalizando uma matriz de dados de 263 amostras. As árvores geradas, a partir de análises filogenéticas Bayesiana, Máxima Verossimilhança e Neighbour-Joining, mostraram a divisão dos grupos de C. gloeosporioides e C. acutatum, possibilitando a separação da matriz em duas espécies específicas. As análises ...
Descrição
Palavras-chave
Seringueira - Doenças - Brasil, Fungos - Genetica, Borracha, Rubber plants
Como citar
SIERRA HAYER, Juan Fernan. Variabilidade genética de Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum acutatum em seringueira (Hevea brasiliensis) no Brasil. 2014. x, 55 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoFaculdade de Ciências Agronômicas, 2014.