Caracterização genômica do Edema de Reinke

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Data

2017-02-23

Autores

Móz, Luis Eduardo Silva [UNESP]

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Editor

Universidade Estadual Paulista (Unesp)

Resumo

Introdução: o Edema de Reinke (ER) é uma lesão laríngea considerada benigna relacionada ao tabagismo. Dados em literatura relatam associações entre o ER e a detecção de diferentes graus de displasia e carcinoma in situ, bem como alterações na imunoexpressão de proteínas tumorais como a p53. Alguns autores classificam o ER entre as lesões pré-malignas, com risco de transformação e progressão para carcinoma de laringe. Não havendo consenso na literatura, torna-se necessária a realização de estudos moleculares. Objetivos: caracterizar o perfil genômico global de alterações no número de cópias do DNA em amostras de pacientes com ER. Métodos: oito amostras removidas por microcirurgia foram submetidas à extração do DNA. Os perfis de alteração no número de cópias genômicas e os genes candidatos associados foram analisados pela metodologia da hibridação genômica comparativa (CGH array), utilizando-se a plataforma de 4x180K (Agilent Technologies). Os dados de microarranjos foram analisados utilizando o programa CytoGenomics v4.0.2.21 (Agilent Technologies). As alterações no número de cópias (CNAs) obtidas foram comparadas com o banco de dados Database of Genomic Variants (DGV). A classificação dos genes selecionados para análise foi realizada baseada em dados descritos no National Center for Biotechnology Information (NCBI). Resultados: Foram encontrados perdas, ganhos ou deleções em 54 genes, um RNA não codificador longo intergênico (lincRNA), seis sequências hipotéticas e 10 microRNAs, com alterações compartilhadas por pelo menos dois pacientes. Em oito genes, duas sequências hipotéticas e dois lincRNAs foram constatadas alterações raras. Conclusão: Este estudo inédito revela a presença de alterações genômicas no ER. Alguns genes relatados no estudo estão implicados em processos de carcinogênese, inclusive com alterações em regiões cromossômicas semelhantes às descritas em carcinomas de laringe, sinalizando a necessidade de pesquisas adicionais focadas em genes que participam das vias moleculares relacionadas ao desenvolvimento dessa lesão.
Introduction: Reinke's edema is a benign laryngeal lesion related to excessive tobacco smoking. Reinke's edema (RE) has been associated with different degrees of dysplasia and in situ carcinoma, as well as with TP53 protein expression changes. Some authors classify RE among premalignant lesions, considering that these lesions may be prone to malignant transformation and may eventually progress to laryngeal carcinoma, without consensus in the literature. Thus, it is necessary to carry out molecular studies. Objectives: global genomic characterization of DNA copy number alterations (CNAs) in Reinke's edema samples. Methods: eight samples removed by microsurgery were submitted to DNA extraction. We performed global copy number molecular profiling analysis using the Agilent 4x180K array comparative genomic hybridization (aCGH) platform. Data analysis was performed using CytoGenomics software v4.0.2.21 (Agilent Technologies). CNAs were compared against the Database of Genomic Variants (DGV). In addition, genes mapped on regions of copy number gains or losses had their functions annotated using the National Center for Biotechnology Information (NCBI). Results: we were able to identify copy number alterations in fifty-four genes, one intergenic long non-coding RNA (lincRNA), six hypothetical sequences and ten microRNAs, with common alterations shared by at least two patients. In eight genes, two hypothetical sequences and two lincRNAs rare changes were noted. Conclusions: To our knowledge this is the first study in the literature that reveals the presence of genomic changes in RE. Some genes reported in the study are implicated in carcinogenesis processes, including changes in chromosomal regions similar to those described in laryngeal carcinomas indicating the need for additional research focused on genes that participate in molecular pathways related to the development of this lesion.

Descrição

Palavras-chave

Edema de Reinke, Alterações genômicas, CGH array

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