Identificação de Eimeria nagambie, Eimeria zaria e Eimeria spp. geneticamente distintas em sistemas de criação alternativos de galinhas domésticas no estado de São Paulo, Brasil
Data
2023-01-31
Autores
Soares Junior, José Carlos
Título da Revista
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Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Resumo
Coccidiose é o termo usado para a infecção por Eimeria spp. e representa uma das enfermidades de maior importância econômica para a indústria avícola. Apresenta alta prevalência em criações industriais de frangos de corte, onde há uma alta probabilidade de infecção por pelo menos uma espécie de Eimeria. Além das sete espécies de Eimeria já conhecidas, recentemente foram identificadas três novas espécies que parasitam a galinha doméstica: Eimeria lata, Eimeria nagambie e Eimeria zaria, que inicialmente foram denominadas como unidades taxonômicas operacionais (OTU) X, Y e Z, respectivamente. Diante da ausência de estudos atualizados realizados no Brasil referentes a essas novas espécies, o objetivo deste trabalho foi identificar E. lata, E. nagambie e E. zaria em galinhas criadas em sistemas extensivo e semi-intensivo no estado de São Paulo. Foram utilizadas 93 amostras de DNA genômico extraído de fezes de galinhas domésticas de 35 criações semi-intensivas e 58 criações extensivas localizadas em 12 municípios de diversas regiões do Estado de São Paulo. Essas amostras foram classificadas como grupo 1 (G1) e estavam armazenadas por aproximadamente quatro anos. Adicionalmente, foram utilizadas 168 amostras fecais colhidas no ano de 2021 em criações de galinhas domésticas de sistemas extensivos (143) e semi-intensivos (25), classificadas como grupo 2 (G2), em sete municípios do Estado de São Paulo. As amostras do G2 foram submetidas ao exame microscópico direto; aquelas negativas e todas as amostras do G1 foram examinadas por PCR gênero-específica. As amostras positivas para Eimeria spp. foram examinadas por PCR espécieespecífica (E. lata, E. nagambie e E. zaria) seguida de clonagem molecular e sequenciamento genético. Os resultados confirmaram, pela primeira vez em território brasileiro, a presença de E. nagambie (15/79; 18,9%), E. zaria (19/79; 24%) e de novas variantes genéticas relacionadas a E. lata e E. maxima (6/79; 7,6%) em galinhas domésticas.
Coccidiosis is the term used for infection by Eimeria spp. and represents one of the most economically important diseases for the poultry industry. It has a high prevalence in industrial broiler chicken farms, where there is a high probability of infection by at least one species of Eimeria. In addition to the seven species of Eimeria already known, three new species from domestic chicken were recently identified: Eimeria lata, Eimeria nagambie, and Eimeria zaria. Given the lack of updated studies carried out in Brazil regarding these new species, this study aimed to identify E. lata, E. nagambie and E. zaria in chickens reared from extensive and semi-intensive systems in the state of São Paulo. Ninety-three samples of genomic DNA extracted from feces of domestic chickens from 35 semi-intensive and 58 extensive farms located in 12 municipalities in different regions of the State of São Paulo were classified as group 1 (G1) and have been stored at -20°C for approximately four years. Additionally, 168 fecal samples classified as group 2 (G2) were collected in the year 2021 from domestic chickens raised in extensive (143) and semi-intensive (25) systems, in seven municipalities in the State of São Paulo. Samples from G2 were submitted to Eimeria oocyst screening by microscopic examination; those negative and all samples from G1 were examined by genera-specific PCR. Positive samples for Eimeria spp. were examined by species-specific PCR (E. lata, E. nagambie, and E. zaria) followed by molecular cloning and genetic sequencing. The results confirmed, for the first time in Brazilian territory, the presence of E. nagambie (15/79; 18.9%), E. zaria (19/79; 24%) and new genetic variants related to E. lata and E. maxima (6/79; 7.6%) in domestic chickens.
Coccidiosis is the term used for infection by Eimeria spp. and represents one of the most economically important diseases for the poultry industry. It has a high prevalence in industrial broiler chicken farms, where there is a high probability of infection by at least one species of Eimeria. In addition to the seven species of Eimeria already known, three new species from domestic chicken were recently identified: Eimeria lata, Eimeria nagambie, and Eimeria zaria. Given the lack of updated studies carried out in Brazil regarding these new species, this study aimed to identify E. lata, E. nagambie and E. zaria in chickens reared from extensive and semi-intensive systems in the state of São Paulo. Ninety-three samples of genomic DNA extracted from feces of domestic chickens from 35 semi-intensive and 58 extensive farms located in 12 municipalities in different regions of the State of São Paulo were classified as group 1 (G1) and have been stored at -20°C for approximately four years. Additionally, 168 fecal samples classified as group 2 (G2) were collected in the year 2021 from domestic chickens raised in extensive (143) and semi-intensive (25) systems, in seven municipalities in the State of São Paulo. Samples from G2 were submitted to Eimeria oocyst screening by microscopic examination; those negative and all samples from G1 were examined by genera-specific PCR. Positive samples for Eimeria spp. were examined by species-specific PCR (E. lata, E. nagambie, and E. zaria) followed by molecular cloning and genetic sequencing. The results confirmed, for the first time in Brazilian territory, the presence of E. nagambie (15/79; 18.9%), E. zaria (19/79; 24%) and new genetic variants related to E. lata and E. maxima (6/79; 7.6%) in domestic chickens.
Descrição
Palavras-chave
Eimeria spp., Galinha doméstica, Detecção molecular, Brasil, Domestic chicken, Molecular detection, Brazil