Estudo da dinâmica do modelo de Peyrard-Bishop não homogêneo para o DNA

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dc.contributor.advisorRuggiero, José Roberto [UNESP]
dc.contributor.advisorFilho, Elso Drigo [UNESP]
dc.contributor.authorSilva, Joaquim Manoel da [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2014-06-11T19:22:55Z
dc.date.available2014-06-11T19:22:55Z
dc.date.issued2000-02-22
dc.description.abstractUsando o modelo de Peyrard-Bishop [2] exploramos o limiar de energia para existência de localização de energia, assim como a dinâmica de um par de cadeias de osciladores representando o DNA. Em trabalho recente [9], obteve-se o limiar de energia para uma cadeia homogênea. Neste trabalho os resultados para cadeias homogêneas e não homogêneas serão considerados. A não homogeneidade é tratada na forma de blocos com diferentes parâmetros para o potencial de Morse. O potencial de Morse é usado para simular as ligações de hidrogênio que estabilizam a dupla hélice do DNA. Esta é uma primeira aproximação para a molécula real.Os resultados mostram que o valor da energia crítica, a energia mínima para haver localização de energia, é uma função da presença de interfaces entre os blocos e a dinâmica revela que essa localização se restringe ao bloco inicialmente excitado.pt
dc.description.abstractUsing the Peyrard-Bishop model [2] we explore the threshold energy for energy localization as well as the dynamics of a DNA chain. In a recent work [9], the threshold energy for localization in homogeneous chain have been obtained. Here results for homogeneous and nonhomogeneous chains are considered. This nonhomogeneity is treated as blocks with different values for the parameters in the Morse Potential, the usually used potential function for simulating the Hbonds in the DNA double helix. This is a suitable first approximation for the real molecule. The results show the threshold energy depends on the presence of block interfaces and the dynamics shows that localization is restricted to the block initially excited.en
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
dc.format.extent69 f. : il.
dc.identifier.aleph000464385
dc.identifier.capes33004153068P9
dc.identifier.citationSILVA, Joaquim Manoel da. Estudo da dinâmica do modelo de Peyrard-Bishop não homogêneo para o DNA. 2006. 69 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2006.
dc.identifier.filesilva_jm_me_sjrp.pdf
dc.identifier.lattes3277957413291567
dc.identifier.orcid0000-0001-6536-4153
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/87531
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceAleph
dc.subjectBiologia molecularpt
dc.subjectDNApt
dc.subjectBiofísica molecularpt
dc.subjectDNA - Modelos dinâmicospt
dc.titleEstudo da dinâmica do modelo de Peyrard-Bishop não homogêneo para o DNApt
dc.typeDissertação de mestrado
unesp.advisor.lattes3277957413291567[2]
unesp.advisor.orcid0000-0001-6536-4153[2]
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Pretopt
unesp.graduateProgramBiofísica Molecular - IBILCEpt
unesp.knowledgeAreaBiofísica molecularpt

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