Análise da expressão gênica de pequenos RNAs derivados de tRNAs (tRFs) em plantas

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dc.contributor.advisorNogueira, Fábio Tebaldi Silveira [UNESP]
dc.contributor.advisorAlves, Cristiane de Santis [UNESP]
dc.contributor.authorPinoti, Vitor Favaretto [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2015-03-23T15:27:33Z
dc.date.available2015-03-23T15:27:33Z
dc.date.issued2012
dc.description.abstractSmall non coding RNAs emerged as important characters in several biology aspects. Among then, the most studied are microRNAs (miRNAs) and short interfering RNAs (siRNAs), that regulate their target gene post-transcriptionally in plants, animals and RNAi pathway intermediates, respectively. Both of classes have similar biogenesis being processed by Dicer enzymes and subsequent association with Argonaute enzymes. In plants, miRNAs and siRNAs have important functions in development, genome integrity and biotic and abiotic stress responses. The advances in high-throughtput sequencing and in silico analisys provide the uncover of new small non coding RNAs classes, many of them with unknown functions and biogenesis. tRNA derived small RNAs (tRFs) are a small non coding RNA class, that have as precursor a tRNA molecule. These were uncovers in the last decade in many organisms and, recently, in plants. Recent works detected tRFs from different sizes, with different source portions of the mature tRNA molecule (5’ end; 3’ end, anti-codon loop) and some from the tRNA precursor (pre-tRNA), suggesting that may be a novel class of small RNA and not random degradation products. Works in humans showed that some tRFs are processed by the Dicer enzymes, have association with the Argonaute enzymes and cell differentiation, tumor appearance and gene silencing related functions. Works in Arabidopsis and pumpkin (Cucurbita maxima) showed, respectively, that the tRFs have nutritional stress response possible functions and long distance signaling function between source and drain tissues, and may affect the translation. The tRFs biogenesis in plants are, until now an unknown, absence information about it in the literature and its possible biological functions are few studied yet, making then interesting target for studies among the small non coding RNAs in plantsen
dc.description.abstractPequenos RNAs não codificadores emergiram como importantes personagens em diversos aspectos da biologia. Os mais estudados entre eles são os microRNAs (miRNAs) e short interfering RNAs (siRNAs), que regulam a expressão do gene alvo pós-transcricionalmente em plantas e animais e intermediários na via de RNAi, respectivamente. Ambas as classes possuem biogêneses semelhantes, sendo processadas pelas enzimas Dicer e subsequente associação com as enzimas Argonautas. Em plantas, miRNAs e siRNAs possuem importantes funções no desenvolvimento, integridade do genoma e em respostas a estresses bióticos e abióticos. Com os avanços nas tecnologias de seqüenciamento em larga escala e análises in silico, novas classes de pequenos RNAs não codificadores vem sendo descobertas, muitas delas ainda com biogênese e funções indefinidas. Pequenos RNAs derivados de tRNA (tRFs) são uma classe de pequenos RNAs não codificadores, que tem como precursores um molécula de tRNA. Estes foram descobertos na década passada em vários organismos e, recentemente, em plantas. Estudos recentes detectaram tRFs de diferentes tamanhos, com origens em diferentes porções da molécula do tRNA maduro ( terminação 5’; terminação 3’; anti-códon loop) e alguns originados do precursor do tRNA (pré-tRNA), sugerindo que esta pode ser uma nova classe de pequenos RNAs e não apenas produtos de degradações aleatórias. Estudos em humanos mostraram que alguns tRFs são processados pelas enzimas Dicer, possuem associação com as enzimas Argonautas e funções relacionadas diferenciação celular, ao surgimento de tumores e ao silenciamento gênico. Estudos em arabidopsis e em abóbora (Cucurbita maxima) mostraram, respectivamente, que os tRFs possuem possível resposta à stress nutricional e função de sinal a longa distância entre tecidos fonte e dreno, podendo também afetarem a tradução. A biogênese dos tRFs em plantas ...pt
dc.identifier.aleph000786445
dc.identifier.citationPINOTI, Vitor Favaretto. Análise da expressão gênica de pequenos RNAs derivados de tRNAs (tRFs) em plantas. 2012. 1 CD-ROM. Trabalho de conclusao de curso (bacharelado - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2012.
dc.identifier.file000786445.pdf
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/120588
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceAleph
dc.subjectExpressão gênicapt
dc.subjectAcido ribonucleicopt
dc.subjectEnzimaspt
dc.subjectBiologia molecularpt
dc.subjectGenetica molecularpt
dc.subjectEnzymespt
dc.titleAnálise da expressão gênica de pequenos RNAs derivados de tRNAs (tRFs) em plantaspt
dc.typeTrabalho de conclusão de curso
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências, Botucatupt
unesp.undergraduateCiências Biológicas - IBBpt

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