Mapping quantitative trait loci in Gallus gallus using principal components

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dc.contributor.authorPinto, Luís Fernando Batista
dc.contributor.authorPacker, Irineu Umberto
dc.contributor.authorLedur, Mônica Corrêa
dc.contributor.authorMoura, Ana Silvia Alves Meira Tavares [UNESP]
dc.contributor.authorNones, Kátia
dc.contributor.authorCoutinho, Luiz Lehmann
dc.contributor.institutionUniversidade Federal da Bahia (UFBA)
dc.contributor.institutionUniversidade de São Paulo (USP)
dc.contributor.institutionEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2013-09-30T18:28:22Z
dc.date.accessioned2014-05-20T13:41:35Z
dc.date.available2013-09-30T18:28:22Z
dc.date.available2014-05-20T13:41:35Z
dc.date.issued2010-11-01
dc.description.abstractEste estudo teve por objetivo mapear QTL (quantitative trait loci) utilizando combinações lineares de características de interesse econômico em Gallus gallus. Foram estudadas 350 aves F2 oriundas de um cruzamento inicial entre machos de uma linhagem de corte (TT) e fêmeas de uma linhagem de postura (CC). Foi conduzido mapeamento de QTL nos cromossomos Gallus gallus (GGA1, GGA3, GGA5, GGA8, GGA11 e GGA13), para 20 características de desempenho e de carcaça. Para detectar QTL foi utilizado o teste da razão de verossimilhanças entre um modelo reduzido (incluindo efeitos fixos de sexo, incubação e o efeito aleatório de valor genético infinitesimal) e um completo (incluindo todos os efeitos anteriores mais os efeitos de QTL). Ao analisar as características originais, ou seja, antes da formação das combinações lineares, foram mapeados seis QTLs significativos a 1% no genoma, quatro no GGA1 (peso vivo aos 35 dias, peso vivo aos 42 dias, gordura abdominal e peso do coração) e dois no GGA3 (peso vivo aos 35 e aos 42 dias de idade); três QTLs significativos a 5% no genoma, sendo um no GGA1 (peso da cabeça), um no GGA3 (peso das asas), e um no GGA8 (peso da moela); além de sete ligações sugestivas para diversas características. Ao mapear QTLs para os componentes principais, foram confirmados vários QTLs mapeados para as características originais, além de encontrar três QTLs e oito ligações sugestivas não mapeadas para as características originais.pt
dc.description.abstractThis study aimed at mapping QTL (quantitative trait loci) using linear combinations of characteristics of economical interest in Gallus gallus. A total of 350 F2 chickens from an initial crossing among males from a broiler line (TT) with females from a layer line (CC) were used. It was conducted a QTL mapping in chromosomes of Gallus gallus (GGA1, GGA3, GGA5, GGA8, GGA11, and GGA13) for 20 performance and carcass traits. For detecting QTL, it was used the likelihood ratio test between a reduced model (including fixed effects of sex, hatch and random effect of infinitesimal genetic value) and a full model (including all the previous effects plus QTL effects). When original characterists were analyzed, that is, before the formation of linear combinations, six significant QTLs were mapped at 1% in the genome, four in the GGA1 (live weight at 35 days of age and at 42 days of age, abdominal fat and heart weight); and two on GGA3 (live weight at 35 and 42 days of age); three significant QTLs at 5% in the genome, one on GGA1 (head weight), one on GGA3 (wings weight), and one on GGA8 (gizzard weight); besides seven suggestive linkages for several traits. When QTLs were mapped for principal components, many mapped QTLs were confirmed for original traits, in addition to finding three QTLs and eight suggestive linkages not mapped for the original traits.en
dc.description.affiliationUFBA Escola de Medicina Veterinária Departamento de Produção Animal
dc.description.affiliationUSP ESALQ Departamento de Zootecnia
dc.description.affiliationEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Suínos e Aves
dc.description.affiliationUNESP FMVZ Departamento de Produção Animal
dc.description.affiliationUnespUNESP FMVZ Departamento de Produção Animal
dc.description.sponsorshipEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
dc.format.extent2434-2441
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/S1516-35982010001100016
dc.identifier.citationRevista Brasileira de Zootecnia. Sociedade Brasileira de Zootecnia, v. 39, n. 11, p. 2434-2441, 2010.
dc.identifier.doi10.1590/S1516-35982010001100016
dc.identifier.fileS1516-35982010001100016.pdf
dc.identifier.issn1516-3598
dc.identifier.scieloS1516-35982010001100016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/14405
dc.identifier.wosWOS:000285102800016
dc.language.isoeng
dc.publisherSociedade Brasileira de Zootecnia
dc.relation.ispartofRevista Brasileira de Zootecnia
dc.relation.ispartofsjr0,337
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceSciELO
dc.subjectfrangospt
dc.subjectgalinhapt
dc.subjectgenomapt
dc.subjectvariáveis canônicaspt
dc.subjectbroilersen
dc.subjectcanonical variablesen
dc.subjectchickensen
dc.subjectgenomeen
dc.titleMapping quantitative trait loci in Gallus gallus using principal componentsen
dc.title.alternativeMapeamento de locos de características quantitativas em Gallus gallus com utilização de componentes principaispt
dc.typeArtigo
dcterms.licensehttp://www.scielo.br/revistas/rbz/paboutj.htm
unesp.author.orcid0000-0002-2645-4735[3]
unesp.author.orcid0000-0002-7266-8881[6]
unesp.author.orcid0000-0002-0831-3293[1]
unesp.author.orcid0000-0002-2105-7319[4]
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Botucatupt

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