A família gênica da ascorbato peroxidase em genomas de Coffea spp: genômica comparativa e aspectos evolutivos

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Data

2018-12-14

Autores

Dovigo, Daniel Rodrigo [UNESP]

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Editor

Universidade Estadual Paulista (Unesp)

Resumo

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A fotossíntese e a respiração aeróbica são importantes mecanismos de obtenção de energia nos seres vivos. Ambos os processos passam pela oxidação celular, que pode ser intensificada em situações de estresse, gerando uma superprodução de espécies reativas a oxigênio (EROs), dos quais um exemplo é o peróxido de hidrogênio (H2O2). As células possuem vários sistemas para impedir danos causados por EROs, entre eles o sistema enzimático antioxidante. Umas das enzimas presentes neste sistema são as Ascorbato Peroxidases (APx). As APx são enzimas que catalisam a decomposição H2O2 em água, utilizando o ascorbato como doador de elétrons. Elas são enzimas codificadas por uma família multigênica composta por 7 a 9 genes em plantas. A despeito do conhecimento da regulação da atividade enzimática e transcricionalde APx em espécies do gênero Coffea, pouco se conhece sobre questões evolut ivas da família gênica neste gênero. Com isso, o objetivo principal do presente trabalho foi identificar e caracterizar evolutivamente a família gênica codificadora de APx no genoma de três espécies do gênero Coffea: C. canephora, C. eugenioides e C. arabica. Com a utilização de genes de Arabidopsis thaliana como ponto de partida para a análise de genes em Coffea, foram identificados seis genes codificantes de APx em C. eugenioidese sete genes em C. canephora, espécies diploides de Coffea. Em C. arabica foram identificados 13 genes, corroborando a da origem alotetraploide de C. arabica a partir da fusão de C. canephora e C. eugenioides. Foi possível ainda identificar a localização celular das enzimas codificadas, bem como padrões filogét icos para classificação de isoformas. A pressão evolutiva pelo qual passam os genes também foi analisada, constatando-se a seleção purificadora em todas as sequências. Dados públicos de expressão em C. canephora foram obtidos e observou-se a maior expressão do gene Cc_01G11800...

Descrição

Palavras-chave

Genoma, Café, Genômica, Evolução (Biologia), Bioinformática, Peroxidase, Enzimas, Metabolismo, Antioxidantes

Como citar

DOVIGO, Daniel Rodrigo. A família gênica da ascorbato peroxidase em genomas de Coffea spp: genômica comparativa e aspectos evolutivos. 2018. 31 f. Trabalho de conclusão de curso (licenciatura - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências (Campus de Rio Claro), 2018.