Expressão gênica diferencial de laranja Pêra Rio (Citrus sinensis (L.) Osbeck) e Lima Ácida 'Galego' (Citrus aurantifolia Swingle) em resposta à infecção por Xanthomonas citri subsp. citri

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dc.contributor.advisorFerro, Jesus Aparecido [UNESP]
dc.contributor.advisorJúnior, José Belasque [UNESP]
dc.contributor.authorCavallini, Juliana da Silva [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2014-08-13T14:50:36Z
dc.date.available2014-08-13T14:50:36Z
dc.date.issued2013-07-18
dc.description.abstractThe citrus agribusiness is very important to the Brazilian economy, but the increase of diseases in the last decade has caused great economic losses to the sector. The citrus canker, caused by the bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), is a serious disease that attacks all citrus species economically important worldwide and there is not an effective method for its control. In this study, RNASeq was used to analyze the transcriptional profiles of two contrasting citrus genotypes regarding citrus canker susceptibility: sweet orange Pêra Rio (PR), moderately resistant, and Mexican lime ‘Galego´ (ML), highly susceptible. Gene expression were performed in a HiScanSQ System (Illumina) using total RNA isolated from leaves collected 24, 48 and 72 hours after Xac inoculation, with leaves inoculated with water been used as control. It were found 6,330, 3,478 and 6,795 differentially expressed genes (DGEs) in moderately resistant PR specie at 24, 48 and 72 hours after Xac inoculation, respectively, when compared with their controls. In the specie highly susceptible ML, it was identified 1,491, 5,621 and 2,145 DGEs after 24, 48 and 72 hours after Xac inoculation, respectively. Through the program Blast2GO, genes and metabolic pathways related to photosynthesis, cell signaling, hormone synthesis, transcription factors, among others, were found as involved in plant defense. This study revealed differences at the molecular level between PR and ML in response to citrus canker, showing that in the specie moderately resistant there is a greater activation of host defense mechanisms. Such informations can be used for the development of citrus plants with an adequate level of resistance to citrus cankeren
dc.description.abstractA citricultura é uma das principais atividades do agronegócio brasileiro, porém o aumento de doenças na última década tem causado grandes prejuízos a toda a cadeia produtiva. A doença cancro cítrico, causada pela bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) é um grave problema para o setor, não havendo até o momento método eficaz para o seu controle. Nesse estudo, utilizando RNASeq, foram analisados os perfis transcricionais de dois genótipos hospedeiros contrastantes à doença: laranja doce Pêra-Rio (PR) moderadamente resistente, e Lima Ácida Galego (LG), altamente suscetível, 24, 48 e 72 horas após a infecção com Xac, no intuito de identificar genes das plantas envolvidos na interação patógeno-hospedeiro. Foram encontrados 6.330, 3.478 e 6.795 genes diferencialmente expressos (GDEs) na espécie moderadamente resistente PR, 24, 48 e 72 horas após a inoculação com Xac, respectivamente, quando comparados com seus controles. Na espécie altamente suscetível Limão Galego foram identificados 1.491, 5.621 e 2.145 GDEs após 24, 48 e 72 horas da inoculação com Xac, respectivamente. Através do programa Blast2GO, genes e vias metabólicas de fotossíntese, sinalização celular, síntese hormonais, fatores de transcrição, entre outros, foram encontrados. Esse estudo revelou diferenças associadas à resistência e desenvolvimento a nível molecular em PR e LG em resposta ao cancro cítrico, demonstrando que na espécie moderadamente resistente há uma maior ativação dos mecanismos de defesa. Tais estudos podem ser utilizados para o desenvolvimento de plantas de citros com adequado nível de resistência ao cancro cítricopt
dc.format.extentxii, 117 p. : il.
dc.identifier.aleph000738215
dc.identifier.capes33004102029P6
dc.identifier.citationCAVALLINI, Juliana da Silva. Expressão gênica diferencial de laranja Pêra Rio (Citrus sinensis (L.) Osbeck) e Lima Ácida 'Galego' (Citrus aurantifolia Swingle) em resposta à infecção por Xanthomonas citri subsp. citri. 2013. xii, 117 p. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, 2013.
dc.identifier.file000738215.pdf
dc.identifier.lattes0147241723612464
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/108432
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceAleph
dc.subjectLaranja - Doenças e pragaspt
dc.subjectCancro cítricopt
dc.subjectAcido ribonucleicopt
dc.subjectXanthomonaspt
dc.subjectBacterias fitopatogenicaspt
dc.subjectExpressão gênicapt
dc.subjectOrangept
dc.titleExpressão gênica diferencial de laranja Pêra Rio (Citrus sinensis (L.) Osbeck) e Lima Ácida 'Galego' (Citrus aurantifolia Swingle) em resposta à infecção por Xanthomonas citri subsp. citript
dc.typeDissertação de mestrado
unesp.author.lattes0147241723612464
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabalpt
unesp.graduateProgramAgronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAVpt
unesp.knowledgeAreaGenética e melhoramento de plantaspt

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