Molecular characterization of accessions of crabgrass (Digitaria nuda) and response to ametryn

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dc.contributor.authorVieira, Viviane Cristina [UNESP]
dc.contributor.authorAlves, Pedro Luís da Costa Aguiar [UNESP]
dc.contributor.authorPicchi, Simone Cristina [UNESP]
dc.contributor.authorLemos, Manoel Victor Franco [UNESP]
dc.contributor.authorSena, Janete Apparecida Desidério [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2014-10-01T13:08:58Z
dc.date.available2014-10-01T13:08:58Z
dc.date.issued2010-06-01
dc.description.abstractDigitaria species are sugar cane crop weeds in Brazil and are being controlled with herbicides, although there are some reports of control failure, notably to the triazine group. Molecular techniques are recommended to analyze the genetic variability in weeds. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism) and, in combination with sequencing, allow the localization of resistance genes, as well as possible mutations related to the onset of resistant individuals in some species. Thus, the objective of this work was to characterize ten accessions of Digitaria spp. by RAPD and PCR-RFLP markers, to sequence a conserved region of the psbA gene and evaluate the accessions response to ametryn. As showed by molecular analysis there was high genetic similarity among the accessions, all of them presented similar genetics profiles and were susceptible to ametryn.en
dc.description.abstractAs espécies de Digitaria são plantas daninhas nas lavouras de cana-de-açúcar no Brasil e estão sendo controladas com herbicidas, porém há alguns relatos de falha no controle, notavelmente ao grupo das triazinas. Técnicas moleculares são recomendadas para análise da variabilidade genética em plantas daninhas, como o RAPD (DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso) e PCR-RFLP (Reação da Polimerase em Cadeia - Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos de Restrição) e, aliadas ao sequenciamento, permitem a localização de genes de resistência, bem como possíveis mutações relacionadas ao surgimento de indivíduos resistentes em algumas espécies. Com isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar dez acessos de Digitaria spp. por meio de marcadores RAPD e PCR-RFLP, sequenciar uma região conservada do gene psbA e analisar a resposta destes à ametrina. Pela análise molecular houve elevada similaridade genética entre os acessos, pois todos apresentaram perfis genéticos semelhantes e foram suscetíveis à ametrina.pt
dc.description.affiliationUniversidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária
dc.description.affiliationUnespUniversidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária
dc.format.extent255-261
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.4025/actasciagron.v32i2.3841
dc.identifier.citationActa Scientiarum. Agronomy. Editora da Universidade Estadual de Maringá - EDUEM, v. 32, n. 2, p. 255-261, 2010.
dc.identifier.doi10.4025/actasciagron.v32i2.3841
dc.identifier.fileS1807-86212010000200011.pdf
dc.identifier.issn1807-8621
dc.identifier.lattes7179273060624761
dc.identifier.lattes1295051340591836
dc.identifier.lattes0103383524288212
dc.identifier.orcid0000-0003-2348-2121
dc.identifier.scieloS1807-86212010000200011
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/110272
dc.identifier.wosWOS:000279508300011
dc.language.isoeng
dc.publisherEditora da Universidade Estadual de Maringá (EDUEM)
dc.relation.ispartofActa Scientiarum: Agronomy
dc.relation.ispartofjcr0.692
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceSciELO
dc.subjectDigitariaen
dc.subjectpsbA geneen
dc.subjectRAPDen
dc.subjectSequencingen
dc.subjectTriazineen
dc.subjectWeeden
dc.subjectDigitariapt
dc.subjectGene psbApt
dc.subjectRAPDpt
dc.subjectSequenciamentopt
dc.subjecttriazinapt
dc.subjectPlanta daninhapt
dc.titleMolecular characterization of accessions of crabgrass (Digitaria nuda) and response to ametrynen
dc.title.alternativeCaracterização molecular de acessos de capim-colchão (Digitaria nuda) e resposta à ametrinapt
dc.typeArtigo
unesp.author.lattes7179273060624761
unesp.author.lattes1295051340591836
unesp.author.lattes0103383524288212[2]
unesp.author.orcid0000-0003-2348-2121[2]
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabalpt

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