Uso do DNA barcoding na identificação e monitoramento da ictiofauna e do ictioplâncton em lagos de proteção, manejo e exploração na região do baixo rio Purus
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Data
2023-07-27
Autores
Orientador
Oliveira, Cláudio de 
Coorientador
Pós-graduação
Ciências Biológicas (Zoologia) - IBB
Curso de graduação
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Tese de doutorado
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
Resumo (português)
A categorização de áreas protegidas é um importante instrumento para balizar o uso dos recursos pesqueiros. No entanto, a delimitação dessas áreas normalmente é pautada no conhecimento tradicional e levantamentos pontuais da ictiofauna. Nesse contexto a ferramenta molecular DNA barcoding pode atuar como instrumento de monitoramento, gerando informações robustas para o enquadramento das áreas protegidas nas diversas categorias, bem como no auxílio da implementação de estratégias de conservação. Diante disso, o presente estudo objetivou verificar a eficiência do DNA barcoding na identificação de ovos, larvas e adultos de espécies-alvo de peixes da região do baixo rio Purus na Reserva de Desenvolvimento Sustentável Piagaçu Purus (RDS-PP) e Reserva Biológica (Rebio) Abufari, bem como a efetividade das diferentes categorias dos lagos para o manejo e conservação da ictiofauna. As amostragens ocorreram em 13 locais, oito fixos e 12 variáveis, categorizados como proteção, aberto ou de manejo. O estudo foi composto pelas etapas experimentais: (i) coleta de material biológico; (ii) extração do DNA; (iii) sequenciamento de DNA barcoding; (iv) alinhamento de sequências de DNA de espécies-alvo versus ictioplâncton; e (v) identificação dos exemplares de espécies-alvo. Através do cruzamento e alinhamento de sequencias de DNA do banco de dados de espécies alvo e das sequências de ictioplâncton, foi possível identificar quais espécies demonstram comportamento reprodutivo no ambiente amostrado, e em qual período do ciclo hidrológico e categoria de uso dos lagos cada espécie-alvo ocorre. Dessa forma foi possível compor um banco de dados abrangente e lastreado por material testemunho depositado em coleção biológica, avaliar os padrões reprodutivos das espécies-alvo identificadas pelo DNA barcoding, validar a categorização dos lagos e propor ações de manejo e conservação dos recursos pesqueiros.
Resumo (inglês)
The categorization of protected areas is an important tool to drive exploitation of fisheries. However, the delimitation of these areas is usually based on traditional knowledge and on specific surveys of fish communities. In this context, the molecular tool DNA barcoding can act as monitoring tools, generating robust information for classifying areas into different categories, as well as helping to implement conservation strategies. Thus, this present study aims to verify the efficiency of DNA barcoding in the identification of eggs, larvae, and adults of target species of fish from the lower Purus River region in the RDS-PP and Rebio Abufari, and the effectivity of different lakes categories to management and conservation of ichthyofauna. Sampling was taken in 13 locations, eight fixed and 12 variables, categorized as protection, open access or management. The study gathered the experimental steps: (i) biological sampling; (ii) DNA extraction; (iii) DNA barcoding sequencing; (iv) alignment of DNA sequences of target species versus ichthyoplankton; and (v) identification specimens of target species. The ichthyofauna was sampled with gillnet, macrophyte encirclement, beach trawl, sieve and benthic trawl. The ichthyoplankton was collected with a conical plankton net. The fish species were framed as target species based on legal restriction criteria, commercial and ornamental importance, and conservation status, forming the DNA barcoding database of fishes and ichthyoplankton sequences. By crossing and aligning DNA sequences from the genomic library of the target species and the ichthyoplankton sequences, the potential species that reproduces in the sampled environment were identified, and which category of the lakes and hydrological period they used during reproduction. In this way, it was possible to compose a comprehensive database backed by testimonial material deposited in a biological collection, evaluate the reproductive patterns of the target species identified by DNA barcoding, validate the categorization of lakes and propose management and conservation actions for fishing resources.
Descrição
Palavras-chave
Idioma
Português