São José do Rio Preto - IBILCE - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas
URI Permanente para esta coleçãohttps://hdl.handle.net/11449/254501
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PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Expressões autoficionais em D'après une histoire vraie, de Delphine de Vigan, e Divócio, de Ricardo Lísias(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-03-26) Fraga, Denise; Wimmer, Norma
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Este trabalho tem como objetivo o estudo dos narradores das obras D’après une histoire vraie (2015), da autora francesa Delphine de Vigan, e Divórcio (2013), do escritor brasileiro Ricardo Lísias, a partir da concepção estética de autoficção de Diana Klinger (2012). Para ela, o que interessa nos textos autoficcionais não é a relação de identificação entre a obra e os acontecimentos da vida do autor empírico, mas sim a criação do que ela chama o mito do escritor. A conjugação entre os processos de simulação da escrita e a inserção, nas obras, de operadores de identificação, que estabelecem o vínculo das informações biográficas do narrador às do autor, resulta na visão da autoficção como uma performance do autor do texto, caracterizada como a representação teatral do autor por meio de sua escrita. O emprego dessa técnica em Vigan leva ao questionamento da “verdade” e de sua possibilidade nos textos em primeira pessoa e demais produtos culturais. Em Lísias, a suspensão entre as concepções de real e de ficcional, de autor e de narrador, conduz a críticas sociais a determinadas práticas jornalísticas e a estruturas de poder brasileiras.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Development of technological alternatives for drying and spore extraction of Metarhizium anisopliae in biofactories using Solid-State Cultivation on rice(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-03-11) Ferreira, Daiane Bortolote; Thoméo, João Cláudio
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
A busca por alternativas menos agressivas para o controle de pragas tem impulsionado a produção do fungo entomopatogênico Metarhizium anisopliae, um biopesticida amplamente utilizado no controle de diversas pragas agrícolas. A produção em escala industrial é realizada por cultivo em estado sólido, utilizando arroz como substrato em embalagens plásticas. No entanto, esse processo enfrenta diversas barreiras tecnológicas, principalmente devido à realização manual de todas as etapas, o que aumenta a frequência de contaminações exógenas. Dentre os desafios que demandam aprimoramento, destacam-se a pré-secagem e a extração de esporos. Tradicionalmente, a secagem ocorre pela abertura das embalagens de cultivo em salas com temperatura controlada, um processo trabalhoso e demorado. Já a extração de esporos é convencionalmente realizada em peneiras vibratórias, resultando em perdas significativas. Esses desafios evidenciam a necessidade de otimização do processo para garantir maior eficiência e viabilidade na produção de M. anisopliae em larga escala. Este estudo investiga o uso de um tambor horizontal de 20 cm de diâmetro e 33 cm de comprimento, equipado com duas aletas retas posicionadas longitudinalmente, para a secagem e extração de esporos. A secagem do arroz cozido foi realizada utilizando modos estático e com rotações intermitentes a cada 1 e 24 horas de operação. Para simular a secagem estática, foi empregado um modelo matemático bidimensional baseado no transporte de massa difusivo. No caso do modo com rotações intermitentes, a homogeneização do leito foi investigada por meio de simulações utilizando o Método dos Elementos Discretos (DEM), considerando diferentes níveis de umidade. O modelo matemático previu que seriam necessários 23 dias para reduzir a umidade de 0.667 para 0.250 kg-a/kg-ss a 30°C com fluxo de ar de 50 L/min. No entanto, a introdução de rotações intermitentes reduziu esse tempo em até 97.79%. Simulações DEM, validadas experimentalmente, demonstraram que umidade elevada dificultam a mistura do material, no entanto ao se rotacionar o tambor 11 vezes a 7 rpm atingisse uma boa homogeneização dos leitos. Além disso, observou-se que o número de rotações necessárias para alcançar a homogeneização diminuiu com a redução do diâmetro do tambor e com modificações no formato das aletas, destacando a importância do design do equipamento na otimização do processo. A extração de esporos foi analisada em um tambor com rotação constante, acoplado a um conjunto de ciclones previamente dimensionado. A condição ótima de extração foi determinada variando-se o grau de enchimento do tambor (0.25 e 0.50), a velocidade de rotação (30 e 60 rpm) e o tempo de operação (4 e 8 h). Além disso, simulações DEM foram conduzidas para estimar as trajetórias das partículas, o número e as forças de colisão, parâmetros inacessíveis experimentalmente. Os resultados confirmaram que a eficiência da extração depende do equilíbrio entre rotação, umidade e forças de colisão. A condição ótima de extração é alcançada ao se rotacionar o tambor com grau de enchimento de 0.50, velocidade de rotação de 30 rpm por 8 horas. De forma geral, as maiores eficiências de extração foram obtidas com o maior tempo de operação (8 h), atribuído à maior redução da umidade das partículas, evidenciando o impacto desse fator na eficiência do desprendimento dos esporos. A força de arrasto necessária para a remoção dos esporos diminui à medida que a umidade das partículas é reduzida, o que também diminui as forças de adesão entre os esporos e o substrato, estimadas entre 1,06x10-5 e 3,17x10-4 N. As simulações DEM revelaram que, embora 60 rpm aumentassem a frequência e a intensidade das colisões, não resultaram em uma melhora significativa na extração em comparação a 30 rpm. Esse efeito foi atribuído à fragmentação excessiva das partículas e à dissipação de energia em velocidades mais altas, resultando em um movimento menos eficiente para a extração dos esporos. Esses resultados demonstram o potencial dos tambores rotativos para aprimorar os processos de secagem e extração de esporos em biofábricas. A integração de dados experimentais, modelagem matemática e simulações DEM fornece uma compreensão abrangente da dinâmica do processo, contribuindo para o desenvolvimento de soluções escaláveis e econômicas na produção de bioinseticidas.PublicaçãoTese de doutorado Do tradicional ao miniconto: a produção fantástica brasileira do século XIX ao século XXI(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-28) Mingotti, Rodrigo Donizeti; Wimmer, Norma
; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
A literatura fantástica, emergente entre os séculos XVIII e XIX, tem se manifestado ao longo dos anos em variados contextos sociais e de produção, de diferentes formas, configurando novas perspectivas e acepções acerca de suas especificidades textuais e semânticas. O século XIX, majoritariamente, é conhecido como o marco do fantástico, sobretudo nas narrativas europeias de Maupassant e Hoffman e na estadunidense de Edgar Allan Poe. À época, no Brasil, essas narrativas “fantasiosas” foram suprimidas pelas que prezassem pelo realismo e poder documental nacional, não recebendo a devida atenção da crítica e história literária. Entretanto, novos estudos, a partir do século XX, têm-se debruçado sobre a presença fantástica na literatura deste período. No século XX, essa modalidade exerceu um papel notório na literatura brasileira do período, trazendo à tona novos autores que se consagraram no gênero. Já no século XXI, a literatura fantástica ainda tem o seu papel, adaptando-se às novas transformações. Conjugando estes aspectos, objetiva-se com este trabalho analisar a manifestação do fantástico na série literária brasileira, entre meados do século XIX e início do século XXI, de modo a analisar e explorar suas principais particularidades, conversões e oscilações temáticas e de estilo, sob as formas do conto e miniconto, as quais, indissociavelmente, se ligam à produção de efeitos e sentidos do fantástico. A tese desenvolvida é a de que o fantástico é um gênero fluido, interpolar e se modificou de acordo com os contextos e suportes (conto e miniconto) de produção, oscilando do chamado fantástico tradicional às produções contemporâneas, com as devidas nomenclaturas, subclassificações e acepções semânticas e estilísticas. Para a comprovação dessa hipótese, retomando estudos na área, foram selecionados exemplos narrativos de autores brasileiros do século XIX ao XXI que permeiam a literatura fantástica, em diferentes estados significativos, compondo os objetos de estudo desta pesquisa narrativas oitocentistas de Álvares de Azevedo, Fagundes Varela e Machado de Assis; as do século XX de Murilo Rubião, Lygia Fagundes Telles e de Jayme Griz; e as dos anos iniciais do século XXI de Nuno Ramos. Ademais, ressalta-se a importância desta pesquisa, de forma a explorar a literatura fantástica brasileira, ampliando a gama de textos e autores, apresentando demais perspectivas teórico-críticas não só acerca do fantástico, como também do conto e do miniconto contemporâneo.PublicaçãoTese de doutorado Impactos da termossonicação em uvas bordô e caracterização reológica de variedades de uva cultivadas no Brasil(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-16) Almeida, Micael José de; Romero, Javier Telis
; Vanzela, Ellen Silva Lago
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
As uvas cultivadas no Brasil possuem alto valor nutricional, comercial e econômico, sendo destinado tanto em natura quanto para processamento, com destaque para as variedades Barbera Piemonte, Bordô, BRS Carmem e Malbec. A uva Bordô se sobressai pelo alto teor de antocianinas, pigmentos antioxidantes benéficos, porém sensíveis ao calor, o que dificulta seu processamento. A termossonicação (TS) surge como uma técnica inovadora e sustentável para preservar e melhorar a qualidade dos produtos à base de uva, minimizando a degradação térmica. Dessa forma, este estudo avaliou os efeitos da TS na degradação das antocianinas, potencial antioxidante e nos parâmetros termodinâmicos da uva Bordô, além de caracterizar o comportamento reológico das variedades Barbera Piemonte, BRS Carmem e Malbec. A degradação das antocianinas seguiu uma cinética de primeira ordem, revelando diferenças significativas entre os métodos. A TS não alterou o pH e a acidez do mosto, mas aumentou o SS e a extração de antocianinas. A coloração do mosto tratado por TS mostrou-se mais escura, indicando maior extração dos pigmentos. Nos parâmetros termodinâmicos, observou-se que a TS reduziu a energia de ativação e a entalpia de ativação, enquanto a energia livre de Gibbs positiva indicou que a degradação ocorre de forma não espontânea. Além disso, a menor entropia sugere maior estabilidade molecular. Os resultados sugerem que as antocianinas extraídas por TS têm estabilidade térmica semelhante àquelas obtidas por CV. Nos testes de atividade antioxidante (AT) (métodos ABTS, DPPH e FRAP), a TS promoveu inicialmente um aumento de CA provavelmente devido à maior extração de antocianinas. No entanto, em temperaturas mais altas, essa capacidade diminuiu. Ainda assim, o mosto tratado por TS manteve maior atividade antioxidante em comparação ao CV.O modelo Ostwald-de Waele ajustou o comportamento reológico das uvas (BRS Carmem, Barbera Piemonte e Malbec) com melhor precisão por apresentar maior coeficiente de determinação (RAdj2) e menor erro quadrático médio (RMSE), sendo caracterizado como comportamento não newtoniano (n < 1), que é afinamento por cisalhamento e pseudoplástico. Os coeficientes de consistência (k) e o índice de comportamento do fluido (n) foram significativamente reduzidos pelo aumento da temperatura. As propriedades reológicas variam de acordo com a variedade de uva e a temperatura empregada, com o k e n diminuindo com o aumento da temperatura, sendo o n afetado de maneira diferente em cada tipo de uva. Um modelo polinomial de segunda ordem foi empregado para descrever o efeito da temperatura nos parâmetros reológicos. Os resultados deste estudo sugerem que o TS é um método eficaz para aumentar a extração de antocianinas da uva Bordô, sem afetar negativamente sua cinética de degradação térmica, parâmetros termodinâmicos e de estabilidade. A análise das faixas de temperatura e do comportamento reológico das uvas fornece informações cruciais para a otimização dos procedimentos de fabricação, assegurando uniformidade e qualidade. Assim este estudo destaca a importância de compreender as características intrínsecas de cada variedade de uva para aprimorar os processos industriais no ramo de alimentos e bebidas e garantir a qualidade superior na elaboração de produtos derivados de uva.PublicaçãoTese de doutorado Bactérias ácido láticas como bioconservantes em produto cárneo fermentado reduzido de sódio(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-28) Bertuci, Marcello Lima; Barretto, Andrea Carla da Silva
; Penna, Ana Lúcia Barretto ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
A crescente demanda por produtos cárneos mais saudáveis impulsionou a busca por alternativas que garantam qualidade e segurança microbiológica. A bioconservação, com o uso de microrganismos benéficos como as bactérias ácido láticas (BAL), tem se mostrado eficaz no controle de contaminação microbiológica. Este estudo avaliou o uso de cepas de BAL potencialmente probióticas em produtos cárneos fermentados com redução de sódio, focando na inibição de Listeria e na melhoria das características sensoriais e tecnológicas. As cepas Lacticaseiobacillus casei SJRP38, SJRP146, Lacticaseibacillus paracasei BGP1 e Lactobacillus rhamnosus LGG foram avaliadas quanto ao crescimento em condições típicas de fermentação, considerando pH, concentração de sais e nitrito de sódio. A cepa BGP1 apresentou os melhores resultados em termos de crescimento e inibição de patógenos, com bom potencial tecnológico para produtos cárneos fermentados. Listeria monocytogenes representa um risco significativo à saúde, especialmente em produtos fatiados, devido à sua resistência a temperaturas de refrigeração. A aplicação das cepas de BAL permitiu reduzir o teor de sódio sem comprometer as características sensoriais, tecnológicas e a segurança microbiológica. A incorporação de cepas Lacticaseibacillus paracasei BGP1 e Lactiplantibacillus plantarum ST8SH em produto cárneo fermentado reduzido de sódio, submetidos ao fatiamento e inoculados com Listeria inoccua, demonstrou ótima inibição de Listeria em armazenamento a 4°C por 7 dias. A combinação da ação antimicrobiana das BAL com a redução de sódio atende à demanda por produtos com rótulos simplificados e seguros para consumo. Este estudo destaca o potencial das BAL como bioconservantes eficientes em produto cárneo fermentado reduzido de sódio, garantindo maior segurança microbiológica e preservando a qualidade do produto final.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Sobre uma classe de equações integro-diferenciais neutras explícitas com intervalos de integração dependendo do estado(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-26) Vitório, Vinicius; Arita, Andréa Cristina Prokopczyk
; Morales, Eduardo Alex Hernández ; Universidade Estadual Paulista (UNESP) ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Neste trabalho introduzimos e estudamos uma classe de equações integro-diferenciais funcionais abstratas com retardo dependendo do estado, cujas informações sobre o passado são apresentadas como uma média do estado em intervalos de tempo dependentes do estado. A representação abstrata do problema estudado e a abordagem técnica desenvolvida permitem a generalização de uma extensiva literatura sobre diferentes classes de equações diferenciais integrais e integro-diferenciais. Nós apresentamos resultados sobre existência e unicidade local e global de soluções fracas e estritas, garantimos condições para a boa colocação local desta classe de equações e desenvolvemos alguns exemplos motivados por problemas que aparecem na teoria de dinâmica populacional.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
A study on solutions to damped fractional-order Cauchy problems(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-27) Aquino, João Vinicius Miron; Arita, Andréa Cristina Prokopczyk
; Yañez, Carlos Enrique Lizama ; Universidad de Santiago de Chile ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Este trabalho apresenta alguns resultados importantes da teoria das famílias resolvente (a, k)-regularizadas, como também das, bem conhecidas, famílias cosseno e seno. Juntamente com os conceitos de transformada de Laplace, são apresentados resultados sobre soluções para problemas de Cauchy abstratos fortemente amortecidos de ordem fracionária. Mais especificamente, são apresentados resultados, em sentido específico, sobre a boa colocação dessas equações.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
BRS Núbia: composição antociânica e avaliação de efeito de pré-tratamentos físicos e bioquímicos para produção de sucos(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-10-30) Furlan, Anelisa Doretto Freitas; Vanzela, Ellen Silva Lago
; Hortense, Yara Paula Nishiyama
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
O presente estudo objetivou caracterizar as propriedades físico-químicas e a composição antociânica da cultivar BRS Núbia (‘Michele Palieri’ × ‘Arkansas 2095’) de diferentes ciclos produtivos. Além disso, avaliar o impacto de distintos pré-tratamentos térmicos e bioquímicos aplicados no processamento por prensagem sobre a composição qualitativa e quantitativa das antocianinas, as propriedades físico-químicas e a cor do suco obtido. Para tanto, foram inicialmente determinadas as caraterísticas físico-químicas básicas (acidez total (AT), potencial hidrogeniônico (pH), sólidos solúveis (SS)) e os perfis qualitativos e quantitativos de antocianinas em uvas provenientes de três ciclos produtivos distintos da uva (U1, U2 e U3). A análise foi realizada por meio de cromatografia líquida de alta eficiência com detector de arranjo de diodo acoplada a sistema de ionização por eletronebulização e espectrômetro de massas multidimensional (CLAE-DAD-IES-EMn). Na etapa seguinte, os sucos foram produzidos utilizando processos por prensa (P), associados ou não com diferentes pré-tratamentos térmicos (branqueamento (B) e congelamento e descongelamento (CD)) e bioquímicos com preparados enzimáticos comerciais (PE). Para compor os PE 1, 2 e 3 foram utilizados dois PE, um a base de poligalacturonase e um a base de pectina liase em três proporções distintas: 30:70 (m/m) (tratamento PE1); 50:50 (m/m) (PE2) e 70:30 (m/m) (PE3), de acordo com as dosagens recomendadas pelo fabricante (0,04g·kg de uva para ambos os preparados enzimáticos). Por fim, foram avaliados os efeitos do processamento na composição antociânica por CLAE-DAD-IES-EMn, os parâmetros cromáticos e o rendimento dos sucos. Nas uvas foram identificadas 22 antocianinas, incluindo as cinco principais agliconas (delfinidina (dp), cianidina (cy), peonidina (pn), petunidina (pt) e malvidina (mv)), tanto nas formas não acilada e aciladas (acetiladas (acglc), cumariladas (cmglc) e cafeiladas (cfglc)). A antocianina majoritária foi a mv 3-glc. Pequenas variações na composição qualitativa das antocianinas entre os ciclos produtivos foram observadas, com concentrações de antocianinas monoméricas totais (AMT) variando entre 241,71 ± 76,34 a 669,04 ± 211,55 mg equivalentes (eq.) de mv-3-glc·kg-1. Os diferentes ciclos produtivos apresentaram características físico-químicas distintas, especialmente em virtude dos diferentes graus de maturação, o que refletiu parcialmente na composição dos sucos produzidos. Após a produção dos, sem a inclusão dos PE e pré-tratamentos térmicos, a concentração de AMT determinada foi de 374,12 ± 13,99 mv-3-glc·kg-1. No processo P, foram produzidos os seguintes sucos: suco controle por prensa (SCP); suco com PE1 (SPE1); suco com SPE2; suco com SPE3; suco com B (SB); suco com B e PE1 (SBPE1); suco com B e PE2 (SBPE2); suco com B e PE3 (SBPE3); suco com CD (SCD); suco com CD e PE1 (SCDPE1); suco com CD e PE2 (SCDPE2); e suco com CD e PE3 (SCDPE3). Com base na avaliação dos sucos produzidos com os pré-tratamentos das uvas citados pode-se verificar uma qualidade superior no suco SBPE2, devido a alta concentração de AMT (5428 mg de mv-3-glc·kg-1 de uva) e a coloração característica de uva, no entanto obteve um rendimento razoávelmente baixo de processo. Por outro lado, os rendimentos dos sucos submetidos ao pré-tratamento térmico de CD variaram obtendo concentrações de antocianinas mais baixas (1369,02 e 1513,75 mg de mv-3-glc·kg-1 de uva). Considerando a análise cromática dos sucos por prensa, os tratamentos que incluíram processos bioquímicos, mostraram-se eficientes em intensificar a saturação e preservar a tonalidade avermelhada desejada nos sucos de uva, como observado no tratamento SBPE2, refletindo a retenção de antocianinas.PublicaçãoTese de doutorado Cumarinas e hesperetina como candidatas antivirais contra o vírus Sincicial Respiratório Humano(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-28) Sá, Jéssica Maróstica de; Souza, Fátima Pereira de
; Caruso, Ícaro Putinhon
; Peeples, Mark Edward ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
O vírus sincicial respiratório humano (hRSV) é um dos principais causadores de doenças respiratórias agudas que acomete principalmente crianças até os 2 anos e idosos, responsável por complicações como bronquiolite e pneumonia. Existem duas vacinas disponíveis, Arexvy® para idosos e a Abrysvo™ que pode ser administrada em gestantes. Em termos profiláticos, existem anticorpos monoclonais, como o Palivizumabe e o Nirsevimabe para pacientes pediátricos de alto risco, e como tratamento, um antiviral de amplo espectro, a Ribavirina, porém não existe medicamento específico. Dentre as proteínas codificadas pelo vírus, a nucleoproteína N destaca-se por sua importância na proteção do RNA viral e por sua atuação como molde para a replicação e transcrição viral. O reconhecimento eficiente e específico do molde NC pela polimerase é mediado pela fosfoproteína P. Isso deve-se à interação de resíduos do C-terminal da fosfoproteína em um bolso hidrofóbico no domínio N-terminal da nucleoproteína (N-NTD). O presente projeto realizou uma investigação da interação da cumarina, esculetina, esculina, 4-metil esculetina, umbeliferona com o N-NTD, e de competição com o undecapeptídeo (6FAM-DSDNDLSLEDF) via ressonância magnética nuclear e anisotropia de fluorescência. Realizamos ensaios de citotoxicidade e inibição viral das cumarinas e da hesperetina, nas células HEp-2, A549 e HBE (human bronchial epithelial) diferenciada. Os resultados de competição por STD-RMN das cumarinas com o undecapeptídeo pelo N-NTD da nucleoproteína mostraram que a cumarina compete pelo sítio, enquanto para as demais cumarinas observou-se um deslocamento e uma leve diminuição nos sinais, indicando que essas possam estar se ligando junto com undecapeptídeo no hotspot ou próximo a ele. Nas análises de anisotropia de fluorescência também foi observado competição da cumarina com o undecapeptídeo, pelo sítio N-NTD. A análise de perturbação de deslocamento químico do N-NTD na presença da cumarina mostra que os resíduos Lys46, Arg132, Tyr135 e His151, são resíduos do hotspot que apresentaram as variações mais significativas. Nos ensaios de inibição viral em células A549, a 4-metil, esculetina e hesperetina diminuíram a replicação viral, em 70, 89 e 50%, respectivamente. Quando encapsuladas com β - ciclodextrina, a cumarina, esculetina e hesperetina apresentaram ação inibitória contra o hRSV, especialmente nas células HBE diferenciadas. Concluímos que as cumarinas diminuíram a infecção viral em cultura celular e podem ter como alvo alguma proteína do ciclo replicativo do vírus, como a nucleoproteína. Porém são necessárias mais investigações para identificar o alvo celular ou viral dessas cumarinas, assim como realizar modificações químicas nessas moléculas fenólicas, que contribuam para o aumento da inibição contra o RSV e que diminuam seus efeitos tóxicos.ItemTese de doutorado Acesso Aberto
Contribution of transposable elements to the host shift of cactophilic Drosophila species(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-13) Oliveira, Daniel Siqueira; Carareto, Claudia Marcia Aparecida
; Vieira, Cristina ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Elementos de transposição (TEs) são componentes dinâmicos dos genomas que geram variantes estruturais e servem como fontes de diversidade genética, contribuindo significativamente para processos evolutivos. Durante a transcrição, os TEs podem interagir com genes, incorporando sua sequência no mRNA do gene por meio de iniciação/terminação da transcrição e splicing alternativo, formando os chamados transcritos quiméricos gene-TE. Nesta tese, desenvolvemos o ChimeraTE, uma nova pipeline de bioinformática projetada para detectar quimeras gene-TE, utilizando dados de RNA-seq paired-end por meio de dois modos complementares: um modo guiado por referência para alinhamento genômico canônico e um modo independente de referência, que identifica quimeras sem necessidade de um genoma de referência. Utilizando linhagens de Drosophila melanogaster, validamos o ChimeraTE e descobrimos que aproximadamente 1,12% dos genes geram transcritos quiméricos, com cerca de 23% destes TEs ausentes do genoma de referência, sugerindo que inserções recentes ou polimórficas que contribuem para a variabilidade do transcriptoma. Utilizamos essa abordagem para investigar o papel dos TEs na evolução adaptativa e na troca de hospedeiro de espécies cactofílicas de Drosophila, com foco em suas interações com genes associados à localização, aceitação e uso de hospedeiros. Considerando que a mudança de hospedeiro é um processo evolutivo que pode levar ao isolamento reprodutivo e à especiação, conduzimos análises genômicas e transcriptômicas em sete genomas de espécies de Drosophila cactofílicas para explorar como os TEs contribuem para a regulação e expressão de genes relacionados à mudança de hospedeiro. Identificamos um enriquecimento de TEs em regiões promotoras de genes associados à mudança de hospedeiro, sendo que os Helitrons representam cerca de 60% desses casos, indicando um provável papel cis-regulador dos TEs na influência sobre a expressão gênica. Análises de expressão diferencial entre espécies com diferentes preferências de hospedeiro revelaram uma notável divergência nos perfis de expressão gênica em tecidos de larvas e cabeça, que são essenciais para o reconhecimento e adaptação ao hospedeiro. Embora o impacto geral dos TEs nos níveis de expressão gênica pareça ser mínimo, aproximadamente 1,31% dos genes, incluindo aqueles ligados à preferência de hospedeiro, geram transcritos quiméricos, apontando para uma influência direta dos TEs na diversidade de transcritos. Os resultados fornecem evidências convincentes de que os TEs desempenham um papel na evolução adaptativa da troca de hospedeiro, promovendo mudanças genéticas e transcriptômicas que podem facilitar a especialização ecológica e o isolamento reprodutivo. Esta tese destaca a importância evolutiva dos TEs na promoção de novidades genéticas e enfatiza seu potencial em impulsionar a divergência adaptativa em populações naturais de Drosophila cactofílicas.PublicaçãoTese de doutorado Caracterização biofísica e estrutural da toxina esfoliativa E (ETE) selvagem e mutante (Ser219Ala) de Staphylococcus aureus(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2022-06-29) Santisteban, Angela Rocio Nino; Arni, Raghuvir Krishnaswamy
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Staphylococcus aureus é uma bactéria comensal e oportunista que pode infectar uma variedade de hospedeiros, incluindo humanos e diferentes espécies de gado, essa bactéria representa um problema de saúde pública mundial e causa enormes prejuízos à pecuária. A toxina E esfoliativa (ETE) é um fator de virulência que facilita a disseminação do patógeno ao induzir o desprendimento generalizado da camada granular da epiderme em ovinos. Interações secundárias ocasionais, ainda desconhecidas neste sistema e incomuns entre serino proteases induzem a hidrólise específica da ligação peptídica entre Glu332-Gly333 da Desmogleína 1 ovina (oDsg1). Uma melhor compreensão do mecanismo de ação das ETs é necessária para desenvolver estratégias de inibição e controle do patógeno. Este trabalho foi realizado com o fim de elucidar os mecanismos e modos de ação em nível atômico, nas interações com o substrato Dsg1. Para isso, a proteína nativa (ETEwt) e mutante (ETEmut-Ser219Ala) foram expressas em E. coli BL21 (DE3) -T1R. Posteriormente, foram purificadas por gel filtração (SEC) em coluna Superdex® 75 10/300 GL em tampão 20 mM MES com variação de pH. As proteínas foram analisadas por dicroísmo circular (CD), espalhamento dinâmico de luz (DLS), SEC acoplada a espalhamento de luz multiângulo (SEC-MALS) e calorimetria de varredura diferencial (DSC). A estrutura secundária mostrou que ambas as proteínas têm predominância de formação de random coil e o tamanho de partícula para as duas proteínas foi de 2,093 ± 0,3 (r.nm). Experimentos de desenovelamento térmico utilizando CD e DSC permitiram estabelecer os valores da temperatura de fusão (49,0 ± 1,4 °C), da entalpia calorimétrica (220 ± 50 kJ/mol) e da entalpia de Van't Hoff (270 ± 70 kJ/mol). Ensaios por espalhamento de raiosX de baixo ângulo (SAXS) indicaram a presença de diferentes oligômeros no sistema dependendo da concentração da amostra. Os cristais obtidos das proteínas foram difratados por raios-X na linha MANACÁ do LNSL de Campinas-Brasil. A resolução final de ETEwt foi de 1,61 Å e 2,45 Å para ETEmut, as duas formam dímeros.PublicaçãoTese de doutorado Vigilância epidemiológica e molecular e caracterização de vírus de veiculação hídrica em diferentes etapas do tratamento de esgoto na cidade de São José do Rio Preto – SP(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2025-02-07) Nascimento, Mariah Cristina Antunes do; Rahal, Paula
; Calmon, Marília de Freitas
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
O esgoto é uma fonte de diversos patógenos, incluindo vírus, que são importantes transmissores de doenças, como gastroenterite e hepatite. Este estudo teve como objetivo geral monitorar os vírus entéricos, como os enterovírus (EV), o Aichi vírus (AiV), o vírus da Hepatite A (VHA) e o vírus da Hepatite E (VHE) em três fases do tratamento de esgoto em São José do Rio Preto, SP. Para isso, foram coletadas três amostras semanais (esgoto bruto (EB), pós-tratamento biológico anaeróbio (PTBA) e pós-tratamento químico (PTQ)) pelo Serviço Autônomo Municipal de Água e Esgoto (SeMAE), ao longo de um ano, totalizando 156 amostras. A metodologia aplicada incluiu a concentração de partículas virais por ultracentrifugação, extração de RNA com TRIzol, síntese de cDNA, PCR, Semi-Nested PCR, Nested PCR e qPCR para detecção, e ainda esse último também para quantificação. Adicionalmente, foram realizados testes de inibição e eficiência de recuperação, teste de infectividade viral para AiV, sequenciamento e análise filogenética, e análise dos dados, correlacionando com dados epidemiológicos das respectivas doenças reportadas na cidade de São José do Rio Preto -SP e parâmetros do esgoto. Das 156 amostras analisadas, 52 de cada etapa do tratamento, sendo EB, PTBA e PTQ, foram encontrados resultados positivos para cada fase e vírus, respectivamente: EV (98,1%, 88,5% e 42,3%), AiV (90,4%, 78,8% e 71,1%), VHA (25,0%, 23,1% e 13,5%) e VHE (5,8%, 3,8% e 0,0%). As quantificações médias para cada ponto foram: EV (3,36, 2,78 e 1,02 log10 Cópias Genômicas (CG)/mL), AiV (2,63, 1,98 e 0,39 log10 CG/mL), VHA (0,90, 0,85 e 0,47 log10 CG/mL), enquanto para VHE não foi possível realizar a quantificação. A análise filogenética revelou que 94 amostras eram do genótipo A do AiV, 1 amostra do genótipo IA do VHA e 2 amostras do genótipo III do VHE. Para o EV, 21 amostras foram positivas para o genótipo A e 8 para o genótipo B, por meio de Semi-Nested PCR. O isolamento viral do AiV revelou que o vírus estava infeccioso nas três fases do tratamento de esgoto. Não houve diferenças significativas (p > 0,05) para a detecção dos vírus e suas respectivas doenças reportadas na cidade, embora tenham sido observadas algumas correlações entre os parâmetros do esgoto, estações do ano e as cargas virais dos vírus estudados nos diferentes pontos de tratamento do esgoto. Em conclusão, o monitoramento de patógenos nas águas residuais é crucial para complementar os dados epidemiológicos, entender a disseminação de doenças e prever surtos.ItemTese de doutorado Acesso Aberto
Complexos heterobimetálicos de RuII -PdII como catalisadores multifuncionais de reações mecanisticamente distintas: Heck, ROMP e polimerização vinílica(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-04) Cruz, Thaís Regina; Carvalho Júnior, Valdemiro Pereira
; Goi, Beatriz Eleutério
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
A integração de dois centros metálicos em complexos heterobimetálicos oferece versatilidade para aplicação em catálise homogênea. Para explorar essas vantagens, duas séries de complexos heterobimetálicos de Ru-Pd foram sintetizadas. O complexo [RuCl2(PPh3)2(piperidina(4-aminometil))] (mono-RuPip) foi sintetizado a partir de [RuCl2(PPh3)3] e 4-(aminometil)piperidina (pip-NH2), enquanto o complexo [PdCl(PPh3)(Shiff-pip)] (mono-PdSc) foi obtido pela reação de [PdCl2(PPh3)2] com a base de Schiff. O complexo heterobimetálico [RuCl2(PPh3](-Pip-Schiff)Pd(PPh3)Cl] (RuPip - PdSc) foi sintetizado via reação one-pot a partir do salicilaldeído, [PdCl2(PPh3)2] e mono RuPip . Na segunda série, complexos do tipo [Pd(N,N,S-tsc)(4-aminopiridina)] (mono PdMe , mono-PdMe,Me e mono-PdPh) foram preparados a partir da reação entre [PdCl2(MeCN)2] e o ligante tiossemicarbazona (tsc) apropriado e 4-aminopiridina (4- NH2-Py). Estes complexos mono-PdL reagiram com [RuCl2(η6 -p-cimeno)]2 para produzir os complexos heterobimetálicos [{RuCl2(p-cimeno)}μ-{(4-NH2-Py)Pd(tsc)}] (Ru-PdL = Ru-PdMe , Ru-PdMe,Me e Ru-PdPh). Todos os complexos foram caracterizados por análise elementar, espectroscopia de FTIR, UV-Vis, RMN, voltametria cíclica e cálculos teóricos. Adicionalmente, mono-RuPip e RuPip -PdSc foram caracterizados por espectrometria de massas MALDI-TOF e mono-PdMe foi caracterizado por difração de raios X. Na avaliação catalítica, o complexo RuPip -PdSc polimerizou o norborneno (NBE) via ROMP e polimerização vinílica. Na ROMP de NBE, foram alcançados rendimentos de 68% para mono-RuPip e 31% para RuPip -PdSc ([NBE]/[Ru] = 3000, 5 μL EDA, 50 °C), produzindo poli(NBE) com massas molares na ordem de 104 g mol−1 e Ð entre 1,48 e 1,79. Na polimerização vinílica, usando MAO como cocatalisador, rendimento de 47,0% foi obtido para RuPip -PdSc e quantitativo para mono-PdSc ([Al]/[Pd] = 2500, [NBE]/[Pd] = 20000, 60 °C). Os complexos Ru-PdL foram testados como catalisadores bifuncionais na reação de Heck redutiva do norbornadieno (NBD) e na ROMP do fenilnorborneno (Ph-NBE). Esses complexos mostraram-se ativos para a reação de Heck redutiva, alcançando rendimentos superiores a 90% ([Pd]/[NBD]/[PhI] = 1/418/1344, 120 °C). Na ROMP de Ph-NBE, foram obtidos rendimentos em torno de 70% ([Ph-NBE]/[Ru PdL ] = 3000, VEDA = 300 μL, 50 °C, 30 min). O Ru-PdMe,Me catalisou com sucesso a síntese de poli(Ph-NBE) via catálise tandem assistida, alcançando 78% de rendimento.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Um estudo da natureza biobjetiva do problema de sequenciamento just-in-time flow shop(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-12) Assis, Nícolas Samuel; Rangel, Maria do Socorro Nogueira
; Fuchigami, Hélio Yochihiro ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Nessa tese é tratado o Problema de Sequenciamento em Just-In-Time Flow shop (JIT-FSP) com as medidas adiantamento total e atraso total. A natureza biobjetiva dessas medidas é deixada em segundo plano pela literatura ao tratar o problema de forma monoobjetiva, mostrando uma lacuna ainda inexplorada, sendo contribuir para fechar essa lacuna o principal objetivo dessa tese. Conceitos básicos sobre otimização multiobjetivo são apresentados, assim como, os métodos de solução exatos: epsilon-restrito, epsilon-restrito aumentando, caixa balanceada e branch-and-bound. Ferramentas matemáticas são propostas para analisar a solução da metodologia monoobjetivo dentro de uma perspectiva biobjetivo. Os métodos exatos são pouco explorados para resolver o JIT-FSP devido ao porte de problemas reais. Para contornar a dificuldade com o porte dos problemas reais, aplica-se o método de decomposição de Benders e são propostas 5 variações do método. Resultados do estudo computacional, 1100 execuções com tempos máximos de 3600 segundos em cada execução, mostraram que a metodologia utilizada pela literatura para resolver o JIT-FSP pode obter soluções indesejáveis para alguns cenários industriais. Além disso, evidencia-se as vantagens de utilizar a abordagem biobjetivo, chamando a atenção para a necessidade de utilizar métodos capazes de encontrar toda a fronteira de Pareto principalmente com o aumento do porte das instâncias. As variações do método de Benders mostraram um aumento no desempenho em relação ao método clássico, principalmente quando é utilizado uma busca em árvore única.PublicaçãoTese de doutorado Distribuição espaço-temporal de populações de tatus-galinha (Dasypus novemcinctus) em paisagens fragmentadas do Cerrado e Mata Atlântica(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-19) Costa, Rômulo Theodoro; Bianchi, Rita de Cassia
; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Esta tese aborda aspectos ecológicos do tatu-galinha (Dasypus novemcinctus) em paisagens com diferentes níveis de antropização nos biomas do Cerrado e da Mata Atlântica em uma paisagem no nordeste do estado de São Paulo. Os tatus desempenham papéis fundamentais na modificação do solo, dispersão de sementes e criação de refúgios para outras espécies, no entanto, enfrentam ameaças, incluindo a expansão urbana e o aumento da presença de espécies exóticas. O primeiro capítulo analisa como variáveis ambientais e características do solo influenciam a ocupação dos tatus em uma paisagens heterogêneas. Foram obtidas 48 detecções com maior probabilidade de ocupação em áreas próximas a cursos d’água e formações savânicas. Esses ambientes oferecem recursos essenciais para alimentação e escavação de tocas, enquanto a proximidade de estradas diminui a ocupação. O segundo capítulo investiga os padrões de atividade e a segregação temporal dos tatus na presença de cães domésticos (Canis familiaris) e predadores nativos, como jaguatiricas (Leopardus pardalis) e jaguarundis (Herpailurus yagouaroundi). Os tatus e as jaguatiricas apresentaram atividade noturna, enquanto cães e jaguarundis foram diurnos. Apesar de manterem sua atividade noturna, os tatus evitaram temporariamente áreas frequentadas por cães domésticos e jaguatiricas, aumentando o intervalo entre detecções nessas condições. O terceiro capítulo explora as interações entre tatus e cães domésticos utilizando modelos de ocupação multiespécies. A proporção de formações savânicas em uma escala de 850 metros foi a principal variável explicativa para a ocupação de ambas as espécies, mas com efeitos opostos: enquanto os tatus preferem esses habitats devido à facilidade de escavação e acesso a recursos, os cães domésticos tendem a ocupar áreas próximas a zonas urbanas. Os resultados destacam a importância de habitats savânicos com baixa perturbação antrópica. As interações negativas com cães domésticos reforçam a necessidade de controle populacional desses animais, restrições ao seu acesso a áreas naturais e conscientização ambiental. Esta pesquisa ressalta a relevância de estratégias de manejo que considerem atributos ambientais e o impacto de espécies exóticas para a conservação do tatu-galinha em paisagens fragmentadas.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Letramentos acadêmicos e desinformação: análise de competências de estudantes de Ensino Médio na apropriação de gêneros discursivos que simulam fato noticioso(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-19) Ciencia, Ana Cláudia Bertini; Komesu, Fabiana Cristina
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Este trabalho se insere no campo de discussão sobre os gêneros do discurso (Bakhtin, 2016) na articulação com os estudos de letramentos (Street, 1984; Corrêa, 2001, 2004; Fischer, 2007, 2010; Lea; Street, 2014; Fiad, 2015, 2022; Fiad; Lillis, 2022). Tem como objetivo principal investigar o fenômeno da desordem informacional (Wardle; Derakshan, 2017) em práticas sociais letradas acadêmicas de estudantes do Ensino Médio, considerando-se habilidades e competências linguístico-discursivas mobilizadas no processo de leitura de gêneros que simulam um fato noticioso compartilhado em contexto digital a partir de índices linguístico-discursivos que aparecem (ou não) no trabalho com o par enunciado-proposta e enunciado-resposta. A hipótese de partida é a de que o gênero discursivo “atravessa” a leitura e a avaliação e direciona os jovens leitores a julgarem determinado conteúdo como (in)verídico e (não) confiável. Esse atravessamento é marcado por aspectos constitutivos do gênero (construção composicional, conteúdo temático e estilo), pelo fato de sua avaliação ser endereçada a um outro e pelo imaginário que os estudantes têm da leitura e da constituição da escrita. A tese defendida indica o caráter normativo como aspecto preponderante na leitura e, consequentemente, como critério mais significativo que embasa a avaliação de conteúdo. O objetivo geral desdobra-se em outros, específicos: (i) analisar como índices de construção composicional, conteúdo temático e estilo de gêneros discursivos que simulam fato noticioso são tomados como critérios para avaliação de (in)veracidade; (ii) analisar o jogo de expectativas que emerge da relação entre escrevente e uma projeção de leitor, num diálogo com saberes e conhecimentos institucionalizados valorados na/pela escola (mas não somente), por meio do endereçamento dos enunciados. O conjunto do material é composto de 105 produções textuais coletadas em escola da rede pública estadual de uma cidade do interior do Estado de São Paulo, produzidas por alunos do 2º ano do Ensino Médio em resposta a uma atividade que os situava em contexto digital envolvendo (des)informação. A pesquisa se apóia no paradigma indiciário (Ginzburg, 1989) como procedimento de análise que privilegia a relevância do dado e suas relações sociais e históricas. Nos resultados, observa-se que foram tomados como critérios da avaliação do fato noticioso simulado aspectos da construção composicional e do conteúdo temático (66 e 47 respostas, respectivamente); o estilo, em contrapartida, é pouco mobilizado (apenas 05 respostas). Quanto ao endereçamento, ainda que se suponha que a família seja o interlocutor mais comum, considerando-se o enunciado-proposta, não foi o verificado, visto que em apenas dois enunciados empregou-se algum vocativo que indicasse que o texto estivesse sendo endereçado a um familiar. A partir da discussão das competências de leitura e escrita demonstradas pelos estudantes do Ensino Médio no atendimento (ou não) a expectativas institucionais socialmente reconhecidas e valorizadas no âmbito da desinformação, a pesquisa buscou contribuir ainda com o campo de estudos sobre a educação básica.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Avaliação dos efeitos antineoplásicos do extrato bruto e frações de folhas de Psidium guajava em linhagens celulares humanas de glioblastoma(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-11-05) Gomes, Isabella; Girol, Ana Paula ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Psidium guajava (goiaba) é uma árvore frutífera usada na medicina popular, por suas propriedades anti-inflamatórias, antidiarreicas e cicarizantes, entre outras. Investigações mostram efeitos antitumorais de compostos bioativos de P. guajava, mas há escassez de estudos que avaliam sua ação terapêutica no glioblastoma (GBM). O GBM é um tumor primário cerebral com baixa sobrevida e alta taxa de mortalidade, nesse sentido, a investigação de novos compostos que regulem a tumorigênese é estimulada. O objetivo deste projeto consistiu em padronizar o extrato de folhas de P. guajava e avaliar o potencial efeito antitumoral em linhagens celulares de GBM (A172 e U87-MG). As propriedades fitoquímicas e antioxidantes do extrato bruto (EB) de P. guajava e frações, foram submetidas a avaliações qualitativas, quantitativas e cromatografias em camada delgada (HPTLC) e líquida (HPLC); e avaliação de citotoxicidade por hemólise. Ensaios de proliferação e viabilidade foram realizados com fração acetato de etila (FAE), selecionada após as análises fitoquímicas, em células endoteliais (EA-hy 926) e tumorais (A172 e U87-MG). O potencial da FAE sobre proliferação, genotoxicidade, inflamação e invasão foi avaliado nas linhagens tumorais. A proteína antiapoptótica (BCL-2), pró-apoptótica (BAX) e metaloproteinases (MMP2 e MMP9) foram analisadas por Western blotting. As proteínas inibidoras do fator nuclear-κB (IKK), Tirosina-Proteína Quinases (JAK1 e JAK3), Proto-Oncogene (MDM2), ativador de transcrição 3 (STAT3) e anexina A1 (AnxA1) foram analisadas por imunocitoquímica. Os níveis de interleucina (IL-6) e interferon gama (INF-γ) foram quantificados no sobrenadante do lisado celular e no meio de cultivo. A análise da expressão gênica de TP53, NFkB e mTOR foi avaliada por RT-PCR. A análise cromatográfica confirmou a presença de Quercetina, Ácido Gálico, Catequina e Miricetina. O teste de hemólise indicou ausência de citotoxicidade nas concentrações testadas. Após os testes de viabilidade e citotoxicidade, determinou-sea concentração de 25% para A172 e 15% para a U87-MG em 24 horas. O tratamento com a FAE não alterou a morfologia das células endotelias e tumorais; no entanto, observou-se efeito inibitório da proliferação celular da linhagem A172 após o tratamento com FAE na concentração de 25% e nas linhagens U87-MG e EA-hy926 na concentração de 15% em 24 horas. Ainda, o tratamento com a FAE nas linhagens tumorais, A172 e U87-MG, promoveu danos significativos ao DNA. Em A172, o tratamento com FAE induziu INF-γ no sobrenadante do lisado; no entanto, reduziu nosobrenadante do meio de cultivo. Em U87-MG, o tratamento reduziu INF-γ no sobrenadante do lisado; bem como no sobrenadante do meio. O tratamento não alterou a expressão de IL-6 no sobrenadante do lisado celular em ambas as linhagens. Entretanto, houve redução de IL-6 no sobrenadante do meio de cultivo da A172; bem como aumento de IL-6 no sobrenadante do meio de cultivo da U87-MG. Nas células A172, a FAE induziu AnxA1; contudo, na linhagem U87-MG a FAE reduziu significativamente a expressão dessa proteína. A expressão de IKK foi aumentada em ambas as linhagens. A expressão de JAK1 e JAK3 foi reduzida em A172 e U87-MG. A expressão de MDM2, aumentou em A172 e reduziu em U87-MG. STAT3 aumentou em A172 e reduziu na U87-MG. No sobrenadante do lisado celular, a expressão de AnxA1 foi induzida em A172; no entanto, foi reduzida em U87-MG após o tratamento com FAE. BAX não foi alterada significativamente. MMP2 e MMP9 foram reduzidas em A172. A expressão proteica de MMP2 e MMP9 foi induzida em U87-MG. O tratamento com FAE reduziu a expressão dos genes mTOR, TP53 e NFkB nas linhagens A172 e U87-MG. FAE induziu a morte celular nas linhagens tumorais. O tratamento com a FAE inibiu a proliferação celular, induziu a apotose e regulou mediadores envolvidos na tumorigênese, com potencial para ser explorada em pesquisas futuras.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
Data augmentation in histopathological classification: an analysis exploring GANs with XAI-inspired models and vision transformers(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-12-05) Rozendo, Guilherme Botazzo; Neves, Leandro Alves
; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Redes Generativas Adversárias (GANs) criam imagens colocando um gerador (G) contra um discriminador (D), visando encontrar um equilíbrio entre eles. No entanto, alcançar esse equilíbrio é desafiador porque G é treinado com base em apenas um valor que representa a previsão de D, e apenas D pode acessar as características das imagens. Introduzimos uma nova abordagem para treinar GANs usando métodos baseados em Inteligência Artificial Explicável (XAI) para melhorar a qualidade e a diversidade das imagens geradas em conjuntos de imagens histopatológicas. Utilizamos os métodos baseados em XAI para extrair informações de características de D e incorporá-las em G por meio da função de perda, uma estratégia única ainda não explorada nesse contexto. Demonstramos que essa abordagem enriquece o treinamento com informações relevantes e promove uma melhor qualidade e maior variabilidade das imagens artificiais, diminuindo até 32,7% no Fréchet inception distance em comparação com métodos tradicionais. Na tarefa de aumento artificial de dados, essas imagens melhoram a precisão de classificação de modelos Transformer em até 3,81% em comparação com modelos sem aumento artificial de dados e até 3,01% em comparação com o aumento artificial de dados tradicional de GAN. Mostramos que o método de Saliency fornece a G as informações de características mais informativas. O modelo permitiu destacar o potencial de métodos inspirados em XAI para melhorar o treinamento de GANs com indicações relevantes para futuras explorações nesta área.PublicaçãoTese de doutorado Acesso Aberto
O significado social da regra variável de concordância verbal de terceira pessoa do plural e a construção de identidade em uma comunidade de Monte Azul Paulista - SP(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-11-26) Ghessi-Arroyo, Rafaela Regina.; Gonçalves, Sebastião Carlos Leite
; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Esta tese de doutorado enfoca a concordância verbal de terceira pessoa do plural (CV-3PP) como indexadora de significados sociais localmente construídos, articulando as dimensões da descrição e análise da produção linguística a uma abordagem etnográfica da crença, da percepção e da avaliação linguísticas. Desse modo, o objetivo principal desta tese é investigar a produção, as crenças, as avaliações e as percepções linguísticas de alunos de uma escola pública da cidade de Monte Azul Paulista (SP), diante do fenômeno variável de CV-3PP. Antes da entrada no universo de pesquisa, foram delimitados os instrumentos para a coleta de dados, com fundamentação: (i) na sociolinguística quantitativa (Labov, 2008 [1972]; Rubio, 2006, 2012); (ii) na abordagem qualitativa de cunho etnográfico (Erickson, 1986); (iii) no estudo da variação linguística como prática social (Eckert, 2000); (iv) em estudos sobre percepção e avaliação de variantes linguísticas na construção de identidade (Oushiro, 2015; Mendes, 2018; Sene 2022),; e (v) em estudos sobre o significado social da variação (Irvine, 2001; Oushiro, 2015; Gal, 2016; Mendes, 2018). Desse modo, os instrumentos de coleta de dados sistematizam: (a) observações participantes; (b) diários de pesquisa; (c) entrevistas; (d) questionários com inventários de crenças; (e) gravações de produção linguística; e (f) testes de avaliação e percepção linguísticas. Na presente pesquisa, parte-se das seguintes hipóteses: (i) a escola não consegue “silenciar” a identidade linguística e social de seus estudantes, porque reforçam a identidade do grupo do qual eles fazem parte, como legítimos construtores de significado social da variação; (ii) as percepções dos alunos não necessariamente coincidirão entre si, mas não serão aleatórias, visto que, apesar de não pertencerem a uma comunidade homogênea, possuem práticas sociais, usos e avaliações linguísticas semelhantes. Como resultados, evidenciamos que os estudantes demonstraram consciência de que o bairro em que residem é estigmatizado, localizado em uma região periférica e caracterizado por uma classe social baixa; no entanto não deixam de valorizar suas práticas, experiências e, principalmente, sua língua, de modo que demonstram uma resistência e um orgulho em relação às suas origens e identidades culturais. Os testes de produção, crenças, avaliação e percepção linguística destacam o sentimento de pertencimento e identidade, mostrando que, para eles, a variantes linguística não-padrão da CV-3PP são uma parte importante de quem são, sugerindo uma resistência ao estigma e uma valorização da diversidade cultural e destacando como a linguagem é um elemento fundamental na construção da identidade social.PublicaçãoTese de doutorado Taxonomy of Triportheidae Fowler (Teleostei: Ostariophysi: Characiformes)(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2024-11-01) Lopes, Douglas Alves; Carvalho, Fernando Rogério ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Triportheidae é uma família de Characiformes (Teleostei: Ostariophysi) recentemente erigida para incluir Agoniates, Clupeacharax, Engraulisoma, Lignobrycon e Triportheus, gêneros que historicamente foram classificados em Characidae ou Gasteropelecidae. A proposta para Triportheidae foi feita com base em dados moleculares e outras hipóteses recentes têm, em grande parte, corroborado essa classificação, embora diferentes relações internas sejam propostas a cada nova hipótese. Essa variação nas relações internas é, em parte, influenciada pela má definição dos gêneros e espécies classificados na família, que, entre muitos impasses, têm diagnoses pouco detalhadas, a maioria das quais não são definidas por sinapomorfias e incluem espécies ainda não descritas, o que dificultam o conhecimento da real diversidade do grupo, bem como de suas sinapomorfias. Nesta tese, é realizado um estudo taxonômico com o objetivo de redefinir gêneros e espécies atualmente classificados como Triportheidae, com base em morfometria, merística e osteologia. Nossos resultados indicam que Triportheidae inclui 26 espécies válidas, cinco delas (distribuídas em três gêneros), novas para a ciência. Nossos resultados também atualizam os diagnósticos de todos os cinco gêneros examinados, redescrições de 21 espécies, sinonimização de dois nomes específicos e descrições de variações morfológicas e de coloração em função do dimorfismo sexual secundário e ontogenia. Uma chave parapara a identificação atualizada é apresentada para Triportheus e recomendações para uma melhor compreensão da diversidade de alguns gêneros são comentadas.