Botucatu - IBB - Instituto de Biociências
URI Permanente para esta coleçãohttps://hdl.handle.net/11449/254549
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ItemTese de livre-docência Microbiologia de alimentos: condições higiênico-sanitárias e pesquisa de fatores de virulência de patógenos por técnicas clássicas e moleculares(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2012-03-08) Rall, Vera Lúcia Mores ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)ItemTese de livre-docência Produtos antimicrobianos naturais: potencial de uso na terapêutica das doenças infecciosas e como aditivos em alimentos(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2012) Fernandes Júnior, Ary ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)ItemTese de livre-docência A obra literária: ecologia de ambientes lóticos(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011-12-21) Uieda, Virginia Sanches ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)Not availableItemTese de livre-docência Construção, caracterização global e local de redes biológicas(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011-10-05) Lemke, Ney ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)A Biologia Sistêmica visa a compreensão da vida através de modelos integrativos que enfatizem as interações entre os diferentes agentes biológicos. O objetivo é buscar por leis universais, não nas partes componentes dos sistemas mas sim nos padrões de interação dos elementos constituintes. As redes complexas biológicas são uma poderosa abstração matemática que permite a representação de grandes volumes de dados e a posterior formulação de hipóteses biológicas. Nesta tese apresentamos as redes biológicas integradas que incluem interações oriundas do metabolismo, interação física de proteínas e regulação. Discutimos sua construção e ferramentas para sua análise global e local. Apresentamos também resultados do uso de ferramentas de aprendizado de máquina que nos permitem compreender a relação entre propriedades topológicas e a essencialidade gênica e a previsão de genes mórbidos e alvos para drogas em humanosItemTese de livre-docência Análise crítica de produção científica no tema de modelos matemáticos em dengue(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011) Ferreira, Cláudia Pio ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)Analisa-se diferentes aspectos da epidemiologia da transmissão da dengue através de modelos matemáticos. Supo˜e-se que o controle vetorial atua como uma taxa de mortalidade adicional em cada fase do ciclo de vida do mosquito Ae. aegypti e estuda-se a eficiência dos diferentes mecanismos utilizados pela Superintendência de Controle de Endemias (SUCEN) no estado de São Paulo para o controle da doença. A modelagem usual de equações diferencias ordinárias (EDO) permite a obtenção de valores limiares para a taxa de oviposição do vetor e para a transmissão da doença, as quais depende das suposições biológicas que geram o modelo, dos parâmetros entomológicos do mosquito, do período de incubação do vírus, e da imunidade e dinâmica vital do homem. Estes limiares dividem o espaço de solução em ausência do vetor, presença do vetor e ausência de transmissão da dengue, e presença do vetor com transmissão da dengue. Estes valores fornecem uma estimativa do esforço de controle necessário para diminuir ou parar a transmissão da dengue. A suposição de população vetorial grande com distribuição espacial homogênea (modelos de equações diferencias ordinárias discutidos anteriormente) é verificada através da modelagem discreta de autômatos celulares (AC). Mostra-se que a heterogeneidade espacial gerada pela distribuição de criadouros facilita a colonização e dispersão do inseto. Como os parâmetros entomológicos do vetor dependem da temperatura, observa-se que no verão o processo de dispersão e colonização do mosquito é facilitado, e que o controle adulticida deve ser aplicado nesta época. Já no inverno deve-se investir no controle das formas imaturas. A viabilidade da técnica de insetos estéries é...ItemTese de livre-docência Reguladores vegetais na superação da dormência, balanço hormonal e degradação de reservas em sementes de Annona diversifolia SAFF. e A. purpurea Moc. & Sessé Ex Dunal (Annonaceae)(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011-10-26) Ferreira, Gisela ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)As sementes de anonáceas são conhecidas por apresentarem mecanismos de dormência, o que dificulta a perpetuação das espécies e a formação de áreas produtivas para a exploração comercial. Deste modo, os objetivos deste trabalho foram estudar curva de aquisição de água; a germinação de sementes tratadas com GA3 e GA4+7 + Benziladenina; o balanço hormonal e a degradação de reservas em sementes de Annona diversifolia Saff e Annona purpurea Moc & Sessé ex Dunal tratadas com reguladores vegetais para a superação da dormência. Para tanto foram realizados três experimentos. Para a construção da curva de aquisição de água foram utilizadas 4 repetições de 25 sementes que foram mantidas em embebição e pesadas durante 480 horas. O segundo experimento foi constituído pela germinação das sementes tratadas com os reguladores vegetais; o delineamento experimental empregado foi o inteiramente casualizado com 4 repetições de 25 sementes por parcela em esquema fatorial 2 x 7 (reguladores x concentrações). Os tratamentos foram constituídos pelas combinações entre concentrações de GA3 e de GA4+7 + Benziladenina (GA4+7 + BA) x 0, 200, 400, 500, 600, 800 e 1000 mg L-1 i.a.. No terceiro experimento foram quantificados ABA (Ácido abscísico) e GA (Giberelinas), proteínas, açúcares...ItemTese de livre-docência Pesquisa de alguns marcadores de patogenicidade em Escherichia coli da microbiota entérica de pacientes com doença inflamatória intestinal(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011-11-30) Rodrigues, Josias ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)A doença inflamatória intestinal (DII) é um quadro patológico marcado pela ocorrência de lesões de gravidade variável ao longo do trato intestinal. Os sintomas se manifestam na forma de duas variantes clínicas distintas: retocolite ulcerativa (RU) e doença de Crohn (DC). A DC pode afetar qualquer parte do trato gastrintestinal (TGI), desde a boca até o ânus, podendo em casos raros, acometer tecidos extraintestinais. A RU restringe-se ao intestino grosso. A predisposição para seu desenvolvimento e a causa da doença dependem de múltiplos fatores, incluindo a Genética, dieta, tabagismo, imunidade e a microbiota intestinal. Sendo uma das bactérias dominantes entre os aeróbios facultativos do cólon intestinal, a Escherichia coli tem sido foco da maioria dos estudos relacionados à microbiota. Diferentes trabalhos têm demonstrado que estas bactérias são aumentadas em pacientes com DII. Considerando-se o peso do fator genético e que pouco ou nenhum estudo equivalente tem sido realizado com a população brasileira, a proposta deste trabalho consistiu na avaliação quantitativa de alguns grupos bacterianos, em diferentes materiais clínicos de pacientes com DII. Para isto, foi investigado um total de 110 pacientes do atendimento de rotina do HC/UNESP, distribuídos em 3 categorias: 52 controles, 20 portadores de DC e 38 portadores de RU. Os espécimes clínicos consistiram majoritariamente de biópsias do reto e, em menor número, de fezes e biópsias de outros segmentos da mucosa intestinal. Análise da variação na concentração bacteriana aplicada às espécimes de um subgrupo destes pacientes (24 controles, 17 portadores de RU e 14 de DC) revelou que, em geral, portadores de DII apresentam uma maior concentração média de bactérias Gram negativas, Gram positivas e de outros microrganismos em diferentes segmentos da mucosaItemTese de livre-docência Staphylococcus aureus e estafilococos coagulase-negativa: virulência, resistência aos antimicrobianos e epidemiologia molecular(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2012) Cunha, Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da ; Universidade Estadual Paulista (Unesp)