Análise da detecção de vírus respiratórios em águas residuais: foco no Vírus Sincicial Respiratório, Metapneumovírus e Rinovírus em São José do Rio Preto - SP

Abstract

As infecções respiratórias afetam o trato respiratório superior e inferior, representando a principal causa de mortalidade em crianças menores de cinco anos, idosos e indivíduos imunocomprometidos. O monitoramento de patógenos através do esgoto tem sido uma ferramenta valiosa para a vigilância epidemiológica de diversas enfermidades. O esgoto municipal reflete a composição de todos os indivíduos da localidade, permitindo a estimativa de surtos de infecções e a identificação dos patógenos presentes. Os vírus são os principais agentes causadores das doenças respiratórias, destacando-se o rinovírus (HRV), o metapneumovírus (HMPV), o vírus sincicial respiratório (HVSR), podendo ser disseminados através de fezes, catarro, muco e espirros, tornando-os detectáveis no esgoto doméstico. As amostras de esgoto bruto de São José do Rio Preto foram processadas e analisadas no RT-qPCR. No total, 110 amostras no período de julho de 2022 a julho de 2024, foram triadas para HMPV, HVSR, HRV e o vírus Pepper Mild Mottle Virus (PMMoV), utilizado como controle de recuperação de RNA viral. Para o PMMoV, 105/110 amostras foram positivas, indicando uma boa taxa de recuperação de RNA. Ademais, foram detectadas oito amostras positivas para HMPV, HRV e HVSR. Destas, cinco apresentaram-se positivas para HRV (uma em 2022, uma em 2023 e três em 2024), duas para o HVSR (uma em 2023 e uma em 2024) e uma positiva para o HMPV em 2023. Além disso, foi observada a detecção simultânea de uma amostra positiva para HRV e HMPV na mesma data de coleta. Portanto, a monitoramento de águas residuais pode ser uma ferramenta importante para complementar a vigilância clínica.

Respiratory infections affect the upper and lower respiratory tract and represent the main cause of mortality in children under five, the elderly and immunocompromised individuals. Monitoring pathogens through sewage has been a valuable tool for the epidemiological surveillance of various diseases. Municipal sewage reflects the composition of all individuals in the locality, allowing outbreaks of infections to be estimated and the pathogens present to be identified. Viruses are the main causative agents of respiratory diseases, especially rhinovirus (HRV), metapneumovirus (HMPV) and respiratory syncytial virus (VSR), which can be spread through feces, phlegm, mucus and sneezes, making them detectable in domestic sewage. The raw sewage samples from São José do Rio Preto were processed and analyzed using RT-qPCR. In total, 110 samples from July 2022 to July 2024, were screened for HPMV, HVSR, HRV and Pepper Mild Mottle Virus (PMMoV), used as a viral RNA recovery control. For PMMoV, 105/110 samples were positive, indicating a good RNA recovery rate. In addition, eight samples were found to be positive for HMPV, HRV and HVSR. Of these, five were positive for HRV (one in 2022, one in 2023 and three in 2024), two for HVSR (one in 2023 and one in 2024) and one was positive for HMPV in 2023. In addition, the simultaneous detection of a positive sample for HRV and HMPV on the same collection date was observed. Therefore, wastewater monitoring can be an important tool to complement clinical surveillance.