Publicação: Avaliação in silico da interação dos miR-612 e 637 envolvidos em carcinoma epidermoide de cabeça e pescoço
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Data
Orientador
Lisoni, Flávia Cristina Rodrigues 
Coorientador
Zanetoni, Juliana Prado Gusson
Pós-graduação
Curso de graduação
São José do Rio Preto - IBILCE - Ciências Biológicas
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Trabalho de conclusão de curso
Direito de acesso
Acesso restrito
Resumo
Resumo (português)
O carcinoma epidermoide de cabeça e pescoço (CECP) é um tipo agressivo de câncer que acomete a mucosa das vias aéreas superiores, sendo o quinto mais comum no Brasil e o sétimo no mundo, com mais de 325 mil mortes anualmente. Os principais fatores etiológicos para o CECP incluem o uso de álcool e/ou tabaco, má higiene bucal e infecções por cepas do papilomavírus humano. O desenvolvimento de tumores de cabeça e pescoço está intrinsecamente relacionado com diversos genes, microRNAs e vias metabólicas que se encontram diferencialmente expressas, mediando processos relevantes como proliferação, evasão da apoptose, invasão e metástase. Os microRNAs 612 e 637 são pequenas sequências não codificantes de RNA, que desempenham papéis na regulação da expressão gênica em diversos tipos de câncer, e vêm sendo associados à supressão tumoral. Este trabalho teve como objetivo analisar as interações gênicas de ambos os microRNAs em CECP utilizando ferramentas de bioinformática estrutural. Então, foram realizadas análises de predição de genes alvos de microRNAs pelo miRDB e TargetScan, identificação de genes diferencialmente expressos em CECP com o GEPIA 2, a construção de redes de interação proteína-proteína (RIPP) pelo STRING, a seleção de genes hubs, pelo Cytoscape e CytoHubba e o enriquecimento funcional GO e KEGG, empregando a ferramenta DAVID. Foram identificados 1322 possíveis genes alvos para os miRs de interesse, dentre eles, 266 apresentaram expressão diferencial. A partir das RIPP foi possível identificar 40 genes hubs, sendo metade deles diferencialmente expressos. A metodologia de enriquecimento funcional mostrou que os principais processos biológicos para os genes hubs foram regulação da transcrição gênica, angiogênese, migração celular, apoptose e ciclo celular, participando de vias gênicas de vários tipos de câncer, infecções virais, apoptose e junções celulares. Os resultados evidenciaram que os miR-612 e miR-637 alvejam genes significativamente participativos em processos carcinogênicos, revelando que eles podem ser objeto de futuras pesquisas que busquem entender os mecanismos moleculares no CECP.
Resumo (português)
The head neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is an aggressive cancer type that affects the mucosa of the upper respiratory tract, ranking as the fifth most common in Brazil and seventh worldwide, with over 325 thousand deaths occurring annually. The most important etiological factors for HNSCC are alcohol and/or tobacco usage, poor oral hygiene and infections by human papillomavirus strains. The development of head and neck tumors is intricately linked to various differentially expressed genes and metabolic pathways that mediate relevant processes such as proliferation, apoptosis evasion, invasion and metastasis. The microRNAs 612 e 637 are small non-coding RNA sequences that play an important role in the regulation of gene expression in various cancer types, in which they have been associated with tumor suppression. This study aimed to analyze the genetic interactions of both microRNAs in HNSCC using structural bioinformatics tools. Thus, analysis were conducted to prediction of microRNAs target genes using miRDB and TargetScan, identification of differentially expressed genes in HNSCC by GEPIA 2, construction of protein-protein interaction networks (PPI) with STRING, select hub genes within these networks with Cytoscape and its plugin CytoHubba and enrichment analysis GO and KEGG pathways employing the DAVID tool. A total of 1322 potential target genes for the miRs of interest were identified, 266 of them were differentially expressed. From within the PPI networks, 40 hub genes were identified, half of them were differentially expressed and half were not. The functional enrichment analysis revealed that the main biological processes for hub genes included the regulation of gene transcription, angiogenesis, cell migration, apoptosis, and cell cycle. These genes participate in genetic pathways that are related to various cancer types, viral infections, apoptosis and cell junctions. The results showed that miR-612 and miR-637 target genes that are significantly involved in carcinogenic processes, indicating that they could be the focus of future research aimed at understanding the molecular mechanisms in HNSCC.
Descrição
Palavras-chave
Câncer de cabeça e pescoço, MicroRNAs, Bioinformática, Biomarcadores, Oncogenes, Head neck cancer, Bioinformatics, Biomarkers
Idioma
Português
Como citar
Custódio, Lucas Henrique Francisco. Avaliação in silico da interação dos miR-612 e 637 envolvidos em carcinoma epidermoide de cabeça e pescoço. (Trabalho de Conclusão de Curso – Ciências Biológicas). - Universidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas (Ibilce), São José do Rio Preto, 2023.
