Abordagem in-sílico para seleção de miRNAs relacionados a carne de Tilápia para fins de melhoramento genético.

Abstract

O melhoramento genético proporciona aumento na produtividade em diversas áreas, devido a seleção convencional e a organismos geneticamente modificados (OGMs). A maioria dos animais melhorados e linhagens de peixes “melhoradas” tem origem por “seleção convencional” o que é mais dispendioso, tanto em tempo como financeiro. Usando ferramentas de bioinformática (gprofiler, Weka, R entre outros) e banco de dados (Ensembl, KEGG, NCBI), foram realizadas análises de dados de transcriptoma provenientes da tilápia do nilo (Oreochromis niloticus), usando o sistema operacional Linux. Dentre mais de 15.000 miRNAs provenientes dos dados analisados, foi selecionado um miRNA, sendo ele o miR-214-3p atuante em 3 vias metabólicas de interesse no presente trabalho, ao mesmo tempo: mTOR/Akt, via Hippo e Ubiquitin Ligase todas relacionadas ao crescimento e desenvolvimento muscular.

The genetic improvement due to conventional selection and genetically modified organisms (OGMs) generates an increase in productivity on several areas. Most of the “improved” animals and fish lineages originate from “conventional selection”, which is costlier: both in time and financially. Using tools from Bioinformatics (g:Profiler, Weka, R, amongst others) and various data banks (Ensembl, KEGG, NCBI), data analyses of transcriptome from Nile tilapia (Oreochromis niloticus) using the Linux operational system. Amongst more than 15,000 miRNAs a miRNA was selected, being the miR-214-3p active being active on 3 pathways of interest in the present work: mTOR/Akt, Hippo and Ubiquitin Ligase, all related to muscle development and growth.