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Padrões de metilação do DNA no músculo esquelético na fase de desmama de bovinos da raça Nelore submetidos a diferentes protocolos de desmama

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Advisor

Pereira, Guilherme Luis

Coadvisor

Curi, Rogério Abdallah
Torrecilhas, Juliana Akamine

Graduate program

Ciência Animal - FCAV

Undergraduate course

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Universidade Estadual Paulista (Unesp)

Type

Master's thesis

Access right

Acesso abertoAcesso Aberto

Abstract

Abstract (portuguese)

O manejo da desmama precoce seguido de suplementação energética pode levar a alterações metabólicas no bezerro, causando efeitos em longo prazo na saúde e no desempenho do animal. Acredita-se que a principal base para essas adaptações metabólicas são mecanismos epigenéticos que regulam, ativam ou silenciam genes em diferentes estágios de desenvolvimento e/ou em resposta a diferentes estímulos ambientais. Comparando o perfil de metilação do músculo esquelético Longissimus thoracis de Bos indicus aos 205 dias de idade de animais desmamados de forma precoce e convencional (120 e 205 dias de idade, respectivamente), pode-se perceber maior nível de metilação do DNA no genoma dos animais do grupo precoce. Ao todo, foram encontradas 481 DMRs, com cerca de 52% (250) de regiões hipermetiladas e 48% (231) de hipometiladas. A análise de enriquecimento funcional considerou genes diferencialmente metilados (DMG) e expressos (DEGs)(n=53). Os principais termos e vias enriquecidas foram associadas a sinalização de cAMP (monofosfato de adenosina 3'-5' cíclico) e metabolismo lipídico. Os genes AKT1, ADCY3 e PPARD foram os mais associados a adipogênese e lipogênese, sugerindo um papel importante desses genes na deposição de gordura na carne de animais desmamados de forma precoce seguido de suplementação.

Abstract (english)

Early weaning management followed by energy supplementation can lead to metabolic changes in the calf, causing long-term effects on the animal's health and performance. It is believed that the main basis for these metabolic adaptations are epigenetic mechanisms that regulate, activate or silence genes at different stages of development and/or in response to different environmental stimuli. Comparing the methylation profile of the skeletal muscle Longissimus thoracis of Bos indicus at 205 days of age of animals weaned early and conventionally (120 and 205 days of age, respectively), a higher level of DNA methylation can be seen in the genome of animals from the early group. A total of 481 DMRs were found, with around 52% (250) hypermethylated and 48% (231) hypomethylated regions. The functional enrichment analysis considered differentially methylated genes (DMGs) and differentially expressed genes (DEGs) (n=53). The main terms and pathways enriched were associated with cAMP (3'-5'-cyclic adenosine monophosphate) signaling and lipid metabolism. The AKT1, ADCY3 and PPARD genes were the most associated with adipogenesis and lipogenesis, suggesting an important role for these genes in fat deposition in the meat of early-weaned animals followed by supplementation.

Description

Keywords

Epigenética, Genética animal, Carne bovina

Language

Portuguese

Citation

TINOCO, G.L.B - Padrões de metilação do DNA no músculo esquelético na fase de desmama de bovinos da raça Nelore submetidos a diferentes protocolos de desmama - 2024, 62f - Dissertação (Mestrado em Ciência Animal) - Universidade Estadual Paulista, Jaboticabal, 2024.

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Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias
FCAV
Campus: Jaboticabal


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