O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas

Abstract

O objetivo deste trabalho é estudar o efeito do solvente na conformação de cadeias poligacturônicas ácidas. Primeiramente, calculamos a energia conformacional dos dímeros GalAH - GalA, GalAH - GalAh, GalA - GalA - GalAH e GalA - GalA sem a contribuição do solvente e, em seguida, adicionamos à energia conformacional a energia de solvatação. Duas aproximações foram consideradas para o termo de solvatação. Os mapas das energias conformacionias são então utilizados para gerar cadeias com até 300 monômeros, definindo, a priori, a porcentagem de resíduos carregados. A influência da solvatação nas propriedades conformacionais da cadeia é discutida com base nos valores encontrados para a razão característica e o comprimento de persistência. Alguns resultados obtidos teoricamente são comparados a dados experimentais