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GALANT: a Cytoscape plugin for visualizing data as functional landscapes projected onto biological networks

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Data

2013-10-01

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Pós-graduação

Curso de graduação

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Editor

Oxford University Press

Tipo

Artigo

Direito de acesso

Acesso restrito

Resumo

Network-level visualization of functional data is a key aspect of both analysis and understanding of biological systems. In a continuing effort to create clear and integrated visualizations that facilitate the gathering of novel biological insights despite the overwhelming complexity of data, we present here the GrAph LANdscape VisualizaTion (GALANT), a Cytoscape plugin that builds functional landscapes onto biological networks. By using GALANT, it is possible to project any type of numerical data onto a network to create a smoothed data map resembling the network layout. As a Cytoscape plugin, GALANT is further improved by the functionalities of Cytoscape, the popular bioinformatics package for biological network visualization and data integration.

Descrição

Palavras-chave

Idioma

Inglês

Como citar

Bioinformatics. Oxford: Oxford Univ Press, v. 29, n. 19, p. 2505-2506, 2013.

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