Análise da diversidade da microbiota intestinal de roedores procedentes de biotério de produção
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Pós-graduação
Curso de graduação
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Editor
Universidade Estadual Paulista (UNESP)
Tipo
Relatório de pós-doc
Direito de acesso
Acesso restrito
Resumo
Resumo (português)
Roedores de laboratório constituem o principal modelo experimental em pesquisa biomédica, e a microbiota intestinal desses animais é reconhecida como fonte relevante de variabilidade experimental. Colônias de produção brasileiras, entretanto, permanecem pouco caracterizadas. Descrevemos aqui a diversidade e a composição bacteriana de amostras fecais de cinco linhagens mantidas em um biotério de produção, utilizando sequenciamento do gene 16S rRNA. As bibliotecas foram construídas a partir da amplificação da região V3–V4. Foram analisadas amostras de ratos (Rattus norvegicus) das linhagens SHR, Wistar e Sprague-Dawley e de camundongos (Mus musculus) das linhagens Swiss-Webster e C57BL/6, de ambos os sexos, com idade entre 0 e 12 meses. A comunidade bacteriana dos ratos foi mais diversa e rica que a dos camundongos, e as duas espécies apresentaram composições distintas em todas as métricas de diversidade beta avaliadas. Bacteroidota predominou nos camundongos, enquanto Bacillota foi predominante nos ratos, evidenciando uma mudança no padrão de dominância desses dois filos entre as espécies. Muribaculaceae foi o táxon dominante no conjunto de amostras, com 46,7% de abundância relativa nos camundongos e 15,4% nos ratos. Sequências de Akkermansia foram detectadas em todas as amostras da linhagem Wistar, com abundância entre 18,9% e 65,2%, e estiveram ausentes em ambas as linhagens de camundongo. A linhagem isogênica C57BL/6 apresentou a maior dispersão das amostras, com tendência à formação de dois agrupamentos distintos. Quanto ao sexo não foi observado efeito em nenhuma das análises. Este estudo contribui para a caracterização da microbiota basal de animais provenientes de uma colônia de biotério de produção no Brasil, gerando informações que podem subsidiar o monitoramento da instalação e contribuir para o planejamento, a interpretação e o desenvolvimento de futuras investigações com esses animais.
Resumo (inglês)
Laboratory rodents are the primary experimental models in biomedical research, and their intestinal microbiota is recognized as an important source of experimental variability. However, Brazilian production colonies remain poorly characterized. Here, we describe the diversity and bacterial composition of fecal samples from five rodent strains maintained in a production animal facility using 16S rRNA gene sequencing. Libraries were constructed by amplifying the V3–V4 region. Samples were analyzed from rats (Rattus norvegicus) of the SHR, Wistar, and Sprague-Dawley strains and mice (Mus musculus) of the Swiss-Webster and C57BL/6 strains, including both sexes and animals aged 0–12 months. The bacterial community of rats was more diverse and richer than that of mice, and the two species exhibited distinct compositions across all beta diversity metrics evaluated. Bacteroidota predominated in mice, whereas Bacillota was predominant in rats, indicating a shift in the dominance patterns of these two phyla between species. Muribaculaceae was the dominant taxon across the sample set, with a relative abundance of 46.7% in mice and 15.4% in rats. Akkermansia sequences were detected in all samples from the Wistar strain, with abundances ranging from 18.9% to 65.2%, and were absent from both mouse strains. The inbred C57BL/6 strain exhibited the greatest sample dispersion, with a tendency toward the formation of two distinct clusters. No effect of sex was observed in any of the analyses. This study contributes to the characterization of the baseline microbiota of animals from a production colony in Brazil, providing information that may support facility monitoring and contribute to the planning, interpretation, and development of future investigations involving these animals.
Descrição
Idioma
Português
Citação
ARBEX, Ana Paula Oliveira. Análise da diversidade da microbiota intestinal de roedores procedentes de biotério de produção. 2026. Relatório (Pós-doutorado) - Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Botucatu, 2026.
