RSS 1.0Teses - Biofísica Molecular - IBILCE
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Submissões recentes
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Preparação e caracterização físico-química de novos metalossilicatos contendo ítrio e cobalto
(Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2018) [Tese de doutorado]Os materiais de estrutura mista, dentre eles materiais contendo ítrio e cobalto em sua estrutura, têm sido estudados a partir do final da década de 80 e suas aplicações vêm sendo descobertas e aprimoradas desde então. Em ... -
Estudo por dinâmica molecular e ressonância magnética nuclear de Viroporinas: análise da estrutura e do mecanismo de portão da proteína SH (HRSV) e da proteína M2 (vírus Influenza)
(Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2018) [Tese de doutorado]As proteínas SH do HRSV e M2 do IAV são membros das viroporinas, uma família de proteínas virais pequenas de membrana. A proteína SH tem 64 resíduos de aminoácidos e uma estrutura pentamérica composta por alfa-hélice ... -
Métodos para visualização de superfície de energia do enovelamento de proteínas
Oliveira Junior, Antonio Bento de
(Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
O enovelamento de proteínas acontece em um espaço de fase multidimensional, onde o número conformações possíveis é exponencialmente alta. Uma forma comum de representar essas conformações é utilizar uma coordenada de reação ... -
Caracterização espectral e computacional da interação de derivados de benzoil-tiraminas e albumina humana São José do Rio Preto 2017
Camargo, Cintia Ramos (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
A folha de louro verde brasileira, uma especiaria muito apreciada na cozinha local (Aniba riparia, Lauraceae), contém compostos químicos que apresentam derivados de benzoíla chamados riparinas, que possuem propriedades ... -
Estudo das interações eletrostáticas em superfícies e macromoléculas por meio de simulações de Monte Carlo
Caetano, Daniel Lucas Zago (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
Este trabalho tem por objetivo estudar, por meio de simulações computacionais baseadas no método de Monte Carlo, interações eletrostáticas em superfícies e macromoléculas. Na primeira parte deste estudo é abordada a interação ... -
Efeito das interações eletrostáticas e de pH no enovelamento e estabilidade de proteínas
Oliveira, Vinícius Martins de (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
As interações eletrostáticas desempenham um papel crucial no enovelamento de proteínas. Além disso, essas interações entre resíduos carregados são fundamentais para a estabilidade proteica e para que as proteínas realizem ... -
Sínteses e caracterizações de cromosilicatos e sua aplicação como catalisadores na reação de conversão do glicerol em produtos de química fina
Luizon Filho, Roberto Antonio (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
A conversão de glicerol em produtos de maior valor econômico tornou-se atrativa devido à grande produção deste composto na indústria de biodiesel, onde ele é gerado como co-produto. As zeólitas (aluminosilicatos) e os ... -
Estudo da interação de cumarinas e proteína envolvida na doença inflamatória intestinal por ressonância magnética nuclear
Benzatti, Fernanda Paulin (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
A Doença Inflamatória Intestinal (DII) é um conjunto de desordens inflamatórias, crônica e, até o momento, sem cura do trato gastrointestinal. Engloba principalmente a doença de Cohn e a retocolite ulcerativa, que podem ... -
Síntese, caracterização e transfecção in vitro mediada por nanopartículas de diisopropiletilamina e dietilaminoetil-quitosana: efeito da massa molar na liberação de RNA de interferência
Souza, Ricchard Hallan Félix Viegas de (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2017) [Tese de doutorado]
A quitosana, polímero catiônico de origem natural, biocompatível, biodegradável e de baixa toxicidade vem sendo largamente estudada e utilizada no desenvolvimento de vetores não-virais para uso em terapia gênica. Nesse ... -
Estudo de interação dos flavonóides Isovitexina e 2-Fenilcromona com a Albumina do Soro Humano: abordagem experimental e computacional
Caruso, Ícaro Putinhon (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016) [Tese de doutorado]
Os flavonóides fazem parte de uma ampla classe de compostos polifenólicos os quais ocorrem naturalmente nas plantas e podem ser encontrados nas sementes, caules, folhas, flores e/ou frutos. Estudos recentes indicam que ... -
Estudo de interações eletrostáticas no processo de enovelamento e na estabilidade de proteínas utilizando modelos simplificados
Contessoto, Vinícius de Godoi (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016) [Tese de doutorado]
Entender a contribuição das interações eletrostáticas no processo de enovelamento e na estabilidade do estado nativo de proteínas é de grande relevância em biofísica molecular. Este trabalho possui duas frentes de estudos. ... -
Síntese, caracterização e aplicação de estanhosilicatos como catalisadores heterogêneos para produção de biocombustíveis
Silva, Danilo Antonio da (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016) [Tese de doutorado]
O principal objetivo desse trabalho foi a síntese, caracterização e aplicação de catalisadores heterogêneos para produção de biocombustíveis, especificamente a produção de biodiesel (ésteres metílicos e etílicos de ácidos ... -
Estudo da formação de domínios em membranas modelos induzidos por peptídeos antimicrobianos e sua ação interfacial
Alvares, Dayane dos Santos (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016) [Tese de doutorado]
Peptídeos antimicrobianos agem diretamente na matriz lipídica da membrana celular perturbando o empacotamento lipídico, criando tensões elásticas e desequilíbrio de massa, que são relaxados pela formação de poros ou defeitos ... -
Estudos computacionais de esfingomielinases D: docking, dinâmica molecular e métodos híbridos QM/MM
Silva, Luciane Sussuchi da (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
Sphingomyelinases D (SMase D) are enzymes that catalyze sphingomyelin in ceramida-1-fosfate and choline. This activity is only found in Loxosceles brown spiders and Corynebacterium pathogenic bacterias. SMase D, or ... -
Production, characterization and structural analysis of proteins from Corynebacterium pseudotuberculosis and snake venoms
Masood, Rehana (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
Corynebacterium pseudotuberculosis (C. pseudotuberculosis) is the etiological agent of Caseous Lymphadenitis (CLA), a disease that affects different groups of animals worldwide, specifically sheep and goat production areas, ... -
Sínteses e caracterizações de materiais microporosos com estrutura cristalográfica mista e suas aplicações como catalisadores em reações de conversão de biomassa em produtos de química fina
Paula, Alex Silva (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
New synthetic routes based on sol-gel chemistry were developed in order to synthesize new octahedral-tetrahedral microporous materials containing transition metals in their framework. Metal transitions such as zirconium, ... -
Confinamento das moléculas H2 e O2 como modelo para o estudo da ligação ligante-sítio ativo em macromoléculas biológicas
Silva, Fabrício Ramos (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2014) [Tese de doutorado]
This works presents the energy eigenvalues for the bonds of hydrogen and oxygen molecules, both confined in elliptical cavities. Those systems are also studied without confinement. The results are obtained through the ... -
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
Polotto, Franciele (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
This work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical ... -
Predição de sítios de ligação para a cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio
Anjos, Flávio Almeida Curvelo dos (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
Platinum compounds are very important to treatment of various malignant tumors. However, prediction of platinum-binding sites is very hard to be made. Herein, a study in silico provides an understanding of the molecular ... -
Aplicação da equação de Fokker-Planck no estudo de canais iônicos
Araújo, Marcelo Tozo de (Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015) [Tese de doutorado]
This work focus on the use of the Fokker-Planck equation (FPE) to describe the diffusion through ionic channels located in the cell membrane. The channels are responsible by the control of the ionic chemical equilibrium ...