Mapeamento genético e identificação de marcadores aflp, microssatélites genômicos e funcionais associados a parâmetros agroindustriais em cana-de-açúcar

Abstract

O objetivo deste trabalho foi construir um mapa de ligação e identificar marcadores associados aos componentes de produção (diâmetro, peso, altura, número de perfilhos e TCH) e parâmetros de qualidade (Fibra, Brix e Pol%Cana), em uma progênie derivada cruzamento entre o clone IACSP95-3018 e a cultivar IACSP93-3046, desenvolvidas pelo Programa de Melhoramento Cana IAC. Para tanto, foram utilizados marcadores moleculares do tipo AFLP e microssatélites genômicos e derivados de ESTs. A progênie mostrou grande variabilidade genética tanto para os componentes de produção quanto aos parâmetros de qualidade. O mapa de ligação foi composto por 231 marcadores segregando em dose única, distribuídos em 72 grupos de ligação (GL) que deram origem a dez grupos de homologia, com cobertura de 2436 centiMorgans (cM) e distância média entre marcadores de 10,55 cM, com distribuição irregular ao longo do cromossomo. O comprimento dos GLs variou de 1 a 96 cM. Os marcadores em dose única foram utilizados na análise de marcas simples para a identificação de prováveis QTLs associados às características fenotípicas obtidas em cana planta e cana soca. Um total de 155 associações marcador/característica foi encontrado a p<0,05 para as oito características avaliadas e 84 foram mapeadas em 34 GLs, sendo que apenas 16 foram observadas nos dois anos da cultura para a mesma característica

The objective of this study was to construct a linkage map and identify markers associated with yield components (diameter, weight, height, stalk number and productivity) and quality parameters (Brix, Fiber and Pol%Cana), in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95-3018 and the variety IACSP93-3046, both developed from the IAC Sugarcane Breeding Program. We used molecular markers AFLP and genomic and derived from ESTs microsatellites. The progeny showed high genetic variability for both yield components and quality parameters. The genetic map was composed by 231 single markers dose, distributed onto 72 linkage groups (LG) which resulted in ten homology groups, with coverage 2436 centiMorgans (cM) and average distance between markers of 10.55, with irregular distribution along the chromosome. The length of the LG raging from 1 to 96 cM. Single marker trait association analysis was performed with the single dose markers to identify putative QTLs associated with the phenotypic measures obtained at cane plant and ratoon cane. A total of 155 marker/trait association was detected at p<0.05 for the eight traits evaluated and 84 were mapped in 34LGs, and only 16 were observed in both cycles for the same trait