Alternative genotyping method for the single nucleotide polymorphism A2959G (AF159246) of the bovine CAST gene

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dc.contributor.authorCuri, Rogerio Abdallah [UNESP]
dc.contributor.authorChardulo, Luis Artur Loyola [UNESP]
dc.contributor.authorSilveira, Antonio Carlos [UNESP]
dc.contributor.authorOliveira, Henrique Nunes de [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2013-09-30T18:27:05Z
dc.date.accessioned2014-05-20T13:40:30Z
dc.date.available2013-09-30T18:27:05Z
dc.date.available2014-05-20T13:40:30Z
dc.date.issued2008-05-01
dc.description.abstractO objetivo deste trabalho foi genotipar o polimorfismo de nucleotídeo único (single nucleotide polymorphism - SNP) A2959G (AF159246) do gene CAST bovino, pela técnica de PCR-RFLP, e reportar a sua utilização pela primeira vez. Para tanto, 147 animais Bos indicus e Bos taurus x Bos indicus foram genotipados. A acurácia do método foi confirmada por meio do seqüenciamento direto de produtos de PCR de nove indivíduos. A menor freqüência do alelo A, favorável à maciez da carne, foi confirmada nos animais Bos indicus. O uso da PCR-RFLP, para a genotipagem do SNP do gene CAST bovino, mostrou-se consistente e de baixo custo, o que permite a sua análise por laboratórios dotados de estrutura básica.pt
dc.description.abstractThe objective of this work was to genotype the single nucleotide polymorphism (SNP) A2959G (AF159246) of bovine CAST gene by PCR-RFLP technique, and to report its use for the first time. For this, 147 Bos indicus and Bos taurus x Bos indicus animals were genotyped. The accuracy of the method was confirmed through the direct sequencing of PCR products of nine individuals. The lowest frequency of the meat tenderness favorable allele (A) in Bos indicus was confirmed. The use of PCR-RFLP for the genotyping of the bovine CAST gene SNP was shown to be robust and inexpensive, which will greatly facilitate its analysis by laboratories with basic structure.en
dc.description.affiliationUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição Animal
dc.description.affiliationUnesp Instituto de Biociências Departamento de Química e Bioquímica
dc.description.affiliationUnespUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição Animal
dc.description.affiliationUnespUnesp Instituto de Biociências Departamento de Química e Bioquímica
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
dc.format.extent657-659
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2008000500014
dc.identifier.citationPesquisa Agropecuária Brasileira. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira, v. 43, n. 5, p. 657-659, 2008.
dc.identifier.doi10.1590/S0100-204X2008000500014
dc.identifier.fileS0100-204X2008000500014.pdf
dc.identifier.issn0100-204X
dc.identifier.lattes3514713413919126
dc.identifier.lattes9820754011277263
dc.identifier.orcid0000-0001-6289-0406
dc.identifier.scieloS0100-204X2008000500014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/14066
dc.identifier.wosWOS:000257020300014
dc.language.isoeng
dc.publisherEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
dc.relation.ispartofPesquisa Agropecuária Brasileira
dc.relation.ispartofjcr0.546
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceSciELO
dc.subjectgene da calpastatinapt
dc.subjecttextura da carnept
dc.subjectPCR-RFLPpt
dc.subjectSNPpt
dc.subjectcalpastatin geneen
dc.subjectmeat textureen
dc.subjectPCR-RFLPen
dc.subjectSNPen
dc.titleAlternative genotyping method for the single nucleotide polymorphism A2959G (AF159246) of the bovine CAST geneen
dc.title.alternativeMétodo alternativo de genotipagem do polimorfismo de nucleotídeo único A2959G (AF159246) do gene CAST bovinopt
dc.typeArtigo
unesp.author.lattes9820754011277263
unesp.author.lattes3514713413919126[1]
unesp.author.orcid0000-0001-6289-0406[1]
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Botucatupt

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