Identificação molecular de espécies da Subfamília Corydoradinae (Siluriformes: Callichthyidae)

dc.contributor.advisorOliveira, Claudio de [UNESP]
dc.contributor.authorMaia, Gláucia Maria Garcia [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2015-01-26T13:21:24Z
dc.date.available2015-01-26T13:21:24Z
dc.date.issued2014-04-22
dc.description.abstractThe subfamily Corydoradinae with a total of 183 valid species, and includes, among Aspidoras, Brochis and Scleromystax, the genus Corydoras, the largest among the Siluriformes and very well known in the aquarium hobby. Callichthyidae have a wide geographical distribution, occurring from rivers of the Pacific slope, in Panama, to the basin of the La Plata River in eastern Argentina. Considering the promising use of DNA barcode to species identification, the present study aimed to test the hypothesis that it is possible to molecularly identify the species of Corydoradinae, using the technique of DNA barcoding and with the data generated to create a database to allow molecular identification of the specimens studied. Partial sequences of COI were obtained for 610 specimens, representing 94 species. A total of 80 species (85%) were discriminated correctly with DNA barcoding, and most species exhibited low intra-specific genetic distances, approximately 30 times smaller than the distance between congeneric species. Seven pairs of species showed less than 2% divergence between them, due to a relevant morphological similarity and therefore difficult to identify to species level. This study showed that the species of the subfamily Corydoradinae analyzed, could be identified efficiently by using barcode generating data that can provide information for further studies of this faunaen
dc.description.abstractA subfamília Corydoradinae possui um total de 183 espécies válidas, incluindo os gêneros Aspidoras, Brochis, Scleromystax e Corydoras, o maior entre os Siluriformes e muito conhecido em aquariofilia. Os Callichthyidae apresentam uma ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde rios da vertente do Pacífico, no Panamá, até a bacia do rio da Prata, no leste da Argentina e, além disto, ocorrem em vários ambientes, incluindo grandes rios de água rápida e bem oxigenada até pequenos riachos de água quase parada e estagnada, e mesmo poças de água ácida no interior de florestas. Considerando o uso promissor do DNA barcode para a identificação de espécies, o presente trabalho testou a hipótese de que é possível identificar molecularmente as espécies de um grupo especioso de peixes, no caso a subfamília Corydoradinae, utilizando a técnica de DNA barcoding e, os dados gerados foram disponibilizados ao banco de dados internacional. Sequências parciais do COI foram obtidas para 610 espécimes, representando 94 espécies. Um total de 80 espécies (85%) foi discriminado corretamente com o DNA barcoding, sendo que a maioria das espécies exibiu baixas distâncias genéticas intraespecíficas, cerca de 30 vezes menor que a distância entre espécies congenéricas. Sete pares de espécies apresentaram divergência menor que 2% entre elas, o que pode estar relacionado com à grande similaridade morfológica e, portanto a difícil identificação em nível de espécie. Este estudo evidenciou que as espécies da subfamília Corydoradinae analisadas, puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode gerando dados que podem fornecer subsídios para estudos posteriores desta faunapt
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.format.extent59 f.
dc.identifier.aleph000797010
dc.identifier.capes33004064012P8
dc.identifier.citationMAIA, Gláucia Maria Garcia. Identificação molecular de espécies da Subfamília Corydoradinae (Siluriformes: Callichthyidae). 2014. 59 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.
dc.identifier.file000797010.pdf
dc.identifier.lattes0297419882161114
dc.identifier.orcid0000-0002-4143-7212
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/113946
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceAleph
dc.subjectPeixe de agua docept
dc.subjectIctiofaunapt
dc.subjectPeixe - Geneticapt
dc.subjectPeixe - Identificaçãopt
dc.subjectIchthyofaunapt
dc.titleIdentificação molecular de espécies da Subfamília Corydoradinae (Siluriformes: Callichthyidae)pt
dc.typeDissertação de mestrado
unesp.advisor.lattes0297419882161114
unesp.advisor.orcid0000-0002-4143-7212
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências, Botucatupt
unesp.graduateProgramCiências Biológicas (Zoologia) - IBBpt
unesp.knowledgeAreaZoologiapt
unesp.researchAreaGenética animalpt

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