Análise dos DNAs repetitivos de Ceraeochrysa claveri (Neuroptera), uma abordagem citogenômica
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Data
Autores
Orientador
Cabral-de-Mello, Diogo Cavalcanti 
Coorientador
Bardella, Vanessa Bellini
Pós-graduação
Ciências Biológicas (Biologia Celular, Molecular e Microbiologia) - IB
Curso de graduação
Título da Revista
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Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Dissertação de mestrado
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
Resumo (português)
As DNAs satélites (satDNAs), conhecidos por seus papéis significativos na estruturação e evolução do genoma, foram caracterizados em oito espécies de Chrysopidae utilizando abordagens genômicas e bioinformáticas. Além disso, o cariótipo de Ceraeochrysa claveri foi caracterizado em detalhes, revelando a constituição comum observada em Neuroptera, 2n=12,XY. Para o grupo, é a primeira vez que a distribuição da heterocromatina é descrita, com ocorrência de blocos pericentroméricos. O mapeamento do DNA ribossômico maior (rDNA) foi divergente das poucas outras espécies de neurópteros estudadas, evidenciando o dinamismo deste agrupamento no grupo. Quanto aos satelitomas, mapeamos as satDNAs por meio do mapeamento cromossômico usando Hibridização in situ Fluorescente (FISH) e CHRISMAPP em Ceraeochrysa claveri e Chrysopa pallens, respectivamente. O impacto das satDNAs na organização do genoma dos neurópteros é variável, já que diferentes números de satDNAs foram identificados, variando de uma única satDNA até 23 famílias de satDNA. Além disso, a quantidade total de satDNAs também foi bastante variável, representando de cerca de 2,5% a 21,55% do genoma. Curiosamente, observamos uma alta renovação da biblioteca de satDNA entre as espécies, sugerindo o surgimento frequente e a eliminação total de repetições de forma independente, contrariando a hipótese da biblioteca. O mapeamento físico desses repetições nos cromossomos de C. claveri e C. pallens forneceu informações detalhadas sobre sua distribuição genômica, revelando a acumulação das principais satDNAs na eucromatina. Nossos dados fornecem insights iniciais sobre a organização do genoma de DNAs satélites (satDNAs) entre os Neurópteros, contribuindo para o entendimento dessas repetições nos genomas de insetos. Esses achados auxiliarão pesquisas futuras sobre montagem de genomas e a evolução geral dessas importantes espécies.
Resumo (inglês)
Satellite DNAs (satDNAs), known for their significant roles in genome structuration and evolution, were characterized in eight Chrysopidae species using genomic and bioinformatic approaches. Additionally, the karyotype of Ceraeochrysa claveri was characterized in details, revealing the common constitution observed in Neuroptera, 2n=12,XY. For the group it is the first time that the heterochromatin distribution is described, with occurrence of pericentromeric blocks. The mapping of major ribosomal DNA (rDNA) was divergent from the other few neuropteran species studied, evidencing dynamism for this cluster in the group. Concerning the satellitomes, additionally for Ceraeochrysa claveri and Chrysopa pallens we mapped the satDNAs using chromosomal mapping through Fluorescence in situ Hybridization (FISH) and CHRISMAPP, respectively. The impact of satDNAs on the genome organization of neuropterans is variable, as distinct number of satDNAs were identified from a single satDNA to 23 satDNA families. Moreover, the total amount of satDNAs was also quite variable representing from about 2.5% to 21.55% of the genome. Interestingly, we observed a high turnover of the satDNA library between species, suggesting the frequent emergence and total elimination of repeats independently, contrary to the library hypothesis. The physical chromosome mapping of these repeats in C. claveri and C. pallens provided detailed insights into their genomic distribution, revealing accumulation of main satDNAs on euchromatin. Our data provide initial insights into the genome organization of satellite DNAs (satDNAs) among Neuropterans, contributing to our understanding of these repeats in insect genomes. These findings will aid future research on genome assembly and the overall evolution of these important species.
Descrição
Palavras-chave
Insetos genética, Genética animal, Ánalise de DNA, Citogenética, Controle biológico, Evolução, RepeatExplorer, DNA repetitivo, Biological control, Cytogenetics, Evolution, Repetitive DNA, Insect genetics, Animal genetics, DNA analysis
Idioma
Português
