Publicação:
Development of nuclear and plastid SNP and INDEL markers for population genetic studies and timber traceability of Carapa species

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Data

2019-09-15

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Resumo

Low coverage MiSeq genome sequencing and restriction associated DNA sequencing (RADseq) were used to identify nuclear and plastid SNP and INDEL genetic markers in Carapa guianensis. 261 genetic markers including 237 nuclear SNPs, 22 plastid SNPs, and 2 plastid INDELs are described based on 96 genotyped individuals from French Guiana, Brazil, Peru, and Bolivia. The best 117 SNPs for identifying population structure and performing individual assignment are assembled into four multiplexes for MassARRAY genotyping.

Descrição

Palavras-chave

Carapa guianensis, Carapa surinamensis, DNA-fingerprints, Geographical origin, MassARRAY, MiSeq, RADSeq, Tropical timber

Idioma

Inglês

Como citar

Conservation Genetics Resources, v. 11, n. 3, p. 337-339, 2019.

URI

http://hdl.handle.net/11449/187726

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