Publicação: Identificação e caracterização de RNAs não-codificantes longos (lncRNAs) envolvidos na formação de ossos intramusculares do tambaqui (Colossoma macropomum)
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Data
Autores
Orientador
Pinhal, Danillo 
Coorientador
Bovolenta, Luiz Augusto
Pós-graduação
Curso de graduação
Botucatu - IBB - Ciências Biológicas
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Trabalho de conclusão de curso
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
A produção e a qualidade dos alimentos produzidos, assim como a sustentabilidade ambiental e a crise humanitária atual são alguns dos desafios a serem transpostos nas próximas décadas e a aquicultura é um dos setores de produção de alimentos emergentes. No Brasil, a produção de peixes apresenta taxas de crescimento anuais e dentre as espécies produzidas, o tambaqui (Colossoma macropomum) constitui-se na espécie nativa mais cultivada e consumida, entretanto apresenta uma característica indesejável, que é a presença de espinhas, também denominadas ossos intermusculares. Em termos funcionais, falta consenso sobre o exato papel desempenhado desses ossos, além de diversas espécies serem naturalmente desprovidas, sem que haja quaisquer indícios de perda de funcionalidade. Embora existam estudos descrevendo os processos biológicos associados ao desenvolvimento do tambaqui, detalhes das vias moleculares acabam sendo não resolutivos a ponto de elucidar a via de formação dos ossos intermusculares e transcritos codificantes e não-codificantes reguladores chave atuantes, cuja modulação poderia levar à redução numérica ou mesmo à eliminação dos ossos intermusculares em peixes. O objetivo é a identificação e caracterização de RNA não-codificantes de cadeia longa potencialmente envolvidos no processo de formação de ossos intermusculares do Colossoma macroporum, que estejam diferencialmente expressos entre os grupos de interesse CY (com espinhas intermusculares) e SY (sem espinhas intermusculares). Amostras dos grupos de interesse foram coletadas e submetidas a sequenciamento de transcriptoma total (WTS). Em seguida, os dados foram processados com técnicas de bioinformática para a identificação dos transcritos, onde um total de 68 moléculas de lncRNA diferencialmente expressos foram identificadas, indicando que esses transcritos podem possuir um papel na formação das espinhas intermusculares do tambaqui. Foi possível caracterizar algumas das moléculas encontradas pela inferência de funções putativas por meio do mapeamento destas moléculas com o genoma anotado de Colossoma macropomum, onde encontramos potenciais alvos de regulação destas moléculas, como os genes vWA, COL6A3, pfam01391 e FN3, que possuem papéis importantes no desenvolvimento, diferenciação celular e formação de fibras de colágeno, funções associadas à formação de espinhas.
Descrição
Palavras-chave
Aquicultura, Biologia computacional, Genética
Idioma
Português
Como citar
Moreira, Arthur Gasparindo. Identificação e caracterização de RNAs não-codificadores longos (lncRNAs) envolvidos na formação de ossos intermusculares do tambaqui (Colossoma macropomum). Orientador(a): DanilloPinhal. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências de Botucatu, Univeridade Estadual Paulista (Unesp), Botucatu, 2023
