Caracterização epidemiológica e molecular de isolados de Mycobacterium tuberculosis da População Privada de Liberdade e Geral em dois grupos de vigilância epidemiológica do Estado de São Paulo

Abstract

A tuberculose (TB) permanece como um grave problema de saúde pública em todo o mundo, afetando principalmente populações vulneráveis, como a População Privada de Liberdade (PPL). As técnicas de genotipagem, como o MIRU-VNTR e Regiões de Diferença (RD), possibilitam a diferenciação dos isolados de Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis), auxiliando na vigilância epidemiológica e controle da TB. Neste sentido, o objetivo deste estudo foi investigar as relações entre o perfil molecular dos isolados de M. tuberculosis da PPL e da População Geral (PG), e características sociodemográficas, epidemiológicas e clínicas no território dos Grupos de Vigilância Epidemiológica (GVE) XV de Bauru e XXIX de São José do Rio Preto. Ao todo 552 isolados foram avaliados. Foram identificados 351 (67,2%) casos em indivíduos da PG e 171 (32,8%) em indivíduos da PPL. As variáveis de maior proporção para os dois GVE e tipos de população foram sexo masculino, escolaridade de 4 a 7 anos, forma pulmonar e baciloscopia e cultura positivas. A maioria dos casos foram novos, descobertos por demanda ambulatorial e tiveram cura como desfecho. A taxa de clusterização para o painel de 24 loci MIRU-VNTR foi de 12,8% e para 15 loci foi de 14,7%, com a formação de 48 e 52 clusters, respectivamente. Para ambos os GVE, as análises de UPGMA e MST demonstraram fortes relações de similaridade e parentesco entre os isolados, independente do GVE que pertenciam e tipo de população. Foi encontrada uma associação entre isolados em cluster e a investigação de contatos (p = 0,004), e na análise espacial foi observada o compartilhamento de isolados em cluster em diferentes municípios e unidades prisionais. Os isolados da sublinhagem RDRio estiveram associados ao etilismo [OR: 1,84 (1,17 – 2,88)] e analfabetismo [OR: 3,40 (1,09 – 10,58)]. Estes resultados reforçam a relevância da caracterização epidemiológica regionalizada e do uso de técnicas de genotipagem e georreferenciamento para entendimento da transmissão do M. tuberculosis e bem como auxiliar na formulação de estratégias de vigilância e controle particularizadas.

Tuberculosis (TB) remains a major public health problem worldwide, affecting primarily vulnerable populations, such as the incarcerated population. Genotyping techniques, such as MIRU-VNTR and Regions of Difference (RD), enable the differentiation of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) isolates, assisting in epidemiological surveillance and TB control. In this sense, the objective of this study was to investigate the relationship between the molecular profile of M. tuberculosis isolates from the PPL and the General Population (GP), and sociodemographic, epidemiological, and clinical characteristics in the territory of Epidemiological Surveillance Groups (ESG) XV of Bauru and XXIX of São José do Rio Preto. A total of 552 isolates were evaluated, 351 (67.2%) in individuals of GP and 171 (32.8%) in individuals from the PPL. The highest proportions, to both GP and PPL populations, were found in the variables male sex, 4 to 7 years of schooling, pulmonary form, and positive smear microscopy and culture. Most cases were classified as new, discovered through outpatient demand, and had cure as the outcome. The clustering rate for the 24 loci MIRU-VNTR panel was 12.8%, and for 15 loci was 14.7%, with the formation of 48 and 52 clusters, respectively. For both ESG, UPGMA and MST analyses demonstrated strong similarity between isolates, regardless of the ESG to which they belonged and the type of population. An association was found between clustered isolates and contact investigation (p = 0.004), and spatial analysis showed that there was sharing of clustered isolates in different municipalities and prison units. Isolates from the RDRio sublineage were associated with alcoholism [OR: 1.84 (1.17–2.88)], and illiteracy [OR: 3.40 (1.09 – 10.58)]. These results reinforce the relevance of regionalized epidemiological characterization and the use of genotyping and georeferencing techniques to understand the transmission of M. tuberculosis and assist in the formulation of particularized surveillance and control strategies.