Mapeamento de QTLs associados ao acamamento em milho

Abstract

O acamamento do milho tornou-se um dos principais problemas da cultura. Devido às limitações de seleção fenotípica, a seleção genômica pode ser uma alternativa para a seleção de linhagens resistentes. No presente trabalho, o método GWAS foi usado para detectar marcadores associados a locos de características quantitativas (QTL) com base na análise de desequilíbrio de ligação (DL). Para a condução do experimento foram utilizadas 1.109 linhagens endogâmicas. A avaliação de acamamento foi realizada aos 200 dias após o plantio, quantificando-se as plantas com colmos danificados e acamadas. Foram identificadas quatro regiões genômicas que explicam 24,5% da variação observada no acamamento das plantas. Também foram identificados os genes presentes nessas regiões. No cromossomo 9, o gene LOC103637828 da família de genes da miosina (superfamília ATPase. Família da miosina) e o gene LOC100502428 do gene putativo da família de proteínas do domínio da ferroportina. No cromossomo 4, o gene LOC103654305, da família GDA1/CD39 NTPase [putative apyrase locali protein (provável apyrase 3)] e o gene LOC100191644 da família de genes produtores de poliadenilatos (polyadenilate-binding protein-interacting protein 9). Os resultados obtidos neste trabalho permitem a criação de uma estratégia de seleção assistida por marcadores moleculares em programas de melhoramento genético, utilizando os QTLs identificados.

Corn lodging has become one of the main problems of the crop. Due to limitations of phenotypic selection, genomic selection can be an alternative for selection of resistant inbreed lines. In the present work, the GWAS method was used to detect markers associated with quantitative trait loci (QTL) based on linkage disequilibrium (DL) analysis. To conduct the experiment, 1,109 inbred lines were used. The lodging evaluation was carried out 200 days after planting, quantifying the plants with damaged and lodging stems. Four genomic regions were identified that explain 24.5% of the observed variation in plant lodging. The genes present in these regions were also identified. On chromosome 9, the LOC103637828 gene of the myosin gene family (ATPase superfamily. Myosin family) and the LOC100502428 gene of the putative gene of the ferroportin domain protein family. On chromosome 4, the LOC103654305 gene, from the GDA1/CD39 NTPase family [putative apyrase locali protein (probable apyrase 3)] and the LOC100191644 gene from the polyadenylatebinding protein-interacting protein 9 family of genes. The results obtained in this work allow the creation of a selection strategy assisted by molecular markers in genetic improvement programs, using the identified QTLs.