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The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector

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dc.contributor.authorMarinotti, Osvaldo
dc.contributor.authorCerqueira, Gustavo C.
dc.contributor.authorAlmeida, Luiz Gonzaga Paula de
dc.contributor.authorFerro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
dc.contributor.authorLoreto, Elgion Lucio da Silva
dc.contributor.authorZaha, Arnaldo
dc.contributor.authorTeixeira, Santuza M. R.
dc.contributor.authorWespiser, Adam R.
dc.contributor.authorSilva, Alexandre Almeida E.
dc.contributor.authorSchlindwein, Aline Daiane
dc.contributor.authorPacheco, Ana Carolina Landim
dc.contributor.authorSilva, Artur Luiz da Costa da
dc.contributor.authorGraveley, Brenton R.
dc.contributor.authorWalenz, Brian P.
dc.contributor.authorLima, Bruna de Araújo
dc.contributor.authorRibeiro, Carlos Alexandre Gomes
dc.contributor.authorNunes-Silva, Carlos Gustavo
dc.contributor.authorCarvalho, Carlos Roberto de
dc.contributor.authorSoares, Célia Maria de Almeida
dc.contributor.authorMenezes, Claudia Beatriz Afonso de
dc.contributor.authorMatiolli, Cleverson
dc.contributor.authorCaffrey, Daniel
dc.contributor.authorAraújo, Demetrius Antonio M.
dc.contributor.authorOliveira, Diana Magalhães de
dc.contributor.authorGolenbock, Douglas
dc.contributor.authorGrisard, Edmundo Carlos
dc.contributor.authorFantinatti-Garboggini, Fabiana
dc.contributor.authorCarvalho, Fabíola Marques de
dc.contributor.authorBarcellos, Fernando Gomes
dc.contributor.authorProsdocimi, Francisco
dc.contributor.authorMay, Gemma
dc.contributor.authorAzevedo Junior, Gilson Martins de
dc.contributor.authorGuimarães, Giselle Moura
dc.contributor.authorGoldman, Gustavo Henrique
dc.contributor.authorPadilha, Itácio Q. M.
dc.contributor.authorBatista, Jacqueline da Silva
dc.contributor.authorFerro, Jesus Aparecido [UNESP]
dc.contributor.authorRibeiro, José M. C.
dc.contributor.authorFietto, Juliana Lopes Rangel
dc.contributor.authorDabbas, Karina Maia [UNESP]
dc.contributor.authorCerdeira, Louise
dc.contributor.authorAgnez-Lima, Lucymara Fassarella
dc.contributor.authorBrocchi, Marcelo
dc.contributor.authorCarvalho, Marcos Oliveira de
dc.contributor.authorMelo Teixeira, Marcus de
dc.contributor.authorMascena Diniz Maia, Maria de
dc.contributor.authorGoldman, Maria Helena S.
dc.contributor.authorSchneider, Maria Paula Cruz
dc.contributor.authorFelipe, Maria Sueli Soares
dc.contributor.authorHungria, Mariangela
dc.contributor.authorNicolás, Marisa Fabiana
dc.contributor.authorPereira, Maristela
dc.contributor.authorMontes, Martín Alejandro
dc.contributor.authorCantão, Maurício E.
dc.contributor.authorVincentz, Michel
dc.contributor.authorRafael, Miriam Silva
dc.contributor.authorSilverman, Neal
dc.contributor.authorStoco, Patrícia Hermes
dc.contributor.authorSouza, Rangel Celso
dc.contributor.authorVicentini, Renato
dc.contributor.authorGazzinelli, Ricardo Tostes
dc.contributor.authorOliveira Neves, Rogério de
dc.contributor.authorSilva, Rosane
dc.contributor.authorAstolfi-Filho, Spartaco
dc.contributor.authorMaciel, Talles Eduardo Ferreira
dc.contributor.authorÜrményi, Turàn P.
dc.contributor.authorTadei, Wanderli Pedro
dc.contributor.authorCamargo, Erney Plessmann
dc.contributor.authorVasconcelos, Ana Tereza Ribeiro de
dc.contributor.institutionUniversity of California Irvine
dc.contributor.institutionBroad Institute of Harvard and Massachusetts
dc.contributor.institutionLaboratório Nacional de Computação Científica
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Santa Maria (UFSM)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
dc.contributor.institutionUniversity of Massachusetts
dc.contributor.institutionFundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual do Ceará (UECE)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Piauí (UFPI)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Pará (UFPA)
dc.contributor.institutionUniversity of Connecticut Health Center
dc.contributor.institutionJ. Craig Venter Institute
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Viçosa (UFV)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Amazonas (UFAM)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Goiás (UFG)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal da Paraíba (UFPB)
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Londrina (UEL)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
dc.contributor.institutionInstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)
dc.contributor.institutionLaboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE)
dc.contributor.institutionUniversidade de São Paulo (USP)
dc.contributor.institutionNational Institutes of Health (NIH)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
dc.contributor.institutionUniversidade de Brasília (UnB)
dc.contributor.institutionUniversidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
dc.contributor.institutionUniversidade Católica de Brasília (UCB)
dc.contributor.institutionEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
dc.date.accessioned2014-05-27T11:30:06Z
dc.date.available2014-05-27T11:30:06Z
dc.date.issued2013-08-01
dc.description.abstractAnopheles darlingi is the principal neotropical malaria vector, responsible for more than a million cases of malaria per year on the American continent. Anopheles darlingi diverged from the African and Asian malaria vectors ∼100 million years ago (mya) and successfully adapted to the New World environment. Here we present an annotated reference A. darlingi genome, sequenced from a wild population of males and females collected in the Brazilian Amazon. A total of 10 481 predicted protein-coding genes were annotated, 72% of which have their closest counterpart in Anopheles gambiae and 21% have highest similarity with other mosquito species. In spite of a long period of divergent evolution, conserved gene synteny was observed between A. darlingi and A. gambiae. More than 10 million single nucleotide polymorphisms and short indels with potential use as genetic markers were identified. Transposable elements correspond to 2.3% of the A. darlingi genome. Genes associated with hematophagy, immunity and insecticide resistance, directly involved in vectorhuman and vectorparasite interactions, were identified and discussed. This study represents the first effort to sequence the genome of a neotropical malaria vector, and opens a new window through which we can contemplate the evolutionary history of anopheline mosquitoes. It also provides valuable information that may lead to novel strategies to reduce malaria transmission on the South American continent. The A. darlingi genome is accessible at www.labinfo.lncc.br/index.php/anopheles- darlingi. © 2013 The Author(s).en
dc.description.affiliationDepartment of Molecular Biology and Biochemistry University of California Irvine, Irvine, CA 92697
dc.description.affiliationInstitute of Technology Broad Institute of Harvard and Massachusetts, Cambridge, MA 02141
dc.description.affiliationLaboratório de Bioinformática Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ 25651-075
dc.description.affiliationDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal UNESP - Universidade Estadual, Paulista, SP 14884-900
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria, RS 97105-900
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Molecular e Biotecnologia Centro de Biotecnologia Universidade Federal Do Rio Grande Do sul, Porto Alegre, RS 91501-970
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Imunologia Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270901
dc.description.affiliationDepartment of Medicine University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655
dc.description.affiliationLaboratório de Entomologia Médica IPEPATRO FIOCRUZ, Porto Velho, RO 76812-245
dc.description.affiliationDepartamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis, SC 88040-900
dc.description.affiliationCentro de Ciências da Saúde Universidade Estadual Do Ceará, Fortaleza, CE 62042-280
dc.description.affiliationDepartamento de Ciências Biológicas Campus Senador Helvídio Nunes de Barros Universidade Federal Do Piauí, Picos, PI 60740-000
dc.description.affiliationDepartamento de Genética Instituto de Ciências Biológicas Universidade Federal Do Pará, Belém, PA 66075-900
dc.description.affiliationDepartment of Genetics and Developmental Biology University of Connecticut Health Center, Farmington, CT 06030
dc.description.affiliationInformatics J. Craig Venter Institute, Medical Center Drive, Rockville, MD 20850
dc.description.affiliationDepartamento de Genética, Evolução e Bioagentes Instituto de Biologia Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-862
dc.description.affiliationDepartamento de Genética e Melhoramento Universidade Federal de Viçosa, MG 36570-000
dc.description.affiliationCentro de Apoio Multidisciplinar Universidade Federal Do Amazonas, Manaus, AM 69077-000
dc.description.affiliationDepartamento Biologia Geral Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG 36571-000
dc.description.affiliationLaboratório de Biologia Molecular Instituto de Ciências Biológicas Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO 74001-970
dc.description.affiliationDivisão de Recursos Microbianos Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas Universidade Estadual de Campinas, Paulinia, SP 13140-000
dc.description.affiliationCentro de Biologia Molecular e Engenharia Genética Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-875
dc.description.affiliationDepartamento de Biotecnologia Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, PB 58051-900
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Geral Universidade Estadual de Londrina, Londrina, PR 86055-990
dc.description.affiliationInstituto de Bioquímica Médica Universidade Federal Do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ 21941-902
dc.description.affiliationPrograma de Pósgraduac ̧ão em Genética Conservação e Biologia Evolutiva Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, AM 69067-375
dc.description.affiliationLaboratório Nacional de Ciência e Tecnologia Do Bioetanol CTBe, Campinas, São Paulo, SP 13083-970
dc.description.affiliationDepartamento de Ciências Farmacêuticas Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP 14040-903
dc.description.affiliationCoordenação de Biodiversidade Laboratório Temático de Biologia Molecular Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, AM 69060-001
dc.description.affiliationLaboratory of Malaria and Vector Research NIAID NIH, Bethesda, MD 20817
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Biologia Molecular Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG 36570-000
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Celular e Genética Universidade Federal Do Rio Grande Do Norte, Natal, RN 59072-970
dc.description.affiliationPrograma de Pós-Graduação de Genética e Biologia Molecular Instituto de Biociências Universidade Federal Do Rio Grande Do sul, Porto Alegre, RS 90150-197
dc.description.affiliationInstituto de Ciências Biológicas Departamento de Biologia Celular Universidade de Brasília, Brasília, DF 70910-900
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, PE 50740-520
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP 14040-901
dc.description.affiliationInstituto de Ciências Biológicas Universidade Federal Do Pará, Belém, PA 66075-970
dc.description.affiliationPrograma de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF 70790-160
dc.description.affiliationEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária Soja, Londrina, PR 86001-970
dc.description.affiliationEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária CNPSA, Concórdia, SC 89700-000
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Vegetal Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-970
dc.description.affiliationLaboratório de Vetores da Malária e Dengue Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia, Manaus, AM 69067-375
dc.description.affiliationLaboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-875
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Imunologia Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901
dc.description.affiliationInstituto de Biofísica Carlos Chagas Filho Universidade Federal Do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ 21941-902
dc.description.affiliationDepartamento de Parasitologia Instituto de Ciências Biomédicas Universidade de São Paulo, São Paulo, SP 05508-000
dc.description.affiliationUnespDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal UNESP - Universidade Estadual, Paulista, SP 14884-900
dc.description.sponsorshipNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
dc.description.sponsorshipNational Institutes of Health
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)
dc.format.extent7387-7400
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt484
dc.identifier.citationNucleic Acids Research, v. 41, n. 15, p. 7387-7400, 2013.
dc.identifier.doi10.1093/nar/gkt484
dc.identifier.issn0305-1048
dc.identifier.issn1362-4962
dc.identifier.lattes0147241723612464
dc.identifier.lattes7587208482384059
dc.identifier.scopus2-s2.0-84883471432
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/76152
dc.identifier.wosWOS:000323970700025
dc.language.isoeng
dc.relation.ispartofNucleic Acids Research
dc.relation.ispartofjcr11.561
dc.relation.ispartofsjr9,025
dc.relation.ispartofsjr9,025
dc.rights.accessRightsAcesso restrito
dc.sourceScopus
dc.subjectAnopheles
dc.subjectAnopheles darlingi
dc.subjectAnopheles gambiae
dc.subjectcircadian rhythm
dc.subjectfemale
dc.subjectgene identification
dc.subjectgene sequence
dc.subjectgenetic conservation
dc.subjectgenetic marker
dc.subjectgenome analysis
dc.subjectgenome size
dc.subjectindel mutation
dc.subjectinsect genetics
dc.subjectinsecticide resistance
dc.subjectmale
dc.subjectnonhuman
dc.subjectpriority journal
dc.subjectsequence homology
dc.subjectsingle nucleotide polymorphism
dc.subjectsynteny
dc.subjecttransposon
dc.subjectxenobiotic metabolism
dc.titleThe Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vectoren
dc.typeArtigo
dcterms.licensehttp://www.oxfordjournals.org/access_purchase/self-archiving_policyb.html
dspace.entity.typePublication
unesp.advisor.lattes7587208482384059
unesp.author.lattes0147241723612464
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabalpt
unesp.departmentTecnologia - FCAVpt

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