Micobioma associado a amostras de solos do centro-oeste paulista mediante Sequenciamento de Nova-Geração (NGS)

Abstract

O reino fungi é constituído por amplos grupos de organismos com reconhecida importância ecológica, industrial ou médica. O solo é um importante reservatório para microrganismos, especialmente fungos, que atuam na decomposição e reciclagem de nutrientes ou se associam com animais e plantas em relações simbióticas ou causando patogenias. Ainda são poucos os estudos relacionados a estrutura do micobioma, sendo rasa a compreensão da diversidade e ecologia de fungos. A compreensão dos padrões de distribuição da diversidade fúngica é essencial para mensurar as mudanças naturais e antrópicas relacionadas a estas comunidades, tal como entender a ecologia e epidemiologia dos fungos considerados patogênicos. Neste trabalho caracterizamos a diversidade fúngica das amostras de solo em diferentes ambientes no município de Botucatu (Brasil), descrevendo a estrutura da comunidade fúngica e mensurando a prevalência dos fungos patogênicos, mediante a técnica de Sequenciamento de Nova Geração (NGS). No sequenciamento mediante plataforma Illumina, analisamos 44 amostras provenientes de 8 ambientes diferentes, em dois períodos (outono e primavera), incluindo tocas de tatus, corujas e outros ambientes relacionados. A riqueza e diversidade variaram entre os ambientes, sendo favorecido nas amostras ambientais da floresta sazonal semidecidual e das tocas de tatus, os quais possuem uma maior cobertura vegetal. Ainda, ambientes mais antropizados, com menores efeitos de cobertura vegetal, como edifício abandonado e toca de coruja, proporcionaram as menores diversidades, apesar de favorecer crescimento de alguns fungos patogênicos. Os fungos patogênicos dimórficos, quando comparada com os fungos oportunistas, foram encontrados em baixas frequências, como foi o caso de Paracoccidioides spp., endêmico da região, que foi encontrado em diversos ambientes em baixa abundância. A estrutura da comunidade se mostrou mais similar nas amostras coletadas no mesmo ambiente, com fatores ambientais semelhantes. A pesquisa evidenciou a influência do ambiente nas comunidades fúngicas, mesmo em locais geograficamente próximos.