Estudos sobre flexibilidade macromolecular de proteínas em solução
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Data
2023-01-09
Autores
Orientador
Neto, Mario de Oliveira 
Coorientador
Pós-graduação
Curso de graduação
Física Médica - IBB
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Trabalho de conclusão de curso
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
Neste trabalho é utilizado a estrutura molecular do vírus Chikungunya, mais precisamente a proteína não estrutural 2 (CHIKV nsP2), uma proteína multifuncional essencial para a replicação viral do vírus Chikungunya, como modelo para o uso da técnica de espalhamento de raios-X a baixo ângulo (SAXS) e para melhor entendimento de como o pacote de análise ATSAS pode impactar em uma análise sobre flexibilidade macromolecular. A CHIKV nsp2 possui uma região flexível em sua estrutura molecular, caracterizando funções específicas muito importantes, proporcionando adequação e conformação estrutural em determinadas situações de ligação e formação de complexos. Utilizando a ferramenta BUNCH reconstruiu-se a estrutura da solução de nsP2 com base nas estruturas cristalinas de nsP2h e nsP2p. O método de otimização de conjuntos (ensemble optimization method - EOM) permitiu a formulação de possíveis modelos estruturais da CHIKV nsp2 coerentes com a sequência de aminoácidos de suas regiões flexíveis e desordenadas, remetendo a uma previsão confiável do comportamento desses componentes em solução, atuando em suas funções específicas, possibilitando um estudo adequado e completo das características que conduzem seu rendimento funcional.
Descrição
Palavras-chave
Idioma
Português
