Uso de redes neurais artificiais para extração de dados de prontuários médicos
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Data
2021-07-16
Autores
Orientador
Silveira, Liciana Vaz de Arruda 
Corrente, José Eduardo
Coorientador
Pós-graduação
Biometria - IBB
Curso de graduação
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Dissertação de mestrado
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
Diversos estudos recentes têm utilizado inteligência artificial na extração e tratamento de dados secundários na área da saúde, obtidos em prontuários eletrônicos hospitalares. No entanto, alguns estudos são inviáveis devido a informações incompletas ou inseridas apenas em campos narrativos. O objetivo deste trabalho é desenvolver uma rede neural que utilize os dados desses campos para obter informações estruturadas referentes aos sintomas, diagnósticos, medicamentos, condições, exames e tratamentos. A rede neural proposta facilitará a descoberta de relações entre doenças e sintomas, prevalências e incidências, a identificação de condições clínicas, a evolução de enfermidades e os efeitos das medicações prescritas. O algoritmo utiliza métodos de processamento de linguagem natural para extração de textos e redes neurais convolucionais para reconhecimento de padrões. Foram simulados diferentes valores e funções para a determinação dos hiperparâmetros e otimizadores mais adequados para o modelo de Reconhecimento de Entidades Nomeadas (NER) desenvolvido através da biblioteca spaCy em Python. Para uma análise exploratória dos dados extraídos e demonstração da aplicabilidade do modelo foram executadas técnicas da estatística multivariada de análise de agrupamento, obtendo quatro grupos que melhor representam os perfis dos pacientes e os medicamentos por eles utilizados. Os resultados obtidos foram significativos considerando a complexidade do modelo, com um F-Score de 63,9% e Precision de 72,7%. A classe Condição do Paciente chegou a atingir 90,3% de Precision, seguido por Medicação com 87,5%. No desenvolvimento do presente trabalho, foram utilizados dados de 30.000 prontuários de pacientes do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu/SP - Brasil (HCFMB), gerando um corpus com 1.200 textos clínicos. A utilização de NER em dados clínicos se mostrou uma ferramenta capaz de extrair informações que não existem em campos estruturados de prontuários médicos. Além disso, análises de agrupamento utilizando esses dados revelam comportamentos e características até então desconhecidas, relacionadas com as Entidades extraídas.
Descrição
Palavras-chave
Idioma
Português