Molecular survey and characterization of selected viruses in wild Brazilian felids

Abstract

O presente estudo objetivou pesquisar a presença de astrovírus, cardiovírus e rotavírus em felídeos não domésticos, mantidos sob cuidados humanos ou em vida livre, em múltiplos biomas brasileiros, incluindo Amazônia, Cerrado, Caatinga, Mata Atlântica e zonas de transição. Os vírus selecionados são amplamente distribuídos em humanos e mamíferos domésticos, com infecções sintomáticas ou não. São agentes altamente resistentes às condições ambientais, com potencial zoonótico, e que já foram previamente associados a mortalidades e surtos. Para pesquisa desses vírus, instituições foram contatadas para fornecimento de amostras biológicas (e.g., sangue total, swab oral, swab retal, tecidos), as quais foram congeladas a -80ºC até a extração do RNA. A detecção de astrovírus foi realizada via transcriptase reversa seguida de reação em cadeia polimerase (RT-PCR), com posterior sequenciamento genético. Cardiovírus e rotavírus foram ambos testados em RT-PCR em tempo real, também seguidos de sequenciamento genético. De todos os 50 animais avaliados, apenas um gato do mato pequeno do sul (L. guttulus) mantido sob cuidados humanos foi positivo para astrovírus, enquanto uma suçuarana (P. concolor) de vida livre atropelada foi positiva para Rotavirus A. Nenhum animal foi positivo para cardiovírus. Análises morfológicas de tecidos fixados em formalina foram realizadas para avaliar possíveis lesões decorrentes da infecção viral por rotavírus, com resultados inconclusivos devido à autólise do material. Considerando o caráter zoonótico dos vírus selecionados para estudo, os resultados deste trabalho, além de contribuírem para saúde pública no escopo de Saúde Única, auxiliarão na melhor compreensão das infecções virais que podem acometer felídeos selvagens.

The aim of this study was to investigate the presence of astrovirus, cardiovirus and rotavirus in non-domestic felids under human care or in the wild in multiple Brazilian biomes, including Amazon Forest, Atlantic Forest, Caatinga, Cerrado and its transition zones. The selected viruses are widely distributed in humans and domestic mammals, whether with clinical manifestation or not. They are highly resistant to environmental conditions, may have zoonotic potential and have already been associated with fatal outbreaks. To survey these viruses, institutions were contacted to supply biological samples (e.g., blood, oral swabs, rectal swabs, and tissues) which were frozen at -80ºC until RNA extraction. Astrovirus detection was performed via reverse transcriptase followed by polymerase chain reaction (RT-PCR), with subsequent genetic sequencing. Cardiovirus and rotavirus were both tested using real time RT-PCR, also followed by genetic sequencing. Of all 50 analyzed felids, one captive southern tiger cat (L. guttulus) tested positive for astrovirus while one roadkill cougar (P. concolor) tested positive for Rotavirus A. All felids were negative for cardiovirus. Morphological analyses of available formalin-fixed tissues of the rotavirus PCR-positive case were conducted to search for possible lesions caused by the virus, but results were inconclusive due to the autolysis. Considering the zoonotic nature of these viruses, the results of this work add to the current knowledge on viruses circulating in non-domestic felids in Brazil, which can contribute to public health within the scope of One Health and help to better elucidate viral infections that can affect wild felids.