Os elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos?
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Data
2017-02-23
Autores
Orientador
Carareto, Claudia Marcia Aparecida 
Coorientador
Pós-graduação
Genética - IBILCE
Curso de graduação
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Tipo
Dissertação de mestrado
Direito de acesso
Acesso aberto
Resumo
Este estudo teve por objetivo investigar se os retrotransposons sem LTRs (NLTRs) Helena e BS estiveram envolvidos em eventos de transferência horizontal (HT) durante a diversificação concomitante pela qual passaram as espécies do subgrupo melanogaster, do grupo melanogaster de Drosophila, e do subgênero Zaprionus, na África Tropical. O modo de transposição dos elementos NLTRs, sem a formação de um DNA intermediário, é utilizado para explicar a escassez de relatos de HT desse tipo de elemento. Estudos anteriores evidenciaram alta taxa de HT de retrotransposons com LTRs em espécies dos dois grupos citados, o que fundamentou a hipótese que essas espécies passaram por uma fase permissiva à ocorrência de HT em decorrência da sobreposição geográfica e temporal que sofreram durante sua diversificação. Para testar essa hipótese, uma região do gene da transcriptase reversa dos retrotransposons sem LTRs Helena e BS foi utilizada para investigar a ocorrência de HT entre as espécies. As sequências foram obtidas de linhagens de Zaprionus, via sequenciamento, após amplificação e clonagem, e via análises in silico nos genomas de Drosophila disponíveis nos bancos de dados, ou via sequenciamento de genomas de espécies de Drosophila e de Zaprionus. Foram realizadas análises evolutivas (análises de divergência e estimativa dos tempos de divergência entre as sequências) e filogenéticas (inferência bayesiana e verossimilhança máxima), bem como análises de network para estimar as relações de parentesco entre as sequências e, assim, testar a hipótese de HT. Os resultados mostraram que existe (i) distribuição irregular dos dois elementos nos gêneros Zaprionus e Drosophila, (ii) alta similaridade entre as sequências das espécies do complexo melanogaster e do subgênero Zaprionus, (iii) incongruências entre as filogenias dos elementos e das espécies hospedeiras, e (iv) tempos de divergência entre as sequências dos dois elementos de espécies do subgênero Zaprionus e do complexo melanogaster inferiores aos tempos de divergência das espécies. Esses resultados fundamentam a hipótese de ocorrência de transferência dos retrotransposons NLTRs Helena e BS entre as espécies do complexo melanogaster de Drosophila e do subgênero Zaprionus, durante a diversificação concomitante das espécies na África Tropical, no período do Mioceno Tardio.
Descrição
Palavras-chave
Idioma
Português