Os elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos?
dc.contributor.advisor | Carareto, Claudia Marcia Aparecida [UNESP] | |
dc.contributor.author | Simão, Maryanna Cristiano [UNESP] | |
dc.contributor.institution | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | |
dc.date.accessioned | 2017-03-16T18:54:00Z | |
dc.date.available | 2017-03-16T18:54:00Z | |
dc.date.issued | 2017-02-23 | |
dc.description.abstract | Este estudo teve por objetivo investigar se os retrotransposons sem LTRs (NLTRs) Helena e BS estiveram envolvidos em eventos de transferência horizontal (HT) durante a diversificação concomitante pela qual passaram as espécies do subgrupo melanogaster, do grupo melanogaster de Drosophila, e do subgênero Zaprionus, na África Tropical. O modo de transposição dos elementos NLTRs, sem a formação de um DNA intermediário, é utilizado para explicar a escassez de relatos de HT desse tipo de elemento. Estudos anteriores evidenciaram alta taxa de HT de retrotransposons com LTRs em espécies dos dois grupos citados, o que fundamentou a hipótese que essas espécies passaram por uma fase permissiva à ocorrência de HT em decorrência da sobreposição geográfica e temporal que sofreram durante sua diversificação. Para testar essa hipótese, uma região do gene da transcriptase reversa dos retrotransposons sem LTRs Helena e BS foi utilizada para investigar a ocorrência de HT entre as espécies. As sequências foram obtidas de linhagens de Zaprionus, via sequenciamento, após amplificação e clonagem, e via análises in silico nos genomas de Drosophila disponíveis nos bancos de dados, ou via sequenciamento de genomas de espécies de Drosophila e de Zaprionus. Foram realizadas análises evolutivas (análises de divergência e estimativa dos tempos de divergência entre as sequências) e filogenéticas (inferência bayesiana e verossimilhança máxima), bem como análises de network para estimar as relações de parentesco entre as sequências e, assim, testar a hipótese de HT. Os resultados mostraram que existe (i) distribuição irregular dos dois elementos nos gêneros Zaprionus e Drosophila, (ii) alta similaridade entre as sequências das espécies do complexo melanogaster e do subgênero Zaprionus, (iii) incongruências entre as filogenias dos elementos e das espécies hospedeiras, e (iv) tempos de divergência entre as sequências dos dois elementos de espécies do subgênero Zaprionus e do complexo melanogaster inferiores aos tempos de divergência das espécies. Esses resultados fundamentam a hipótese de ocorrência de transferência dos retrotransposons NLTRs Helena e BS entre as espécies do complexo melanogaster de Drosophila e do subgênero Zaprionus, durante a diversificação concomitante das espécies na África Tropical, no período do Mioceno Tardio. | pt |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | |
dc.description.sponsorshipId | CNPq: 1530/2015-1 | |
dc.identifier.aleph | 000882055 | |
dc.identifier.capes | 33004153023P5 | |
dc.identifier.lattes | 3425772998319216 | |
dc.identifier.orcid | 0000-0002-0298-1354 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11449/149751 | |
dc.language.iso | por | |
dc.publisher | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | |
dc.rights.accessRights | Acesso aberto | |
dc.subject | Retrotransposons sem LTRs | pt |
dc.subject | LINEs | pt |
dc.subject | Transferência lateral | pt |
dc.subject | Zaprionus | pt |
dc.subject | Drosophila | pt |
dc.title | Os elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos? | pt |
dc.title.alternative | The transposable elements NLTRs BD and Helena are associated in horizontal transfer events in Drosophilidae | en |
dc.type | Dissertação de mestrado | |
unesp.advisor.lattes | 3425772998319216 | |
unesp.advisor.orcid | 0000-0002-0298-1354 | |
unesp.campus | Universidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Preto | pt |
unesp.embargo | 24 meses após a data da defesa | pt |
unesp.graduateProgram | Genética - IBILCE | pt |
unesp.knowledgeArea | Outra | pt |
unesp.researchArea | Evolução Molecular |
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