Os elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos?

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dc.contributor.advisorCarareto, Claudia Marcia Aparecida [UNESP]
dc.contributor.authorSimão, Maryanna Cristiano [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2017-03-16T18:54:00Z
dc.date.available2017-03-16T18:54:00Z
dc.date.issued2017-02-23
dc.description.abstractEste estudo teve por objetivo investigar se os retrotransposons sem LTRs (NLTRs) Helena e BS estiveram envolvidos em eventos de transferência horizontal (HT) durante a diversificação concomitante pela qual passaram as espécies do subgrupo melanogaster, do grupo melanogaster de Drosophila, e do subgênero Zaprionus, na África Tropical. O modo de transposição dos elementos NLTRs, sem a formação de um DNA intermediário, é utilizado para explicar a escassez de relatos de HT desse tipo de elemento. Estudos anteriores evidenciaram alta taxa de HT de retrotransposons com LTRs em espécies dos dois grupos citados, o que fundamentou a hipótese que essas espécies passaram por uma fase permissiva à ocorrência de HT em decorrência da sobreposição geográfica e temporal que sofreram durante sua diversificação. Para testar essa hipótese, uma região do gene da transcriptase reversa dos retrotransposons sem LTRs Helena e BS foi utilizada para investigar a ocorrência de HT entre as espécies. As sequências foram obtidas de linhagens de Zaprionus, via sequenciamento, após amplificação e clonagem, e via análises in silico nos genomas de Drosophila disponíveis nos bancos de dados, ou via sequenciamento de genomas de espécies de Drosophila e de Zaprionus. Foram realizadas análises evolutivas (análises de divergência e estimativa dos tempos de divergência entre as sequências) e filogenéticas (inferência bayesiana e verossimilhança máxima), bem como análises de network para estimar as relações de parentesco entre as sequências e, assim, testar a hipótese de HT. Os resultados mostraram que existe (i) distribuição irregular dos dois elementos nos gêneros Zaprionus e Drosophila, (ii) alta similaridade entre as sequências das espécies do complexo melanogaster e do subgênero Zaprionus, (iii) incongruências entre as filogenias dos elementos e das espécies hospedeiras, e (iv) tempos de divergência entre as sequências dos dois elementos de espécies do subgênero Zaprionus e do complexo melanogaster inferiores aos tempos de divergência das espécies. Esses resultados fundamentam a hipótese de ocorrência de transferência dos retrotransposons NLTRs Helena e BS entre as espécies do complexo melanogaster de Drosophila e do subgênero Zaprionus, durante a diversificação concomitante das espécies na África Tropical, no período do Mioceno Tardio.pt
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
dc.description.sponsorshipIdCNPq: 1530/2015-1
dc.identifier.aleph000882055
dc.identifier.capes33004153023P5
dc.identifier.lattes3425772998319216
dc.identifier.orcid0000-0002-0298-1354
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/149751
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.subjectRetrotransposons sem LTRspt
dc.subjectLINEspt
dc.subjectTransferência lateralpt
dc.subjectZaprionuspt
dc.subjectDrosophilapt
dc.titleOs elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos?pt
dc.title.alternativeThe transposable elements NLTRs BD and Helena are associated in horizontal transfer events in Drosophilidaeen
dc.typeDissertação de mestrado
unesp.advisor.lattes3425772998319216
unesp.advisor.orcid0000-0002-0298-1354
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Pretopt
unesp.embargo24 meses após a data da defesapt
unesp.graduateProgramGenética - IBILCEpt
unesp.knowledgeAreaOutrapt
unesp.researchAreaEvolução Molecular

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