Assinaturas de seleção na linhagem de trabalho de equinos da raça quarto de milha

dc.contributor.advisorChardulo, Luis Artur Loyola [UNESP]
dc.contributor.advisorCuri, Rogério Abdallah [UNESP]
dc.contributor.authorRincón Beltrán, Natalia Andrea [UNESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2015-03-03T11:52:25Z
dc.date.available2015-03-03T11:52:25Z
dc.date.issued2014-09-11
dc.description.abstractO objetivo desta pesquisa foi identificar, por meio da utilização e análise de painéis de genotipagem de SNPs de alta densidade e da aplicação das estatísticas homozigose relativa do haplótipo estendido (REHH), uma extensão da análise EHH, e índice de fixação (FST), regiões do genoma selecionadas na linhagem de trabalho da raça Quarto de Milha de forma divergente em relação à de corrida. Foram utilizados 188 cavalos de ambos os sexos, nascidos entre 1985 e 2009, registrados na Associação Brasileira de Criadores de Cavalo Quarto de Milha (ABQM), sendo 68 da linhagem de trabalho e 120 da de corrida. A partir de 36 regiões do genoma, consideradas assinaturas de seleção por ambas as estatísticas utilizadas, foi feita a anotação funcional de genes a fim de identificar aqueles que possam ter sido importantes ao longo do processo de formação da linhagem de trabalho. Quarenta e cinco genes foram identificados em processos biológicos relacionados aos sistemas muscular, esquelético, cardiovascular, respiratório e nervoso, neurotransmissão, metabolismo energético muscular, atividade motora, visão, audição, e função cognitiva. Os genes relacionados aos últimos quatro processos, merecem destaque pelo fato de que, em confluência, podem estar relacionados ao cow sense ou habilidade de apartação, característica de grande importância para a utilização do equino no manejo de bovinos de cortept
dc.description.abstractThe objective of this study was to identify genomic regions selected in cutting line of Quarter Horses divergently in relation to racing line using high-density SNP genotyping arrays and the relative extended haplotype homozygosity (REHH) test, an extension of EHH analysis, and the fixation index (FST) as statistical methods. A total of 188 horses of both sexes, born between 1985 and 2009 and registered with the Brazilian Association of Quarter Horse Breeders (ABQM), were used. Of these, 68 horses were from the cutting line and 120 from the racing line. On the basis of 36 genomic regions classified as selection signatures by the two statistical methods, functional annotation of genes was performed in order to identify those that might have been important during formation of the cutting line. Forty-five genes were found to be involved in biological processes related to the muscle, skeletal, cardiovascular, respiratory and nervous systems, neurotransmission, muscle energy metabolism, motor activity, vision, hearing, and cognitive function. The genes related to the last four processes are particularly interesting because these genes together may be involved in cow sense or cutting ability, an important characteristic for the management of beef cattleen
dc.format.extentvi, 59 p.
dc.identifier.aleph000811067
dc.identifier.capes33004102030P4
dc.identifier.citationRINCÓN BELTRÁN, Natalia Andrea. Assinaturas de seleção na linhagem de trabalho de equinos da raça quarto de milha. 2014. vi, 59 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, 2014.
dc.identifier.file000811067.pdf
dc.identifier.lattes9820754011277263
dc.identifier.lattes3514713413919126
dc.identifier.orcid0000-0001-6289-0406
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/115649
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.sourceAleph
dc.subjectEquinopt
dc.subjectPolimorfismo (Genetica)pt
dc.subjectNucleotídeospt
dc.subjectGenetica animalpt
dc.subjectGenespt
dc.subjectAnimal geneticspt
dc.titleAssinaturas de seleção na linhagem de trabalho de equinos da raça quarto de milhapt
dc.typeTese de doutorado
unesp.advisor.lattes9820754011277263
unesp.advisor.lattes3514713413919126[2]
unesp.advisor.orcid0000-0001-6289-0406[2]
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabalpt
unesp.graduateProgramGenética e Melhoramento Animal - FCAVpt
unesp.knowledgeAreaGenética e Melhoramento Animalpt
unesp.researchAreaGenética molecularpt

Arquivos

Pacote Original

Agora exibindo 1 - 1 de 1
Carregando...
Imagem de Miniatura
Nome:
000811067.pdf
Tamanho:
421.15 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format