Análise proteômica de células humanas in vitro expressando a oncoproteína LMP1 do vírus de Epstein-Barr (EBV)

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dc.contributor.advisorOliveira Neto, Mario de [UNESP]
dc.contributor.authorGandin, César A.
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.date.accessioned2023-07-19T13:31:00Z
dc.date.available2023-07-19T13:31:00Z
dc.date.issued2022-07-26
dc.description.abstractA espectrometria de massas (MS) apresenta um grande potencial para a análise de sistemas biológicos complexos. O desenvolvimento de novas tecnologias de ionização e detectores, transformaram a MS na robusta técnica que é hoje, podendo ser utilizada na detecção de biomarcadores, bem como fazer análises de dinâmicas temporais em diferentes contextos biológicos, inclusive em cenários que envolvem infecção e câncer. O termo câncer engloba centenas de doenças que apresentam diversas características epidemiológicas, biológicas e clínicas que envolvem o comprometimento de mecanismos homeostáticos, fundamentalmente expresso por exacerbação das taxas de proliferação celular e redução das taxas de morte celular. Variados são os fatores etiológicos da doença, destacando-se hábitos alimentares, tabagismo, além de um componente infeccioso. A infecção pelo vírus de Epstein-Barr (EBV) é digna de destaque devido à sua virtual onipresença e elevado potencial oncogênico. O EBV é um oncovírus que infecta mais de 90% da população mundial adulta e foi primeiramente identificado em células malignas de Linfoma de Burkitt. A infecção pelo vírus é atualmente associada a diversas neoplasias e a expressão de diversos produtos virais vêm sendo relacionada a seu potencial oncogênico. Nesse contexto, a proteína viral LMP1 vem sendo descrita como um dos principais fatores responsáveis por essa característica do EBV, pois confere um alto potencial tumorigênico às células que as expressam. Neste trabalho, células humanas HEK293 foram transientemente transfectadas para a expressão de LMP1 e após 72h as proteínas totais foram sequenciadas e quantificadas por MS. Análises de expressão diferencial revelaram 129 proteínas diferencialmente expressas na presença de LMP1, sendo 90 com Fold Change > 2. Análises funcionais das proteínas detectadas revelaram potenciais mecanismos de interação da LMP1 com a célula hospedeira mediante regulação positiva das proteínas rac1, p53, CDK1, ITGB1 e Arp2. A desregulação de tais proteínas podem ser fatores relevantes no processo de tumorigênese deflagrado pelo EBV.pt
dc.description.abstractMass spectrometry (MS) has great potential for the analysis of complex biological systems. The development of new ionization technologies and detectors have transformed MS into the robust technique it is today, and can be used in the detection of biomarkers, as well to perform analysis of temporal dynamics in different biological contexts, including in scenarios involving infection and cancer. The term cancer encompasses hundreds of diseases that present various epidemiological, biological and clinical characteristics involving the impairment of homeostatic mechanisms, fundamentally expressed by exacerbation of cell proliferation rates and reduction of cell death rates. There are several etiological factors of the disease, especially eating habits, smoking, in addition to an infectious component. Epstein-Barr virus (EBV) infection is noteworthy due to its virtual omnipresence and high oncogenic potential. EBV is an oncovirus that infects more than 90% of the adult world population and has been first identified in burkitt lymphoma malignant cells. Virus infection is currently associated with several neoplasms and the expression of several viral products has been related to its oncogenic potential. In this context, the viral protein LMP1 has been described as one of the main factors responsible for the oncogenic potential of EBV because it confers a high tumorigenic potential to cells expressing the protein. In this work, human cells HEK293 were transitively transfected for the expression of LMP1 and after 72h total proteins were sequenced and quantified by MS. Differential expression analysis revealed 129 differentially expressed proteins in the presence of LMP1, 90 with Fold Change > 2. Functional analyses of the detected proteins revealed potential mechanisms of interaction of LMP1 with the host cell by positive regulation of rac1, p53, CDK1, ITGB1 and Arp2 proteins. The deregulation of these proteins may be relevant factors in the tumorigenesis process triggered by EBV.pt
dc.identifier.capes33004064087P8
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11449/244646
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.rights.accessRightsAcesso aberto
dc.subjectEspectrometria de massapt
dc.subjectHerpesvirus humano 4pt
dc.subjectProteína Latente de Membrana 1pt
dc.subjectCarcinoma de nasofaringept
dc.subjectFator 2 Associado a Receptor de TNFpt
dc.subjectNeoplasias Nasofaríngeaspt
dc.titleAnálise proteômica de células humanas in vitro expressando a oncoproteína LMP1 do vírus de Epstein-Barr (EBV)pt
dc.title.alternativeProteomic analysis of human cells in vitro expressing the Epstein-Barr virus (EBV) oncoprotein LMP1pt
dc.typeDissertação de mestrado
unesp.campusUniversidade Estadual Paulista (Unesp), Instituto de Biociências, Botucatupt
unesp.embargoOnlinept
unesp.examinationboard.typeBanca públicapt
unesp.graduateProgramBiotecnologia - IBBpt
unesp.knowledgeAreaBiotecnologiapt
unesp.researchAreaBiologia Molecular e Biofísicapt

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