Gliomas and the homologous recombination DNA repair pathway: identification of genes correlated to tumorigenesis and tumor progression
dc.contributor.advisor | Valente, Valeria | |
dc.contributor.advisor | Cristofaro, Luis Fernando Macedo Di | |
dc.contributor.author | Codina, Diana Piazza | |
dc.contributor.institution | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | |
dc.date.accessioned | 2022-06-24T15:12:26Z | |
dc.date.available | 2022-06-24T15:12:26Z | |
dc.date.issued | 2022-05-19 | |
dc.description.abstract | ABSTRACT Homologous recombination (HR) is the most error-free repair pathway at human cells disposal. Disruption or dysregulation on HR machinery can have gruesome outcomes associated with genomic instability, such as tumorigenesis and adaptive tumor progression. Gliomas are CNS tumors histologically and molecularly classified by WHO. High-grade malignant gliomas, as GBM, have persistent poor prognosis, even after numerous research over the last decades. This is usually associated with therapy failure and recurrence shortly after surgical resection. In this study we aimed to find correlation between HR repair genes expression and glioma prognosis. Following the selection of HR repair related genes compiled through extensive review research on Google Scholar and Periódicos CAPES, CGGA was consulted and the mRNAseq_693 was used to analyze gene expression in glioma samples. Afterward, ROC curves were plotted to determine a threshold for low/high expression and Kaplan-Meier analysis presented hazard ratio and median survival data. Thirteen out of the 67 initial genes showed a hazard ratio above 2.5, twelve of which resulting in a decrease of over 75% in patient median survival, indicating a strong correlation between gene high expression and prognosis. This indicates that up regulated HR repair is closely related to cell survival and stablishes HR genes as possible biomarkers for glioma prognosis. | pt |
dc.description.abstract | RESUMO A Recombinação Homóloga (HR) é a via de reparo à disposição das células humanas que resulta em menos erros. A interrupção ou desregulação na maquinaria de HR pode ter resultados drásticos associados à instabilidade genômica, como tumorigênese e adaptação durante a progressão tumoral. Gliomas são tumores do SNC classificados histologicamente e molecularmente pela OMS. Gliomas malignos de alto grau, como GBM, mantêm prognóstico desfavorável renitente, mesmo após inúmeras pesquisas realizadas nas últimas décadas. Isso geralmente está associado à falha da terapia e recorrência logo após a ressecção cirúrgica. Neste estudo, objetivamos encontrar correlação entre a expressão dos genes de reparo por HR e o prognóstico de gliomas. Após a seleção dos genes relacionados ao reparo por HR, compilados por meio de extensa pesquisa de revisão no Google Scholar e Periódicos CAPES, o CGGA foi consultado e o mRNAseq_693 foi utilizado para analisar a expressão gênica em amostras de glioma. Posteriormente, as curvas ROC foram plotadas para determinar um limiar para expressão baixa/alta e a análise de Kaplan-Meier apresentou dados de taxa de risco e sobrevida mediana. Treze dentre os 67 genes iniciais mostraram uma taxa de risco acima de 2,5 e doze deles uma diminuição de mais de 75% na sobrevida mediana dos pacientes, indicando uma forte correlação entre a alta expressão do gene e o prognóstico. Isso indica que o reparo por HR quando superregulado está intimamente relacionado à sobrevivência celular e estabelece os genes da via de HR como possíveis biomarcadores para o prognóstico de gliomas. | pt |
dc.description.sponsorship | Não recebi financiamento | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11449/235315 | |
dc.language.iso | eng | |
dc.publisher | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | |
dc.rights.accessRights | Acesso restrito | |
dc.subject | Glioma | pt |
dc.subject | Homologous Recombination | pt |
dc.subject | Gene Expression | pt |
dc.subject | Prognosis | pt |
dc.subject | Recombinação Homóloga | pt |
dc.subject | Expressão Gênica | pt |
dc.subject | Prognóstico | pt |
dc.title | Gliomas and the homologous recombination DNA repair pathway: identification of genes correlated to tumorigenesis and tumor progression | pt |
dc.title.alternative | Gliomas e a via de reparo de DNA por recombinação homóloga: identificação de genes e correlação com tumorigênese e progressão tumoral | pt |
dc.type | Trabalho de conclusão de curso | pt |
unesp.campus | Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Araraquara | pt |
unesp.undergraduate | Farmácia - FCF | pt |
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